Skip to content
МСню
ЗВЁЗДНЫЕ Π’ΠžΠ™ΠΠ« Π­ΠΠ¦Π˜ΠšΠ›ΠžΠŸΠ•Π”Π˜Π― Π ΠžΠ›Π•Π’ΠžΠ™ Π˜Π“Π Π«
  • РисованиС
  • Π‘ΠΎΠ²Π΅Ρ‚Ρ‹ Π½Π°Ρ‡ΠΈΠ½Π°ΡŽΡ‰ΠΈΠΌ
  • Как Ρ€ΠΈΡΠΎΠ²Π°Ρ‚ΡŒ
  • ΠšΠ°Ρ€Π°Π½Π΄Π°ΡˆΠΎΠΌ
  • ΠŸΠΎΡΡ‚Π°ΠΏΠ½ΠΎ
  • Π£Ρ€ΠΎΠΊΠΈ
ЗВЁЗДНЫЕ Π’ΠžΠ™ΠΠ«
Главная » Как Ρ€ΠΈΡΠΎΠ²Π°Ρ‚ΡŒ » Как Ρ€ΠΈΡΠΎΠ²Π°Ρ‚ΡŒ ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΎΡ‡ΠΊΠ°ΠΌ миньона: Рисунки ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΎΡ‡ΠΊΠ°ΠΌ Β«ΠœΠΈΠ½ΡŒΠΎΠ½Ρ‹Β» β˜† 34 рисунка

Как Ρ€ΠΈΡΠΎΠ²Π°Ρ‚ΡŒ ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΎΡ‡ΠΊΠ°ΠΌ миньона: Рисунки ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΎΡ‡ΠΊΠ°ΠΌ Β«ΠœΠΈΠ½ΡŒΠΎΠ½Ρ‹Β» β˜† 34 рисунка

Posted on 18.08.202330.05.2023

Π‘ΠΎΠ΄Π΅Ρ€ΠΆΠ°Π½ΠΈΠ΅

  • Миньон ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΎΡ‡ΠΊΠ°ΠΌ — 97 Ρ„ΠΎΡ‚ΠΎ
  • Π£Π·Π½Π°Π΅ΠΌ ΠΊΠ°ΠΊ ΠΏΡ€Π°Π²ΠΈΠ»ΡŒΠ½ΠΎ Π½Π°Ρ€ΠΈΡΠΎΠ²Π°Ρ‚ΡŒ миньона-Π΄Π΅Π²ΠΎΡ‡ΠΊΡƒ: поэтапная инструкция
    • РисуСм эскиз
    • Π˜Π·ΠΎΠ±Ρ€Π°ΠΆΠ°Π΅ΠΌ ΠΏΠ»Π°Ρ‚ΡŒΠ΅
    • ΠŸΡ€ΠΎΡ€ΠΈΡΠΎΠ²Ρ‹Π²Π°Π΅ΠΌ Π΄Π΅Ρ‚Π°Π»ΠΈ
  • ΠŸΡ€ΠΈΠΊΠ»ΡŽΡ‡Π΅Π½ΠΈΡ с ONT MinION Π½Π° курсС ΠΌΠΈΠΊΡ€ΠΎΠ±Π½ΠΎΠ³ΠΎ разнообразия MBL
      • Нравится:
  • fastq — ΠœΠΎΠ³Ρƒ Π»ΠΈ я ΠΈΠ·Π²Π»Π΅Ρ‡ΡŒ ΠΏΡ€ΠΎΡ‚ΠΎΡ‡Π½ΡƒΡŽ ΠΊΡŽΠ²Π΅Ρ‚Ρƒ MinION ΠΈΠ· USB-ΠΏΠΎΡ€Ρ‚Π° Π²ΠΎ врСмя выполнСния основного Π²Ρ‹Π·ΠΎΠ²Π°?
      • Π—Π°Ρ€Π΅Π³ΠΈΡΡ‚Ρ€ΠΈΡ€ΡƒΠΉΡ‚Π΅ΡΡŒ ΠΈΠ»ΠΈ Π²ΠΎΠΉΠ΄ΠΈΡ‚Π΅ Π² систСму
      • ΠžΠΏΡƒΠ±Π»ΠΈΠΊΠΎΠ²Π°Ρ‚ΡŒ ΠΊΠ°ΠΊ Π³ΠΎΡΡ‚ΡŒ
      • ΠžΠΏΡƒΠ±Π»ΠΈΠΊΠΎΠ²Π°Ρ‚ΡŒ ΠΊΠ°ΠΊ Π³ΠΎΡΡ‚ΡŒ

Миньон ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΎΡ‡ΠΊΠ°ΠΌ — 97 Ρ„ΠΎΡ‚ΠΎ

Рисунки Π² ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΎΡ‡ΠΊΡƒ ΠœΠΈΠ½ΡŒΠΎΠ½Ρ‹


ΠŸΠΈΠΊΡΠ΅Π»ΡŒΠ½Ρ‹Π΅ рисунки Π² ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΊΡƒ


Π’Ρ‹ΡˆΠΈΠ²ΠΊΠ° ΠœΠΈΠ½ΡŒΠΎΠ½Ρ‹ схСмы


ΠœΠΈΠ½ΡŒΠΎΠ½Ρ‹ ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΎΡ‡ΠΊΠ°ΠΌ Π² Ρ‚Π΅Ρ‚Ρ€Π°Π΄ΠΈ


Π’Ρ‹ΡˆΠΈΠ²ΠΊΠ° ΠœΠΈΠ½ΡŒΠΎΠ½Ρ‹ схСмы


РисованиС ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΎΡ‡ΠΊΠ°ΠΌ пСрсонаТи


Рисунки ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΎΡ‡ΠΊΠ°ΠΌ Миньон


Миньон ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΊΠ°ΠΌ


РисованиС ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΊΠ°ΠΌ миньонов


ΠœΠΈΠ½ΡŒΠΎΠ½Ρ‹ ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΎΡ‡ΠΊΠ°ΠΌ Π² Ρ‚Π΅Ρ‚Ρ€Π°Π΄ΠΈ


Рисунки ΠΏΠΎ пиксСлям Миньон


Рисунки ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΎΡ‡ΠΊΠ°ΠΌ Миньон


Π’Ρ‹ΡˆΠΈΠ²ΠΊΠ° ΠœΠΈΠ½ΡŒΠΎΠ½Ρ‹ схСмы


РисованиС ΠΏΠΎ ΠΊΠ²Π°Π΄Ρ€Π°Ρ‚ΠΈΠΊΠ°ΠΌ


Рисунки ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΎΡ‡ΠΊΠ°ΠΌ Π»Ρ‘Π³ΠΊΠΈΠ΅


Рисунки ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΎΡ‡ΠΊΠ°ΠΌ пиксСлька малСнькиС


Π’Ρ‹ΡˆΠΈΠ²ΠΊΠ° ΠœΠΈΠ½ΡŒΠΎΠ½Ρ‹ схСмы


Π’Ρ‹ΡˆΠΈΠ²ΠΊΠ° ΠœΠΈΠ½ΡŒΠΎΠ½Ρ‹


РисованиС ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΎΡ‡ΠΊΠ°ΠΌ для Π΄Π΅Ρ‚Π΅ΠΉ Миньон


Миньон ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΊΠ°ΠΌ


Π‘Ρ…Π΅ΠΌΡ‹ Аква Бидс ΠœΠ°Ρ€Π²Π΅Π»


Π‘Ρ…Π΅ΠΌΡ‹ Π²Ρ‹ΡˆΠΈΠ²ΠΊΠΈ крСстом ΠœΠΈΠ½ΡŒΠΎΠ½Ρ‹


Π’Ρ‹ΡˆΠΈΠ²ΠΊΠ° ΠœΠΈΠ½ΡŒΠΎΠ½Ρ‹


Рисунки ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΊΠ°ΠΌ ΠΏΡ€ΠΈΠΊΠΎΠ»ΡŒΠ½Ρ‹Π΅


Π’Ρ‹ΡˆΠΈΠ²ΠΊΠ° ΠœΠΈΠ½ΡŒΠΎΠ½Ρ‹


Π”Π΅ΠΌΠΎΠ½Ρ‘Π½ΠΎΠΊ пиксСль Π°Ρ€Ρ‚


Рисунки ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΎΡ‡ΠΊΠ°ΠΌ Π² Ρ‚Π΅Ρ‚Ρ€Π°Π΄ΠΈ


НовогодниС Миньон ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΎΡ‡ΠΊΠ°ΠΌ


Рисунки ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΎΡ‡ΠΊΠ°ΠΌ ΠΌΠ°Ρ€Π΄ΠΆ симпсон


ΠšΠ°ΠΏΠΈΡ‚Π°Π½ АмСрика ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΎΡ‡ΠΊΠ°ΠΌ


Π‘Ρ…Π΅ΠΌΠ° миньонов


ВСрмомозайкс схСма Миньон


ΠŸΠΈΠΊΡΠ΅Π»ΡŒΠ°Ρ€Ρ‚ Π±Π°Ρ€Ρ‚ симпсон


РисованиС ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΎΡ‡ΠΊΠ°ΠΌ pixellenger


Рисунки ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΎΡ‡ΠΊΠ°ΠΌ Π² Paint


Пакман 8 Π±ΠΈΡ‚


Π Μ†ΜˆΠΈΜ†ΜˆΡΜ†ΜˆΡƒΜ†ΜˆΠ½Μ†ΜˆΠΎΜ†ΜˆΠΊΜ†Μˆ ΠΏΜ†ΜˆΠΎΜ†Μˆ ΠΊΜ†ΜˆΠ»Μ†ΜˆΠ΅Μ†ΜˆΡ‚Μ†ΜˆΠΎΜ†ΜˆΡ‡Μ†ΜˆΠΊΜ†ΜˆΠ°Μ†ΜˆΠΌΜ†Μˆ


