{drawCell} — пакет R и приложение Shiny для рисования клеточных структур
Вы преподаватель биологических наук, стремящийся привлечь учащихся интерактивностью, или студент, которому нужно рисовать и обозначать клетки? Вы исследователь, который хочет избавиться от утомительной визуализации данных? Для вас есть решение на языке R: drawCell! Этот инструмент представляет собой удобное и увлекательное решение как для преподавателей, так и для исследователей.
Исследователи тратят бессчетное количество часов на свою работу. Почему бы не сделать это исследование доступным для общественности? Узнайте, как разрабатывать доступные исследования с помощью R и Shiny.
TOC:
- Что такое {drawCell}?
- Как использовать {drawCell}?
Что такое {drawCell}?
{drawCell} — это простой пакет R, который создает интерактивные схемы ячеек, которые можно изменять одним нажатием кнопки. Он делает именно то, что следует из названия: рисует ячейки за вас.
Мы поговорили с ведущим разработчиком и создателем {drawCell} Альваро Санчесом, который пролил свет на внутренние части {drawCell}.
Откуда взялось вдохновение для пакета {drawCell}?
Альваро имеет опыт работы в области биоинформатики, и биология работала в этих областях. Когда он впервые увидел, как используются белки SwissBioPics, он решил, что может объединить эти API и создать что-то, что он сможет использовать. Это было объединением всего, что он изучил в R, и комбинацией его знаний в предметной области.
Как мы можем использовать и исследовать {drawCell}?
Улучшите свои публикации и презентации с помощью {drawCell}. Создавайте более быстрые визуальные эффекты и выделяйте определенные области, на которых вы хотите сосредоточиться. Привлекайте свою аудиторию с помощью более интерактивных инструментов, не увеличивая время и сложность вашей рабочей нагрузки.
Просто выберите ячейку, используя ее таксономический идентификатор или имя ячейки, и начните!
Хотите узнать о других примерах R и Shiny в вашей области? Ознакомьтесь с этими 7 примерами Dashboard из Life Sciences.
На кого может повлиять {drawCell}?
{drawCell} может повлиять на среду обучения и методы обмена знаниями. Его удобный дизайн позволяет любому легко использовать его преимущества. Независимо от того, являетесь ли вы учителем, исследователем, программистом, родителем или учеником, стремящимся улучшить свое понимание, {drawCell} — это универсальный инструмент. Благодаря функции plug-and-play и отсутствию ограничений {drawCell} может оказать значительное влияние на мир биологического образования.
Что вы планируете делать дальше с этим проектом R?
Когда была выпущена первая версия, сообщество поддержало ее и дало важные отзывы. Фактически, один из членов этого сообщества стал соавтором {drawCell}. Мы надеемся, что их постоянные отзывы помогут сформировать его развитие.
На данный момент будущее {drawCell} может предложить больше функций, таких как возможность программно добавлять свойства и цвета к белкам. Мы также надеемся добавить сравнение между ячейками.
Останется ли {drawCell} отдельным приложением или превратится во что-то другое?
На данный момент {drawCell} — это отдельное приложение и пакет. Мы открыты для расширения его возможностей и превращения его в набор пакетов, если это необходимо. Наша цель – удовлетворить потребности общества. Мы будем продолжать прислушиваться к отзывам и рассматривать новые функции, повышающие его эффективность для пользователей.
Хотите начать работать программистом на R? Ознакомьтесь с руководством Appsilon по началу карьеры R/Shiny Dev.
Как рисовать ячейки с помощью {drawCell}?
{drawCell} скоро (надеюсь) появится на Bioconductor, и его установка будет еще проще, чем сейчас. Но пока вы можете установить его с помощью пакета `remotes` в R.
remotes::install_github("svalvaro/drawCell")
После установки все, что вам нужно сделать, это использовать функцию `drawCell::drawCellShiny()`, чтобы быстро запустить приложение Shiny с нужным пользовательским интерфейсом.
Шаги для рисования ячейки с помощью {drawCell}
- Выберите ячейку из раскрывающегося списка или текстового поля
- Будет показана ячейка без каких-либо цветов
- Выберите определенные области в ячейке
- Выберите цвет с помощью палитры цветов
- Затем продолжайте выбирать области, которые вы хотите выделить и добавить цвета
- Экспорт с использованием выбранной вами опции
Как экспортировать сгенерированную ячейку из {drawCell}
- Скопируйте код : Это генерирует код для ячейки с использованием пакета {drawCell} . Это будет включать все ваши изменения и цвета, которые вы можете использовать в документе .Rmd, приложении Shiny и т. д.
- Загрузить в формате png : загружается предварительный просмотр ячейки в формате .png, который вы можете использовать в своих отчетах, презентациях и где-либо еще. Формат .png принимается!
Как развернуть приложение {drawCell}?
Вы также можете разместить свой собственный экземпляр drawCell с помощью Shinyapps.
io или Posit Connect. У нас есть учебник, показывающий 3 основных метода, которые большинство людей используют для публикации своих приложений Shiny.
рисунок клетки лука — Googlesuche0003
SUCOOPTIONEN
Bilder
ALLEAR ANZEIGEN
ALLE ANLEGEGEN
Научный рисунок, рисунок лука, биология — Pinterest
www.pinterest.com ›Исследование› Образование ›субъекты
Ncert. луковой шелухи и клеток щеки Цель Приготовить окрашенные временные препараты из луковой шелухи и клеток щек человека и зарегистрировать …
Ähnliche Fragen
Какова структура клетки луковицы?
Как нарисовать простую луковицу?
Какова цель эксперимента с луковицами?
Как рисовать луковицу легко/луковица рисовать легко — YouTube
www.youtube.com › смотреть
04.02.2022 · Как рисовать луковицу легко/луковица рисовать легко, это очень просто, рисуем подробный метод. ..
Dauer: 4:17
Прислан: 04.
02.2022
Как рисовать #Луковая Клетка #Легкий способ #Шаг за шагом — YouTube
www.youtube.com › смотреть
17.12.2019 · Комментарии:Необходимые материалы:a) покровное стекло b) часовое стеклоc) иглы d) щипцы) кисть f) предметное стекло … клетка/луковица рисунок/нарисовать луковицу — YouTube
www.youtube.com › смотреть
02.02.2022 · это очень простой способ рисования подробный метод, который поможет вам.я рисую луковицу карандашом на арте…
Добавлено: 04:08
Прислано: 02.02.2022
Клетки лука Рисунок Схема Биология Beyond 1 — Twinkl
www.twinkl.com › illustration › onion-cells-drawing…
Создайте свою собственную схему рисования клеток лука Biology Beyond 1 тематический плакат, рекламный баннер, овсянка, надпись, этикетки, рамка Толсби, раскадровка, …
[PDF] Подготовка и научный чертеж предметного стекла клеток лука, включая …
www.wjec.co.uk › media › qyrbrvbt › tg-03-preparation-and-scientif.