РисованиС ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΎΡ‡ΠΊΠ°v


Рисунки ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΎΡ‡ΠΊΠ°ΠΌ Π² Ρ‚Π΅Ρ‚Ρ€Π°Π΄ΠΈ схСмы


Рисунки ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΎΡ‡ΠΊΠ°ΠΌ Π½ΠΎΠ²ΠΎΠ³ΠΎΠ΄Π½ΠΈΠ΅ Π»Ρ‘Π³ΠΊΠΈΠ΅


Пингвин ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΊΠ°ΠΌ


Рисунки ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΎΡ‡ΠΊΠ°ΠΌ Π±Π°Ρ€Ρ‚ симпсон


ПиксСль Π°Ρ€Ρ‚ ΠŸΠΈΠΊΠ°Ρ‡Ρƒ


РисованиС ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΎΡ‡ΠΊΠ°ΠΌ Панда


Рисунки ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΊΠ°ΠΌ ΠŸΠΈΠΊΠ°Ρ‡Ρƒ


ΠŸΡ‚ΠΈΡ†Π° ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΎΡ‡ΠΊΠ°ΠΌ


Майк Вазовски пиксСль


ΠšΠ°Ρ€Ρ‚ΠΈΠ½Ρ‹ Π² пиксСлях


Π‘ΠΌΡƒΡ€Ρ„ΠΈΠΊΠΈ ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΎΡ‡ΠΊΠ°ΠΌ


РисованиС ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΎΡ‡ΠΊΠ°ΠΌ Π² Ρ‚Π΅Ρ‚Ρ€Π°Π΄ΠΈ малСнькиС


РисованиС ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΎΡ‡ΠΊΠ°ΠΌ Π­Π½Π³Ρ€ΠΈ Π±Π΅Ρ€Π΄Π·


Π’Ρ‹ΡˆΠΈΡ‚ΡŒ крСстиком Π”Π΅Π΄ΠΏΡƒΠ»Π°


ПиксСльноС рисованиС


ΠžΡ‚Π²Π΅Ρ‚Ρ‹ Π½Π° японскиС кроссворды Ямабуси Миньон


Π’Ρ‹ΡˆΠΈΠ²ΠΊΠ° ΠœΠΈΠ½ΡŒΠΎΠ½Ρ‹


Рисовка ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΎΡ‡ΠΊΠ°ΠΌ красивыС слоТныС


Π€Π»Π°ΠΌΠΈΠ½Π³ΠΎ ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΎΡ‡ΠΊΠ°ΠΌ


Рисунки ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΎΡ‡ΠΊΠ°ΠΌ


Π€Π΅Π½Π΅Ρ‡ΠΊΠ° Миньон


Рисунки ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΎΡ‡ΠΊΠ°ΠΌ большиС


ПиксСль Π°Ρ€Ρ‚


Рисунки ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΎΡ‡ΠΊΠ°ΠΌ Π”ΠΆΠ΅ΠΉΠΊ


ΠšΠΎΡ€ΠΎΠ»ΡŒ Миньон ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΎΡ‡ΠΊΠ°ΠΌ


РисованиС ΠΏΠΎ ΠΊΠ²Π°Π΄Ρ€Π°Ρ‚ΠΈΠΊΠ°ΠΌ


ΠŸΠΈΠΊΡΠ΅Π»ΡŒΠ½Ρ‹Π΅ ΠœΠΈΠ½ΡŒΠΎΠ½Ρ‹


Π’Ρ‹ΡˆΠΈΠ²ΠΊΠ° ΠœΠΈΠ½ΡŒΠΎΠ½Ρ‹


ΠŸΠΈΠΊΡΠ΅Π»ΡŒΠ½Ρ‹Π΅ рисунки нСбольшиС


Π‘ΠΈΠ»Π» ΠΈΠ· Π“Ρ€Π°Π²ΠΈΡ‚ΠΈ Π€ΠΎΠ»Π· ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΎΡ‡ΠΊΠ°ΠΌ


РисованиС по пиксСлям


Π‘Ρ…Π΅ΠΌΡ‹ бисСроплСтСния ΠœΠΈΠ½ΡŒΠΎΠ½Ρ‹


ΠŸΠΈΠΊΠ°Ρ‡Ρƒ Pixel Art


Рисунки ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΎΡ‡ΠΊΠ°ΠΌ Π‘ΠΌΡƒΡ€Ρ„ΠΈΠΊΠΈ


ΠΠ°Ρ€ΠΈΡΠΎΠ²Π°Ρ‚ΡŒ ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΎΡ‡ΠΊΠ°ΠΌ


Π£Ρ‚ΠΎΡ‡ΠΊΠ° ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΊΠ°ΠΌ


Рисунки Π² ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΊΡƒ ΠΊΡ€ΡƒΡ‚Ρ‹Π΅


Π’Ρ‹ΡˆΠΈΠ²ΠΊΠ° ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΎΡ‡ΠΊΠ°ΠΌ


Рисунки Π² ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΎΡ‡ΠΊΡƒ


ΠŸΠΈΠΊΡΠ΅Π»ΡŒΠ½Ρ‹ΠΉ Миньон


ПиксСль Π°Ρ€Ρ‚ Π² ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΊΡƒ


ПиксСль Π°Ρ€Ρ‚ Баус ΠΏΠ°Ρ€ΠΊ


РисованиС ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΊΠ°ΠΌ


Π§Π΅Ρ€Π΅ΠΏΠ°ΡˆΠΊΠΈ ниндзя ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΎΡ‡ΠΊΠ°ΠΌ


РисованиС ΠΏΠΎΠΊΠ»Π΅Ρ‚Π°Ρ‡ΠΊΠ°ΠΌ


Рисунки ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΎΡ‡ΠΊΠ°ΠΌ Π»Ρ‘Π³ΠΊΠΈΠ΅


РисованиС ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΎΡ‡ΠΊΠ°ΠΌ Π•Π΄ΠΈΠ½ΠΎΡ€ΠΎΠ³


РисованиС ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΎΡ‡ΠΊΠ°ΠΌ симпсоны


ΠΠ·Ρ€ΠΈΡΠ»ΡŒ пиксСль Π°Ρ€Ρ‚


Рисунки ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΊΠ°ΠΌ Π€Π»Π°Ρ‚Ρ‚Π΅Ρ€ΡˆΠ°ΠΉ


ПиксСль Π°Ρ€Ρ‚Ρ‹ большиС


ЯпонскиС ΠΊΡ€ΠΎΡΡΠ²ΠΎΡ€Π΄Ρ‹ΠΌΠΈΠ½ΡŒΠ΅Π½


Рисунки ΠΈΠ· пиксСлСй


Π›ΠΈΠ·Π° симпсон Pixel Art


ΠŸΠΈΠΊΡΠ΅Π»ΡŒΠ½Ρ‹ΠΉ рисунок


РисованиС ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΊΠ°ΠΌ ΠŸΠΈΠΊΠ°Ρ‡Ρƒ


Рисунки ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΎΡ‡ΠΊΠ°ΠΌ


Рисунки ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΎΡ‡ΠΊΠ°ΠΌ малСнькиС


Рисунки ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΎΡ‡ΠΊΠ°ΠΌ Миньон

ΠšΠΎΠΌΠΌΠ΅Π½Ρ‚Π°Ρ€ΠΈΠΈ (0)

ΠΠ°ΠΏΠΈΡΠ°Ρ‚ΡŒ

Π˜Π½Ρ„ΠΎΡ€ΠΌΠ°Ρ†ΠΈΡ
ΠŸΠΎΡΠ΅Ρ‚ΠΈΡ‚Π΅Π»ΠΈ, находящиСся Π² Π³Ρ€ΡƒΠΏΠΏΠ΅ Гости, Π½Π΅ ΠΌΠΎΠ³ΡƒΡ‚ ΠΎΡΡ‚Π°Π²Π»ΡΡ‚ΡŒ ΠΊΠΎΠΌΠΌΠ΅Π½Ρ‚Π°Ρ€ΠΈΠΈ ΠΊ Π΄Π°Π½Π½ΠΎΠΉ ΠΏΡƒΠ±Π»ΠΈΠΊΠ°Ρ†ΠΈΠΈ.

Π£Π·Π½Π°Π΅ΠΌ ΠΊΠ°ΠΊ ΠΏΡ€Π°Π²ΠΈΠ»ΡŒΠ½ΠΎ Π½Π°Ρ€ΠΈΡΠΎΠ²Π°Ρ‚ΡŒ миньона-Π΄Π΅Π²ΠΎΡ‡ΠΊΡƒ: поэтапная инструкция

ΠœΠΈΠ½ΡŒΠΎΠ½Ρ‹ – ΡΠΌΠ΅ΡˆΠ½Ρ‹Π΅ ТизнСрадостныС сущСства ΠΈΠ· популярного ΠΌΡƒΠ»ΡŒΡ‚Ρ„ΠΈΠ»ΡŒΠΌΠ° Β«Π“Π°Π΄ΠΊΠΈΠΉ я». Они ΠΎΡ‡Π΅Π½ΡŒ Ρ‚Ρ€ΠΎΠ³Π°Ρ‚Π΅Π»ΡŒΠ½Ρ‹Π΅, ΠΌΠΈΠ»Ρ‹Π΅ ΠΈ Π·Π°Π±Π°Π²Π½Ρ‹Π΅, Π»ΡŽΠ±ΡΡ‚ ΠΏΠΎΠΊΡƒΡˆΠ°Ρ‚ΡŒ ΠΈ ΠΏΠΎΠ²Π΅ΡΠ΅Π»ΠΈΡ‚ΡŒΡΡ. БСгодня ΠΌΡ‹ посмотрим, ΠΊΠ°ΠΊ Π½Π°Ρ€ΠΈΡΠΎΠ²Π°Ρ‚ΡŒ миньона-Π΄Π΅Π²ΠΎΡ‡ΠΊΡƒ.

РисуСм эскиз

Π‘Ρ‚Ρ€Π°Π½Π½Ρ‹Π΅ сущСства ΠΎΡ‡Π΅Π½ΡŒ ΠΏΠΎΡ…ΠΎΠΆΠΈ Π΄Ρ€ΡƒΠ³ Π½Π° Π΄Ρ€ΡƒΠ³Π°. Однако Ρƒ ΠΊΠ°ΠΆΠ΄ΠΎΠ³ΠΎ ΠΈΠ· ΠΈΡ… Π΅ΡΡ‚ΡŒ какая-Π½ΠΈΠ±ΡƒΠ΄ΡŒ ΠΎΡ‚Π»ΠΈΡ‡ΠΈΡ‚Π΅Π»ΡŒΠ½Π°Ρ Ρ‡Π΅Ρ€Ρ‚Π°. Одни ΠΈΠΌΠ΅ΡŽΡ‚ СдинствСнный Π³Π»Π°Π·, Π΄Ρ€ΡƒΠ³ΠΈΠ΅ — Ρ„ΠΈΠΎΠ»Π΅Ρ‚ΠΎΠ²Ρ‹Π΅ волосы, Ρ‚Ρ€Π΅Ρ‚ΡŒΠΈ — Π²ΠΎΠΎΠ±Ρ‰Π΅ лысыС. ИмСнно поэтому Π±Π°Π·ΠΎΠ²Ρ‹Π΅ Ρ„ΠΎΡ€ΠΌΡ‹ миньонов Π±ΡƒΠ΄ΡƒΡ‚ ΠΎΠ΄ΠΈΠ½Π°ΠΊΠΎΠ²Ρ‹ΠΌΠΈ. НачнСм с рисования стандартного эскиза. Π’Π΅Π»ΠΎ миньона прСдставляСт собой вытянутый ΠΎΠ²Π°Π» ΠΈΠ»ΠΈ Π½Π΅ΠΏΡ€Π°Π²ΠΈΠ»ΡŒΠ½Ρ‹ΠΉ ΠΏΡ€ΡΠΌΠΎΡƒΠ³ΠΎΠ»ΡŒΠ½ΠΈΠΊ Π±Π΅Π· ΡƒΠ³Π»ΠΎΠ². ИмСнно эту Ρ„ΠΈΠ³ΡƒΡ€Ρƒ ΠΈ Π½ΡƒΠΆΠ½ΠΎ Π±ΡƒΠ΄Π΅Ρ‚ Π½Π°Ρ€ΠΈΡΠΎΠ²Π°Ρ‚ΡŒ. Π’Π΅ΠΏΠ΅Ρ€ΡŒ ΠΈΠ·ΠΎΠ±Ρ€Π°Π·ΠΈΠΌ ΠΎΡ‡ΠΊΠΈ. Наша Π΄Π΅Π²ΠΎΡ‡ΠΊΠ° Π±ΡƒΠ΄Π΅Ρ‚ с ΠΎΠ΄Π½ΠΈΠΌ Π³Π»Π°Π·ΠΎΠΌ, Π·Π½Π°Ρ‡ΠΈΡ‚, ΠΈ окуляры Π½ΡƒΠΆΠ½ΠΎ ΡΠΎΠ·Π΄Π°Ρ‚ΡŒ ΡΠΎΠΎΡ‚Π²Π΅Ρ‚ΡΡ‚Π²ΡƒΡŽΡ‰ΠΈΠ΅. НарисуйтС ΠΊΡ€ΡƒΠ³, Π²Π½ΡƒΡ‚Ρ€ΠΈ Π½Π΅Π³ΠΎ Π΅Ρ‰Π΅ ΠΎΠ΄ΠΈΠ½, Π° Π·Π°Ρ‚Π΅ΠΌ Ρ€Π΅Π·ΠΈΠ½ΠΊΡƒ для ΠΎΡ‡ΠΊΠΎΠ² с ΠΎΠ±Π΅ΠΈΡ… сторон Π»ΠΈΠ½Π·Ρ‹. Π”Π°Π»Π΅Π΅ ΠΎΡ‚ΠΌΠ΅Ρ‚ΡŒΡ‚Π΅ Π»ΠΈΠ½ΠΈΠΈ Π³Π»Π°Π· – Π΄Π²Π΅ Ρ‡Π΅Ρ€Ρ‚ΠΎΡ‡ΠΊΠΈ Π²Π½ΡƒΡ‚Ρ€ΠΈ ΠΊΡ€ΡƒΠ³Π°. Π—Π°Ρ‚Π΅ΠΌ ΠΏΠΎΡΡ‚Π°Π²ΡŒΡ‚Π΅ ΠΆΠΈΡ€Π½ΡƒΡŽ Ρ‚ΠΎΡ‡ΠΊΡƒ посрСдинС окуляра. Π’ΠΎΡ‚ наш Π³Π»Π°Π· Π³ΠΎΡ‚ΠΎΠ². Если Π²Ρ‹ Π±ΡƒΠ΄Π΅Ρ‚Π΅ Π²Π½ΠΈΠΌΠ°Ρ‚Π΅Π»ΡŒΠ½Ρ‹, Ρ‚ΠΎ быстро Ρ€Π°Π·Π±Π΅Ρ€Π΅Ρ‚Π΅ΡΡŒ, ΠΊΠ°ΠΊ Π½Π°Ρ€ΠΈΡΠΎΠ²Π°Ρ‚ΡŒ миньона-Π΄Π΅Π²ΠΎΡ‡ΠΊΡƒ поэтапно. Π’Π΅ΠΏΠ΅Ρ€ΡŒ ΠΈΠ·ΠΎΠ±Ρ€Π°Π·ΠΈΠΌ Ρ€ΡƒΠΊΠΈ – ΠΏΠΎ Π΄Π²Π΅ Ρ‚ΠΎΠ½ΠΊΠΈΠ΅ Π»ΠΈΠ½ΠΈΠΈ, исходящиС ΠΎΡ‚ Ρ†Π΅Π½Ρ‚Ρ€Π° ΠΎΠ²Π°Π»Π°. На основании — Ρ‚Π°ΠΌ, Π³Π΄Π΅ Π΄ΠΎΠ»ΠΆΠ½Ρ‹ Π±Ρ‹Ρ‚ΡŒ Ρ€ΡƒΠΊΠΈ, — нарисуйтС ΠΏΠ΅Ρ€Ρ‡Π°Ρ‚ΠΊΠΈ.


Π£Ρ€ΠΎΠΊΠΈ рисования. Как ΠΏΡ€Π°Π²ΠΈΠ»ΡŒΠ½ΠΎ Π½Π°Ρ€ΠΈΡΠΎΠ²Π°Ρ‚ΡŒ косичку простым…

Π£ ΠΌΠ½ΠΎΠ³ΠΈΡ… Π½Π°Ρ‡ΠΈΠ½Π°ΡŽΡ‰ΠΈΡ… Ρ…ΡƒΠ΄ΠΎΠΆΠ½ΠΈΡ† Π²ΠΎΠ·Π½ΠΈΠΊΠ°Π΅Ρ‚ вопрос, ΠΊΠ°ΠΊ Π½Π°Ρ€ΠΈΡΠΎΠ²Π°Ρ‚ΡŒ косичку. Π‘Π΄Π΅Π»Π°Ρ‚ΡŒ это совсСм Π½Π΅…

Π˜Π·ΠΎΠ±Ρ€Π°ΠΆΠ°Π΅ΠΌ ΠΏΠ»Π°Ρ‚ΡŒΠ΅

Π§Ρ‚ΠΎΠ±Ρ‹ Ρ€Π°Π·ΠΎΠ±Ρ€Π°Ρ‚ΡŒΡΡ, ΠΊΠ°ΠΊ Π½Π°Ρ€ΠΈΡΠΎΠ²Π°Ρ‚ΡŒ миньона-Π΄Π΅Π²ΠΎΡ‡ΠΊΡƒ, рассмотритС ΠΊΠ°Ρ€Ρ‚ΠΈΠ½ΠΊΠΈ, ΠΊΠΎΡ‚ΠΎΡ€Ρ‹Π΅ ΠΌΠΎΠΆΠ½ΠΎ ΡƒΠ²ΠΈΠ΄Π΅Ρ‚ΡŒ здСсь ΠΆΠ΅. Наша Π»Π΅Π΄ΠΈ Π΄ΠΎΠ»ΠΆΠ½Π° ΠΈΠΌΠ΅Ρ‚ΡŒ ΠΊΡ€Π°ΡΠΈΠ²ΡƒΡŽ ΠΎΠ΄Π΅ΠΆΠ΄Ρƒ ΠΈ ΠΏΡ‹ΡˆΠ½ΡƒΡŽ причСску. ΠŸΠ»Π°Ρ‚ΡŒΠ΅ Π½Π°Ρ€ΠΈΡΠΎΠ²Π°Ρ‚ΡŒ ΠΎΡ‡Π΅Π½ΡŒ просто. ΠŸΡ€ΠΎΡ‡Π΅Ρ€Ρ‚ΠΈΡ‚Π΅ Π³ΠΎΡ€ΠΈΠ·ΠΎΠ½Ρ‚Π°Π»ΡŒΠ½ΡƒΡŽ линию Ρ‚Π°ΠΌ, Π³Π΄Π΅ Π·Π°ΠΊΠ°Π½Ρ‡ΠΈΠ²Π°ΡŽΡ‚ΡΡ Ρ€ΡƒΠΊΠΈ, Π° Ρ‚Π°ΠΊΠΆΠ΅ Π΅Ρ‰Π΅ ΠΎΠ΄Π½Ρƒ — Ρ‚Π°ΠΌ, Π³Π΄Π΅ Ρ€ΡƒΠΊΠΈ Π½Π°Ρ‡ΠΈΠ½Π°ΡŽΡ‚ΡΡ. ДорисуйтС лямки, ΠΈ прСлСстный сарафанчик для миньона Π³ΠΎΡ‚ΠΎΠ². ΠžΡΡ‚Π°Π»ΠΎΡΡŒ ΡƒΠΊΡ€Π°ΡΠΈΡ‚ΡŒ Π΅Π³ΠΎ Ρ†Π²Π΅Ρ‚ΠΎΡ‡ΠΊΠ°ΠΌΠΈ ΠΈΠ»ΠΈ Π³ΠΎΡ€ΠΎΡˆΠΊΠΎΠΌ. Π‘Π½ΠΈΠ·Ρƒ подрисуйтС ступни Π½ΠΎΠ³. Π’Π΅ΠΏΠ΅Ρ€ΡŒ наш рисунок ΠΏΠΎΡ‡Ρ‚ΠΈ Π³ΠΎΡ‚ΠΎΠ², ΠΎΡΡ‚Π°Π»ΠΎΡΡŒ совсСм Π½Π΅ΠΌΠ½ΠΎΠ³ΠΎ.

ΠŸΡ€ΠΎΡ€ΠΈΡΠΎΠ²Ρ‹Π²Π°Π΅ΠΌ Π΄Π΅Ρ‚Π°Π»ΠΈ

Π’Ρ‹ ΡƒΠΆΠ΅ поняли, Ρ‡Ρ‚ΠΎ Ρ€Π°Π·ΠΎΠ±Ρ€Π°Ρ‚ΡŒΡΡ Π² Ρ‚ΠΎΠΌ, ΠΊΠ°ΠΊ Π½Π°Ρ€ΠΈΡΠΎΠ²Π°Ρ‚ΡŒ миньона-Π΄Π΅Π²ΠΎΡ‡ΠΊΡƒ ΠΊΠ°Ρ€Π°Π½Π΄Π°ΡˆΠΎΠΌ, вовсС Π½Π΅ слоТно. Однако наш ΡˆΠ΅Π΄Π΅Π²Ρ€ Ρ‚Ρ€Π΅Π±ΡƒΠ΅Ρ‚ ΠΏΠΎΠ΄Π³ΠΎΡ‚ΠΎΠ²ΠΊΠΈ. Нам Π½ΡƒΠΆΠ½ΠΎ ΠΏΠΎΠ»ΡƒΡ‡ΠΈΡ‚ΡŒ ΠΊΡ€Π°ΡΠΈΠ²ΡƒΡŽ причСску. Для этого сначала нарисуСм ΠΏΡ€ΠΎΠ±ΠΎΡ€ Π½Π° ΠΌΠ°ΠΊΡƒΡˆΠΊΠ΅, провСдя нСсколько ΡΠΊΠΎΡˆΠ΅Π½Π½Ρ‹Ρ… Π»ΠΈΠ½ΠΈΠΉ. Π’Π΅ΠΏΠ΅Ρ€ΡŒ ΠΈΠ·ΠΎΠ±Ρ€Π°Π·ΠΈΠΌ вСсСлыС косички. НарисуйтС ΠΏΠΎ Π΄Π²Π΅ Ρ‚ΠΎΠ½ΠΊΠΈΡ… Π»ΠΈΠ½ΠΈΠΈ, Ρ‚ΠΎΡ€Ρ‡Π°Ρ‰ΠΈΡ… Π² Ρ€Π°Π·Π½Ρ‹Π΅ стороны. На ΠΊΠΎΠ½Ρ‡ΠΈΠΊΠ΅ ΠΊΠ°ΠΆΠ΄ΠΎΠΉ косички создайтС ΠΏΠΎ ΠΏΡƒΡˆΠΈΡΡ‚ΠΎΠΉ кисточкС. Для этого ΠΏΡ€ΠΎΠ²Π΅Π΄ΠΈΡ‚Π΅ нСсколько ΠΊΠΎΡ€ΠΎΡ‚ΠΊΠΈΡ… Ρ‡Π΅Ρ€Ρ‚ΠΎΡ‡Π΅ΠΊ Π² Ρ€Π°Π·Π½Ρ‹Π΅ стороны. ΠŸΡ€ΠΈ ΠΆΠ΅Π»Π°Π½ΠΈΠΈ ΠΌΠΎΠΆΠ½ΠΎ ΠΈΠ·ΠΎΠ±Ρ€Π°Π·ΠΈΡ‚ΡŒ Π±Π°Π½Ρ‚ΠΈΠΊΠΈ ΠΈΠ»ΠΈ вСсСлыС Ρ€Π΅Π·ΠΈΠ½ΠΊΠΈ. Π£ΠΆΠ΅ ΠΏΠΎΡ‡Ρ‚ΠΈ понятно, ΠΊΠ°ΠΊ Π½Π°Ρ€ΠΈΡΠΎΠ²Π°Ρ‚ΡŒ миньона-Π΄Π΅Π²ΠΎΡ‡ΠΊΡƒ. ΠžΡΡ‚Π°Π»ΠΎΡΡŒ ΠΈΠ·ΠΎΠ±Ρ€Π°Π·ΠΈΡ‚ΡŒ Ρ€ΠΎΡ‚. Для этого Π² Π½ΡƒΠΆΠ½ΠΎΠΌ мСстС нарисуйтС Π΄Π²Π΅ нСбольшиС Π΄ΡƒΠ³ΠΈ. Π’ΠΎ Ρ€Ρ‚Ρƒ прорисуйтС нСсколько Π·ΡƒΠ±ΠΎΠ². Π’Π°ΠΊΠΈΠΌ ΠΎΠ±Ρ€Π°Π·ΠΎΠΌ, каТСтся, Ρ‡Ρ‚ΠΎ Π΄Π΅Π²ΠΎΡ‡ΠΊΠ° улыбаСтся. ΠžΡΡ‚Π°Π»ΠΎΡΡŒ Ρ€Π°ΡΠΊΡ€Π°ΡΠΈΡ‚ΡŒ Π½Π°ΡˆΡƒ модСль. Π’ΠΎΠ·ΡŒΠΌΠΈΡ‚Π΅ краски ΠΈΠ»ΠΈ Ρ†Π²Π΅Ρ‚Π½Ρ‹Π΅ ΠΊΠ°Ρ€Π°Π½Π΄Π°ΡˆΠΈ. Как ΠΏΡ€Π°Π²ΠΈΠ»ΠΎ, ΠΌΠΈΠ½ΡŒΠΎΠ½Ρ‹ Π±Ρ‹Π²Π°ΡŽΡ‚ ΠΆΠ΅Π»Ρ‚ΠΎΠ³ΠΎ Ρ†Π²Π΅Ρ‚Π°. Π˜Ρ… ΠΎΡ‡ΠΊΠΈ – сСрыС, Π° ΠΏΠ΅Ρ€Ρ‡Π°Ρ‚ΠΊΠΈ ΠΈ Ρ‚ΡƒΡ„Π»ΠΈ – Ρ‡Π΅Ρ€Π½ΠΎΠ³ΠΎ ΠΎΡ‚Ρ‚Π΅Π½ΠΊΠ°. ΠŸΠ»Π°Ρ‚ΡŒΠ΅ ΠΌΠΎΠΆΠ΅Ρ‚ Π±Ρ‹Ρ‚ΡŒ любого Ρ†Π²Π΅Ρ‚Π°. ΠœΠΈΠ½ΡŒΠΎΠ½Ρ‹ ΠΏΡ€Π΅Π΄ΠΏΠΎΡ‡ΠΈΡ‚Π°ΡŽΡ‚ синий ΠΎΡ‚Ρ‚Π΅Π½ΠΎΠΊ. НС Π·Π°Π±ΡƒΠ΄ΡŒΡ‚Π΅ Β«ΠΎΠΆΠΈΠ²ΠΈΡ‚ΡŒΒ» яркими Ρ‚ΠΎΠ½Π°ΠΌΠΈ Π±Π°Π½Ρ‚ΠΈΠΊΠΈ, Ρ€ΠΎΡ‚ ΠΈΠ»ΠΈ Π³Π»Π°Π·Π°. Π˜Ρ‚Π°ΠΊ, Ρ‚Π΅ΠΏΠ΅Ρ€ΡŒ Π²Ρ‹ Π·Π½Π°Π΅Ρ‚Π΅, ΠΊΠ°ΠΊ Π½Π°Ρ€ΠΈΡΠΎΠ²Π°Ρ‚ΡŒ миньона-Π΄Π΅Π²ΠΎΡ‡ΠΊΡƒ. Π˜Π·ΡƒΡ‡ΠΈΠ² ΡΡ‚Π°Π½Π΄Π°Ρ€Ρ‚Π½ΡƒΡŽ Ρ‚Π΅Ρ…Π½ΠΈΠΊΡƒ, ΠΏΠΎΠΏΡ€ΠΎΠ±ΡƒΠΉΡ‚Π΅ ΠΈΠ·ΠΎΠ±Ρ€Π°Π·ΠΈΡ‚ΡŒ Π΄Ρ€ΡƒΠ·Π΅ΠΉ вашСго ТизнСрадостного сущСства. ВмСстС со своим Ρ€Π΅Π±Π΅Π½ΠΊΠΎΠΌ Π²Ρ‹ смоТСтС ΡΠΎΠ·Π΄Π°Ρ‚ΡŒ Ρ†Π΅Π»ΡƒΡŽ Π°Ρ€ΠΌΠΈΡŽ ΡΠΌΠ΅ΡˆΠ½Ρ‹Ρ… ΠΈ Π±Π΅Π·ΠΎΠ±ΠΈΠ΄Π½Ρ‹Ρ… ΠΌΠ°Π»Ρ‹ΡˆΠ΅ΠΉ.

ΠŸΡ€ΠΈΠΊΠ»ΡŽΡ‡Π΅Π½ΠΈΡ с ONT MinION Π½Π° курсС ΠΌΠΈΠΊΡ€ΠΎΠ±Π½ΠΎΠ³ΠΎ разнообразия MBL

МоС врСмя здСсь, Π½Π° курсС ΠΌΠΈΠΊΡ€ΠΎΠ±Π½ΠΎΠ³ΠΎ разнообразия Π² MBL, подошло ΠΊ ΠΊΠΎΠ½Ρ†Ρƒ послС Ρ‚ΠΎΠ³ΠΎ, ΠΊΠ°ΠΊ я Π² Ρ‚Π΅Ρ‡Π΅Π½ΠΈΠ΅ послСдних 2 нСдСль посСщал Π½Π°ΡˆΡƒ Π»Π°Π±ΠΎΡ€Π°Ρ‚ΠΎΡ€ΠΈΡŽ MinION для сСквСнирования Π³Π΅Π½ΠΎΠΌΠΎΠ² ΠΈΠ· Π±Π°ΠΊΡ‚Π΅Ρ€ΠΈΠ°Π»ΡŒΠ½Ρ‹Ρ… изолятов, ΠΊΠΎΡ‚ΠΎΡ€Ρ‹Π΅ студСнты собрали Π² Trunk Π Π΅ΠΊΠ° Π² Вудс-Π₯ΠΎΡƒΠ», ΠœΠ°ΡΡΠ°Ρ‡ΡƒΡΠ΅Ρ‚Ρ. (Ѐотография Π”ΠΆΠ°Ρ€Π΅Π΄Π° Π›ΠΈΠ΄Π±Π΅Ρ‚Ρ‚Π΅Ρ€Π° ΠΈΠ· Β«EctocoolerΒ»

Tenacibaculum sp., выдСлСнная Π Π΅Π±Π΅ΠΊΠΊΠΎΠΉ Микол).

Π’ Π»Π°Π±ΠΎΡ€Π°Ρ‚ΠΎΡ€ΠΈΠΈ DIB Витуса Π‘Ρ€Π°ΡƒΠ½Π° ΠΌΡ‹ Π±Ρ‹Π»ΠΈ Π² восторгС ΠΎΡ‚ сСквСнсора MinION ΠΎΡ‚ Oxford Nanopore Technologies ΠΏΠΎ нСскольким ΠΏΡ€ΠΈΡ‡ΠΈΠ½Π°ΠΌ:

1) МалСнький ΠΈ ΠΏΠΎΡ€Ρ‚Π°Ρ‚ΠΈΠ²Π½Ρ‹ΠΉ. Π­Ρ‚ΠΎ Π΄Π΅Π»Π°Π΅Ρ‚ MinION ΠΎΡ‚Π»ΠΈΡ‡Π½Ρ‹ΠΌ ΠΎΠ±ΡƒΡ‡Π°ΡŽΡ‰ΠΈΠΌ инструмСнтом! МоТно Π²Π·ΡΡ‚ΡŒ Π² мастСрскиС. Π‘Ρ‚ΡƒΠ΄Π΅Π½Ρ‚Ρ‹ ΠΌΠΎΠ³ΡƒΡ‚ ΡΠΎΠ±ΠΈΡ€Π°Ρ‚ΡŒ ΠΎΠ±Ρ€Π°Π·Ρ†Ρ‹, ΠΈΠ·Π²Π»Π΅ΠΊΠ°Ρ‚ΡŒ Π”ΠΠš, Π³ΠΎΡ‚ΠΎΠ²ΠΈΡ‚ΡŒ Π±ΠΈΠ±Π»ΠΈΠΎΡ‚Π΅ΠΊΠΈ, ΡΠ΅ΠΊΠ²Π΅Π½ΠΈΡ€ΠΎΠ²Π°Ρ‚ΡŒ ΠΈ ΡƒΡ‡ΠΈΡ‚ΡŒΡΡ ΠΈΡΠΏΠΎΠ»ΡŒΠ·ΠΎΠ²Π°Ρ‚ΡŒ ΠΏΡ€ΠΎΠ³Ρ€Π°ΠΌΠΌΠ½Ρ‹Π΅ инструмСнты Π±ΠΈΠΎΠΈΠ½Ρ„ΠΎΡ€ΠΌΠ°Ρ‚ΠΈΠΊΠΈ для сборки ΠΈ аннотирования Π² Ρ‚Π΅Ρ‡Π΅Π½ΠΈΠ΅ 1 Π½Π΅Π΄Π΅Π»ΠΈ.

2. ) ΠœΡ‹ заинтСрСсованы Π² Ρ€Π°Π·Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚ΠΊΠ΅ ΠΏΡ€ΠΎΠ³Ρ€Π°ΠΌΠΌΠ½ΠΎΠ³ΠΎ обСспСчСния для ΠΏΠΎΡ‚ΠΎΠΊΠΎΠ²ΠΎΠΉ ΠΏΠ΅Ρ€Π΅Π΄Π°Ρ‡ΠΈ, совмСстимого с сСквСнированиСм ->

Π½Π°ΠΉΡ‚ΠΈ Ρ‚ΠΎ, Ρ‡Ρ‚ΠΎ Π²Ρ‹ Ρ…ΠΎΡ‚ΠΈΡ‚Π΅ -> ΠΎΡΡ‚Π°Π½ΠΎΠ²ΠΈΡ‚ΡŒ Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‡ΠΈΠΉ процСсс сСквСнирования.

3.) Π”Π»ΠΈΠ½Π½Ρ‹Π΅ чтСния ΠΌΠΎΠΆΠ½ΠΎ ΠΈΡΠΏΠΎΠ»ΡŒΠ·ΠΎΠ²Π°Ρ‚ΡŒ Ρ‚Π°ΠΊ ΠΆΠ΅, ΠΊΠ°ΠΊ ΠΈ Π΄Π°Π½Π½Ρ‹Π΅ PacBio, для выдСлСния сборок Π³Π΅Π½ΠΎΠΌΠ° ΠΈ транскриптома (!) ΠΈΠ· ΡΡƒΡ‰Π΅ΡΡ‚Π²ΡƒΡŽΡ‰ΠΈΡ… Π΄Π°Π½Π½Ρ‹Ρ… Illumina.

Π Π°Π±ΠΎΡ‚Π° с любой Π½ΠΎΠ²ΠΎΠΉ Ρ‚Π΅Ρ…Π½ΠΎΠ»ΠΎΠ³ΠΈΠ΅ΠΉ, особСнно ΠΎΡ‚ Π½ΠΎΠ²ΠΎΠΉ ΠΊΠΎΠΌΠΏΠ°Π½ΠΈΠΈ, Ρ‚Ρ€Π΅Π±ΡƒΠ΅Ρ‚ устранСния Π½Π΅ΠΏΠΎΠ»Π°Π΄ΠΎΠΊ. Π₯отя посты Π² Π’Π²ΠΈΡ‚Ρ‚Π΅Ρ€Π΅ β€” это ΠΊΡ€ΡƒΡ‚ΠΎ, ΠΎΠ½ΠΈ, ΠΊΠ°ΠΊ ΠΏΡ€Π°Π²ΠΈΠ»ΠΎ, Π΄Π΅Π»Π°ΡŽΡ‚ ΠΈΡ… ΠΎΡ‡Π΅Π½ΡŒ простыми. БущСствуСт сообщСство MAP для ΠΏΠΎΠ»ΡŒΠ·ΠΎΠ²Π°Ρ‚Π΅Π»Π΅ΠΉ MinION, Π½ΠΎ трСбуСтся Π²Ρ…ΠΎΠ΄ Π² систСму, Π° ΠΏΡƒΠ±Π»ΠΈΡ‡Π½Ρ‹ΠΉ поиск Π½Π΅Π²ΠΎΠ·ΠΌΠΎΠΆΠ΅Π½. По ΡΡ€Π°Π²Π½Π΅Π½ΠΈΡŽ с сСквСнированиСм Illumina ΠΏΠΎΠΊΠ° Π½Π΅ Ρ‚Π°ΠΊ ΠΌΠ½ΠΎΠ³ΠΎ ΠΎΠΏΡ‹Ρ‚Π°.

Благодарности

Π˜Ρ… ΠΎΠ±Ρ‹Ρ‡Π½ΠΎ ΡΠΎΡ…Ρ€Π°Π½ΡΡŽΡ‚ Π² ΠΊΠΎΠ½Ρ†Π΅, Π½ΠΎ, ΠΏΠΎΡΠΊΠΎΠ»ΡŒΠΊΡƒ это Π΄Π»ΠΈΠ½Π½Ρ‹ΠΉ пост Π² Π±Π»ΠΎΠ³Π΅, я ΠΏΠΎΠ΄ΡƒΠΌΠ°Π», Ρ‡Ρ‚ΠΎ Π½Π°Ρ‡Π½Ρƒ с благодарности.

МнС ΠΎΡ‡Π΅Π½ΡŒ ΠΏΠΎΠΌΠΎΠ³Π»ΠΈ сообщСния Π² Π±Π»ΠΎΠ³Π°Ρ… ΠΎΡ‚ ΠšΠΈΡ‚Π° Робисона ΠΈ ΠΎΠ΄ΠΈΠ½ΠΎΠΊΠΎΠ³ΠΎ Π”ΠΆΠΎΠΏΠ°Ρ€ΠΊΠ΅Ρ€Π°. ΠžΠΏΡ‹Ρ‚ Ника Π›ΠΎΠΌΠ°Π½Π° ΠΈ Π”ΠΆΠΎΡˆΠ° ΠšΡƒΠΈΠΊΠ° Ρ‚Π°ΠΊΠΆΠ΅ оказался ΠΏΠΎΠ»Π΅Π·Π½Ρ‹ΠΌ.

Π’Π΅ΠΌ Π½Π΅ ΠΌΠ΅Π½Π΅Π΅, Π½Π΅Ρ‚ Ρ€Π°Π²Π½Ρ‹Ρ… ΠΏΠΎ количСству людСй, с ΠΊΠΎΡ‚ΠΎΡ€Ρ‹ΠΌΠΈ ΠΌΠΎΠΆΠ½ΠΎ Π»ΠΈΡ‡Π½ΠΎ ΠΏΠΎΠ³ΠΎΠ²ΠΎΡ€ΠΈΡ‚ΡŒ ΠΎ тСхничСских ΠΏΡ€ΠΎΠ±Π»Π΅ΠΌΠ°Ρ….

Π—Π° послСдниС нСсколько мСсяцСв МСган ДСннис ΠΈ Майка Малиг ΠΈΠ· ΠšΠ°Π»ΠΈΡ„ΠΎΡ€Π½ΠΈΠΉΡΠΊΠΎΠ³ΠΎ унивСрситСта Π² ДэвисС ΠΎΠΊΠ°Π·Π°Π»ΠΈ Π½Π°ΠΌ ΡƒΠ΄ΠΈΠ²ΠΈΡ‚Π΅Π»ΡŒΠ½ΡƒΡŽ ΠΏΠΎΠ΄Π΄Π΅Ρ€ΠΆΠΊΡƒ, прСдоставив Π»Π°Π±ΠΎΡ€Π°Ρ‚ΠΎΡ€Π½Ρ‹Π΅ помСщСния ΠΈ подСлившись собствСнным ΠΎΠΏΡ‹Ρ‚ΠΎΠΌ Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚Ρ‹ с MinION. Π― ΠΎΡ‡Π΅Π½ΡŒ Π±Π»Π°Π³ΠΎΠ΄Π°Ρ€Π΅Π½ Π·Π° Ρ‚ΠΎ, Ρ‡Ρ‚ΠΎ Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚Π°ΡŽ Π² ΠšΠ°Π»ΠΈΡ„ΠΎΡ€Π½ΠΈΠΉΡΠΊΠΎΠΌ унивСрситСтС Π² ДэвисС ΠΈ с МСган.

Π­Ρ‚Π° ΠΏΠΎΠ΅Π·Π΄ΠΊΠ° стала Π²ΠΎΠ·ΠΌΠΎΠΆΠ½ΠΎΠΉ благодаря ΠΏΠΎΠ΄Π΄Π΅Ρ€ΠΆΠΊΠ΅ ΠΌΠΎΠ΅Π³ΠΎ частного частного Π»ΠΈΡ†Π°, Витуса Π‘Ρ€Π°ΡƒΠ½Π°, ΠΊΠΎΡ‚ΠΎΡ€Ρ‹ΠΉ прСдоставил финансированиС для ΠΌΠΎΠ΅ΠΉ ΠΏΠΎΠ΅Π·Π΄ΠΊΠΈ ΠΈ всСх ΠΏΡ€ΠΎΡ‚ΠΎΡ‡Π½Ρ‹Ρ… ячССк ΠΈ Ρ€Π΅Π°Π³Π΅Π½Ρ‚ΠΎΠ² для сСквСнирования MinION. НСобходимо Π±Ρ‹Π»ΠΎ ΠΈΠΌΠ΅Ρ‚ΡŒ этот Π΄Π²ΡƒΡ…Π½Π΅Π΄Π΅Π»ΡŒΠ½Ρ‹ΠΉ Π±Π»ΠΎΠΊ Π²Ρ€Π΅ΠΌΠ΅Π½ΠΈ, Ρ‡Ρ‚ΠΎΠ±Ρ‹ ΡΠΎΡΡ€Π΅Π΄ΠΎΡ‚ΠΎΡ‡ΠΈΡ‚ΡŒΡΡ Π½ΠΈ Π½Π° Ρ‡Π΅ΠΌ Π΄Ρ€ΡƒΠ³ΠΎΠΌ, ΠΊΡ€ΠΎΠΌΠ΅ ΠΊΠ°ΠΊ Π·Π°ΡΡ‚Π°Π²ΠΈΡ‚ΡŒ MinION Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚Π°Ρ‚ΡŒ, Π·Π°Π΄Π°Π²Π°Ρ‚ΡŒ вопросы ΠΈ Π²Ρ‹ΡΡΠ½ΡΡ‚ΡŒ, Ρ‡Ρ‚ΠΎ Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚Π°Π΅Ρ‚ (Π° Ρ‡Ρ‚ΠΎ Π½Π΅Ρ‚).

Особая Π±Π»Π°Π³ΠΎΠ΄Π°Ρ€Π½ΠΎΡΡ‚ΡŒ Π Π΅Π±Π΅ΠΊΠΊΠ΅ Микол ΠΈ ΠšΠΈΡ€ΡΡ‚Π΅Π½ Π“Ρ€ΠΎΠ½Π΄, ΡΠ»ΡƒΡˆΠ°Ρ‚Π΅Π»ΡΠΌ курса Β«Π Π°Π·Π½ΠΎΠΎΠ±Ρ€Π°Π·ΠΈΠ΅ ΠΌΠΈΠΊΡ€ΠΎΠ±ΠΎΠ²Β» Π·Π° Π²Ρ‹Π΄Π΅Π»Π΅Π½ΠΈΠ΅ ΠΈ ΠΊΡƒΠ»ΡŒΡ‚ΠΈΠ²ΠΈΡ€ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠ΅ ΠΎΡ‡Π΅Π½ΡŒ Ρ…ΠΎΠ»ΠΎΠ΄Π½Ρ‹Ρ… ΠΎΠ±Ρ€Π°Π·Ρ†ΠΎΠ² Π±Π°ΠΊΡ‚Π΅Ρ€ΠΈΠΉ. Π‘ΠΊΠΎΡ‚Ρ‚ Доусон ΠΈΠ· ΠšΠ°Π»ΠΈΡ„ΠΎΡ€Π½ΠΈΠΉΡΠΊΠΎΠ³ΠΎ унивСрситСта Π² ДэвисС (ΠΏΡ€Π΅ΠΏΠΎΠ΄Π°Π²Π°Ρ‚Π΅Π»ΡŒ курса ΠΌΠΈΠΊΡ€ΠΎΠ±Π½ΠΎΠ³ΠΎ разнообразия) сыграл Π²Π°ΠΆΠ½ΡƒΡŽ Ρ€ΠΎΠ»ΡŒ Π² ΠΈΠ·Π²Π»Π΅Ρ‡Π΅Π½ΠΈΠΈ Π”ΠΠš.

ДТСссика ΠœΠΈΡ†Ρ†ΠΈ ΠΏΠΎΠΌΠΎΠ³Π°Π»Π° Π² Ρ€Π°Π·Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚ΠΊΠ΅ ΠΏΡ€ΠΎΡ‚ΠΎΠΊΠΎΠ»Π° ΠΏΠΎΠ΄Π³ΠΎΡ‚ΠΎΠ²ΠΊΠΈ Π±ΠΈΠ±Π»ΠΈΠΎΡ‚Π΅ΠΊΠΈ ΠΈ устранСнии Π½Π΅ΠΏΠΎΠ»Π°Π΄ΠΎΠΊ. Π₯Π°Ρ€Ρ€ΠΈΠ΅Ρ‚ АлСксандСр ΠΏΠΎΠΌΠΎΠ³Π°Π»Π° со сборкой, ΠΏΠΎΠ΄Π³ΠΎΡ‚ΠΎΠ²ΠΊΠΎΠΉ Π±ΠΈΠ±Π»ΠΈΠΎΡ‚Π΅ΠΊΠΈ ΠΈ ΠΏΠΎΠΊΠ°Π·Π°Π»Π° ΠΌΠ½Π΅ Вудс-Π₯ΠΎΡƒΠ», прСкрасноС мСсто для посСщСния. ΠœΡ‹ Ρ‚Π°ΠΊΠΆΠ΅ Π±Π»Π°Π³ΠΎΠ΄Π°Ρ€ΠΈΠΌ MBL Microbial Diversity Course, Π₯ΠΈΠ»Π°Ρ€ΠΈ ΠœΠΎΡ€Ρ€ΠΈΡΠΎΠ½ ΠΈ Π¦Π΅Π½Ρ‚Ρ€ Бэй-Пол Π·Π° прСдоставлСниС Π»Π°Π±ΠΎΡ€Π°Ρ‚ΠΎΡ€Π½Ρ‹Ρ… ΠΏΠΎΠΌΠ΅Ρ‰Π΅Π½ΠΈΠΉ для провСдСния этой Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚Ρ‹.

https://www.flickr.com/photos/lpcohen/28192995104/

Π€Π°ΠΉΠ»Ρ‹: https://github.com/ljcohen/dib_ONP_MinION

Π‘Π»Π°ΠΉΠ΄Ρ‹ ΠΏΡ€Π΅Π·Π΅Π½Ρ‚Π°Ρ†ΠΈΠΈ: https:// Π΄ΠΎΠΊΡƒΠΌΠ΅Π½Ρ‚Ρ‹.Π³ΡƒΠ³Π». com/presentation/d/1Zqd1ayumdZqYc5e8bfeul8-57trKGwGdOFUdPc2-mIU/edit?usp=sharing

Π‘Ρ€Π°Π·Ρƒ послС Π²ΠΈΠ·ΠΈΡ‚Π° Π² Вудс-Π₯ΠΎΡƒΠ» Π² MBL я отправился Π½Π° Π±ΠΈΠΎΠ»ΠΎΠ³ΠΈΡ‡Π΅ΡΠΊΡƒΡŽ ΡΡ‚Π°Π½Ρ†ΠΈΡŽ β€‹β€‹ΠšΠ΅Π»Π»ΠΎΠ³ ΠœΠ“Π£ Π² качСствС ассистСнта ΠΏΠΎ курсу NGS 2016Β ΠΈ написал руководство ΠΏΠΎ Π°Π½Π°Π»ΠΈΠ·Ρƒ ONP. Π΄Π°Π½Π½Ρ‹Π΅:

http://angus.readthedocs.io/en/2016/analyzing_nanopore_data.html

НаконСц-Ρ‚ΠΎ появился Π½ΠΎΠ²Ρ‹ΠΉ @nanopore Mk1B! #micdev2016 @MBLScience cc @ctitusbrown @jessicamizzi @pathogenomenick @Scalene pic. twitter.com/txJBHpkiOI

β€” Π›ΠΈΠ·Π° Коэн (@monsterbashseq) 28 июля 2016 Π³.

Π—Π°ΠΊΡƒΠΏΠΊΠΈ ΠΈ доставка

Π‘ΠΎΠ²Π΅Ρ‚: ΠΏΠΎΠ΄ΠΎΠΆΠ΄ΠΈΡ‚Π΅ 2-3 мСсяца для Π·Π°ΠΊΠ°Π·Π°. ΠœΡ‹ Π·Π°ΠΊΠ°Π·Ρ‹Π²Π°Π»ΠΈ Π·Π° мСсяц Π²ΠΏΠ΅Ρ€Π΅Π΄. Π’ Ρ‚ΠΎ врСмя ΠΊΠ°ΠΊ слуТба ΠΏΠΎΠ΄Π΄Π΅Ρ€ΠΆΠΊΠΈ ΠΊΠ»ΠΈΠ΅Π½Ρ‚ΠΎΠ² ONP, вСроятно, Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚Π°Π»Π° свСрхурочно, Ρ‡Ρ‚ΠΎΠ±Ρ‹ ΠΎΡ‚ΠΏΡ€Π°Π²ΠΈΡ‚ΡŒ наши ΠΏΡ€ΠΎΡ‚ΠΎΡ‡Π½Ρ‹Π΅ ячСйки ΠΈ Mk1B послС Π½Π΅ΡΠΊΠΎΠ»ΡŒΠΊΠΈΡ… элСктронных писСм, Ρ‡Π°Ρ‚ΠΎΠ² ΠΈ Π·Π²ΠΎΠ½ΠΊΠΎΠ² с особыми услугами, Π² Π±ΡƒΠ΄ΡƒΡ‰Π΅ΠΌ нСясно, ΠΌΠΎΠΆΠ΅ΠΌ Π»ΠΈ ΠΌΡ‹ Ρ€Π°ΡΡΡ‡ΠΈΡ‚Ρ‹Π²Π°Ρ‚ΡŒ Π½Π° Π·Π°ΠΏΠ»Π°Π½ΠΈΡ€ΠΎΠ²Π°Π½Π½ΡƒΡŽ доставку со студСнтами. Для связи ΠΏΠΎΡ‚Ρ€Π΅Π±ΠΎΠ²Π°Π»ΠΎΡΡŒ ΠΎΠΊΠΎΠ»ΠΎ Π΄ΡŽΠΆΠΈΠ½Ρ‹ элСктронных писСм, ΠΈ ΠΌΡ‹ Ρ‚Π°ΠΊ ΠΈ Π½Π΅ смогли ΠΏΠΎΠ»ΡƒΡ‡ΠΈΡ‚ΡŒ ΠΏΠΎΠ΄Ρ‚Π²Π΅Ρ€ΠΆΠ΄Π΅Π½ΠΈΠ΅ Ρ‚ΠΎΠ³ΠΎ, Ρ‡Ρ‚ΠΎ ΠΏΡ€ΠΎΡ‚ΠΎΡ‡Π½Ρ‹Π΅ ячСйки Π±ΡƒΠ΄ΡƒΡ‚ доставлСны воврСмя ΠΊ курсу. ΠŸΠΎΠ»ΡƒΡ‡Π°Π΅Ρ‚ΡΡ, Ρ‡Ρ‚ΠΎ наш Π·Π°ΠΊΠ°Π· Π±Ρ‹Π» ΠΎΡ‚ΠΏΡ€Π°Π²Π»Π΅Π½ ΠΈ ΠΏΡ€ΠΈΠ±Ρ‹Π» воврСмя, ΠΎΠ΄Π½Π°ΠΊΠΎ ΠΌΡ‹ Π½Π΅ Π·Π½Π°Π»ΠΈ ΠΎΠ± этом, ΠΏΠΎΡ‚ΠΎΠΌΡƒ Ρ‡Ρ‚ΠΎ Π½Π°ΠΌ Π½Π΅ Π±Ρ‹Π» ΠΎΡ‚ΠΏΡ€Π°Π²Π»Π΅Π½ Ρ‚Ρ€Π΅ΠΊ-Π½ΠΎΠΌΠ΅Ρ€. На ΠΎΡ‚ΠΏΡ€Π°Π²ΠΊΡƒ писСм ΠΏΠΎ элСктронной ΠΏΠΎΡ‡Ρ‚Π΅ ΠΈ ΠΎΠΆΠΈΠ΄Π°Π½ΠΈΠ΅ отслСТивания ящиков ΡƒΡˆΠ»ΠΎ ΠΎΠΊΠΎΠ»ΠΎ дня. К ΡΡ‡Π°ΡΡ‚ΡŒΡŽ, ΠΊΠΎΡ€ΠΎΠ±ΠΊΠΈ ΠΏΡ€Π°Π²ΠΈΠ»ΡŒΠ½ΠΎ Ρ…Ρ€Π°Π½ΠΈΠ»ΠΈΡΡŒ Π½Π° складС MBL.

ΠŸΠΎΡΡ‚ΠΎΡΠ½Π½ΠΎ ΡΠ²ΡΠ·Ρ‹Π²Π°ΠΉΡ‚Π΅ΡΡŒ с ONP. Π‘ΡƒΠ΄ΡŒΡ‚Π΅ Π² курсС ΠΎΡ‚ΠΏΡ€Π°Π²Π»Π΅Π½ΠΈΠΉ, Π·Π°ΠΏΡ€Π°ΡˆΠΈΠ²Π°ΠΉΡ‚Π΅ Π½ΠΎΠΌΠ΅Ρ€Π° для отслСТивания ΠΈ ΠΏΠΎΠ΄Ρ‚Π²Π΅Ρ€ΠΆΠ΄Π΅Π½ΠΈΠ΅ ΠΎΡ‚ΠΏΡ€Π°Π²ΠΊΠΈ. Π£Π·Π½Π°ΠΉΡ‚Π΅, ΠΊΡƒΠ΄Π° доставляСтся посылка, Ρ‚Π°ΠΊ ΠΊΠ°ΠΊ Π²Π²Π΅Π΄Π΅Π½Π½Ρ‹ΠΉ Π²Π°ΠΌΠΈ адрСс ΠΌΠΎΠΆΠ΅Ρ‚ Π½Π΅ ΡΠΎΠ²ΠΏΠ°Π΄Π°Ρ‚ΡŒ с адрСсом, ΡƒΠΊΠ°Π·Π°Π½Π½Ρ‹ΠΌ Π½Π° ΠΊΠΎΡ€ΠΎΠ±ΠΊΠ΅, ΠΈ ваш Π·Π°ΠΊΠ°Π· Π±ΡƒΠ΄Π΅Ρ‚ доставлСн Π½Π΅ Ρ‚ΡƒΠ΄Π°.

ΠŸΡ€ΠΎΡ‚ΠΎΡ‡Π½Ρ‹Π΅ ΠΊΡŽΠ²Π΅Ρ‚Ρ‹

НСмСдлСнно ΠΏΡ€ΠΎΠ²Π΅Ρ€ΡŒΡ‚Π΅ ΠΏΡ€ΠΎΡ‚ΠΎΡ‡Π½Ρ‹Π΅ ΠΊΡŽΠ²Π΅Ρ‚Ρ‹. ΠŸΡƒΠ·Ρ‹Ρ€ΠΈ ΠΏΠ»ΠΎΡ…ΠΈΠ΅:

https://www.flickr.com/photos/lpcohen/27996712883/in/dateposted-friend/

ΠœΡ‹ Π·Π°ΠΊΠ°Π·Π°Π»ΠΈ 7 ΠΏΡ€ΠΎΡ‚ΠΎΡ‡Π½Ρ‹Ρ… ячССк (5 + 2, ΠΊΠΎΡ‚ΠΎΡ€Ρ‹Π΅ ΠΏΠΎΡΡ‚Π°Π²Π»ΡΠ»ΠΈΡΡŒ со стартовым ΠΏΠ°ΠΊΠ΅Ρ‚ΠΎΠΌ). ΠΈΠΌΠ΅Ρ‚ΡŒ нСпостоянныС числа ΠΏΠΎΡ€, Π° Π½Π΅ΠΊΠΎΡ‚ΠΎΡ€Ρ‹Π΅ ΠΏΡ€ΠΈΠ±Ρ‹Π»ΠΈ с ΠΏΡƒΠ·Ρ‹Ρ€ΡŒΠΊΠ°ΠΌΠΈ. Одна проточная ΠΊΡŽΠ²Π΅Ρ‚Π° Π½Π΅ ΠΈΠΌΠ΅Π»Π° ΠΏΠΎΡ€. Нам прислали Π·Π°ΠΌΠ΅Π½Ρƒ этой ΠΏΡ€ΠΎΡ‚ΠΎΡ‡Π½ΠΎΠΉ ΠΊΡŽΠ²Π΅Ρ‚Π΅ Π² Ρ‚Π΅Ρ‡Π΅Π½ΠΈΠ΅ Π½Π΅ΡΠΊΠΎΠ»ΡŒΠΊΠΈΡ… Π΄Π½Π΅ΠΉ, Ρ‡Ρ‚ΠΎ Π±Ρ‹Π»ΠΎ ΠΎΡ‡Π΅Π½ΡŒ ΠΏΠΎΠ»Π΅Π·Π½ΠΎ. Однако для ΠΏΡ€ΠΎΡ‚ΠΎΡ‡Π½Ρ‹Ρ… ячССк, Π² ΠΊΠΎΡ‚ΠΎΡ€Ρ‹Ρ… Π±Ρ‹Π»ΠΈ ΠΏΡƒΠ·Ρ‹Ρ€ΡŒΠΊΠΈ, тСхничСский пСрсонал ONP Π΄Π°Π» ΠΌΠ½Π΅ инструкции Π½Π°Π±Ρ€Π°Ρ‚ΡŒ нСбольшоС количСство Тидкости объСмом 15 ΠΌΠΊΠ», Ρ‡Ρ‚ΠΎΠ±Ρ‹ ΠΏΠΎΠΏΡ‹Ρ‚Π°Ρ‚ΡŒΡΡ ΡƒΠ΄Π°Π»ΠΈΡ‚ΡŒ ΠΏΡƒΠ·Ρ‹Ρ€ΡŒ, Π° Π·Π°Ρ‚Π΅ΠΌ снова ΠΊΠΎΠ½Ρ‚Ρ€ΠΎΠ»ΡŒ качСства. Π­Ρ‚ΠΎ Π½Π΅ сработало. ΠŸΡ€ΠΎΠΈΠ·Π²ΠΎΠ΄ΠΈΡ‚Π΅Π»ΡŒΠ½ΠΎΡΡ‚ΡŒ этих ΠΏΡ€ΠΎΡ‚ΠΎΡ‡Π½Ρ‹Ρ… ячССк Π½Π΅ ΠΎΠΏΡ€Π°Π²Π΄Π°Π»Π° Π½Π°ΡˆΠΈΡ… ΠΎΠΆΠΈΠ΄Π°Π½ΠΈΠΉ.

ΠŸΡ€ΠΈ ΠΎΠ±Ρ‰Π΅Π½ΠΈΠΈ с ΠΊΠΎΠΌΠΏΠ°Π½ΠΈΠ΅ΠΉ Π½Π°ΠΌ сказали, Ρ‡Ρ‚ΠΎ Π½Π° ΠΏΡ€ΠΎΡ‚ΠΎΡ‡Π½Ρ‹Π΅ ячСйки Π½Π΅ распространяСтся гарантия.

Экстракция Π”ΠΠš

Π’ ΠΏΡ€ΠΎΡ‚ΠΎΠΊΠΎΠ»Π΅ ONP ΡƒΠΊΠ°Π·Π°Π½ΠΎ, Ρ‡Ρ‚ΠΎ для ΡƒΡΠΏΠ΅ΡˆΠ½ΠΎΠΉ ΠΏΠΎΠ΄Π³ΠΎΡ‚ΠΎΠ²ΠΊΠΈ Π±ΠΈΠ±Π»ΠΈΠΎΡ‚Π΅ΠΊΠΈ трСбуСтся Π½Π΅ ΠΌΠ΅Π½Π΅Π΅ 500–1000 Π½Π³ чистой Π”ΠΠš. ΠŸΠΎΠΏΡ€ΠΎΠ±ΡƒΠΉΡ‚Π΅ ΡΡ‚Ρ€Π΅ΠΌΠΈΡ‚ΡŒΡΡ ΠΊ Π±ΠΎΠ»ΡŒΡˆΠ΅ΠΌΡƒ, Ρ‡Π΅ΠΌ это. ΠŸΠΎΡΡ‚Π°Ρ€Π°ΠΉΡ‚Π΅ΡΡŒ ΠΏΠΎΠ»ΡƒΡ‡ΠΈΡ‚ΡŒ ΠΊΠ°ΠΊ ΠΌΠΎΠΆΠ½ΠΎ большС Π”ΠΠš с максимально высокой молСкулярной массой. Π‘ΡƒΠ΄ΡŒΡ‚Π΅ остороТны со своСй Π”ΠΠš. НС ΡΠΌΠ΅ΡˆΠΈΠ²Π°ΠΉΡ‚Π΅ Тидкости ΠΏΠΈΠΏΠ΅Ρ‚ΠΈΡ€ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠ΅ΠΌ. Π‘ΠΊΠΎΡ‚Ρ‚ Доусон Ρ€Π΅ΠΊΠΎΠΌΠ΅Π½Π΄ΠΎΠ²Π°Π» для очистки Π±Π°ΠΊΡ‚Π΅Ρ€ΠΈΠ°Π»ΡŒΠ½Ρ‹Ρ… изолятов ΠΈΠ· ΠΆΠΈΠ΄ΠΊΠΎΠΉ ΠΊΡƒΠ»ΡŒΡ‚ΡƒΡ€Ρ‹ ΠΈΡΠΏΠΎΠ»ΡŒΠ·ΠΎΠ²Π°Ρ‚ΡŒ ΡΠΊΡΠΊΠ»ΡŽΠ·ΠΈΠΎΠ½Π½Ρ‹Π΅ ΠΊΠΎΠ»ΠΎΠ½ΠΊΠΈ Qiagen, ΠΈ Π½Π°ΠΌ это ΠΎΡ‡Π΅Π½ΡŒ ΠΏΠΎΠΌΠΎΠ³Π»ΠΎ. ΠœΡ‹ Π½Π°Ρ‡Π°Π»ΠΈ с ~ 2000 ΠΌΠΊΠ³ ΠΈ использовали этап восстановлСния FFPE.

ΠŸΡ€ΠΎΡ‚ΠΎΠΊΠΎΠ» ONP Π²ΠΊΠ»ΡŽΡ‡Π°Π΅Ρ‚ ΠΎΠ±Ρ€Π΅Π·ΠΊΡƒ с ΠΏΠΎΠΌΠΎΡ‰ΡŒΡŽ Covaris gtube Π΄ΠΎ 8kb. Когда я ΠΈΡΠΊΠ»ΡŽΡ‡ΠΈΠ» этот шаг, Ρ‡Ρ‚ΠΎΠ±Ρ‹ ΡΠΎΡ…Ρ€Π°Π½ΠΈΡ‚ΡŒ Π±ΠΎΠ»Π΅Π΅ Π΄Π»ΠΈΠ½Π½Ρ‹Π΅ Π½ΠΈΡ‚ΠΈ, Π²Ρ‹Ρ…ΠΎΠ΄ Π±Ρ‹Π» практичСски Π½ΡƒΠ»Π΅Π²Ρ‹ΠΌ, Π° ΠΎΠ±Ρ€Π°Π·Ρ†Ρ‹ с Π°Π΄Π΅ΠΊΠ²Π°Ρ‚Π½Ρ‹ΠΌ Π²Ρ‹Ρ…ΠΎΠ΄ΠΎΠΌ ΠΈΠΌΠ΅Π»ΠΈ ΠΏΠ»ΠΎΡ…ΠΈΠ΅ Ρ€Π΅Π·ΡƒΠ»ΡŒΡ‚Π°Ρ‚Ρ‹ сСквСнирования. ΠŸΡ€ΠΈ ΠΎΠ±Ρ‰Π΅Π½ΠΈΠΈ с ONP ΠΏΠΎ этому ΠΏΠΎΠ²ΠΎΠ΄Ρƒ ΠΌΡ‹ Π·Π°ΠΏΠΎΠ΄ΠΎΠ·Ρ€ΠΈΠ»ΠΈ, Ρ‡Ρ‚ΠΎ пряди ΡΡ€Π΅Π·Π°Π»ΠΈΡΡŒ сами ΠΏΠΎ сСбС Π³Π΄Π΅-Ρ‚ΠΎ Π²ΠΎ врСмя мноТСствСнных Ρ€Π΅Π°ΠΊΡ†ΠΈΠΉ, Π·Π°Ρ‚Π΅ΠΌ ΠΈΡ… Π»ΠΈΠ±ΠΎ смывало Π½Π° этапах очистки бусинок, Π»ΠΈΠ±ΠΎ срСзали Π°Π΄Π°ΠΏΡ‚Π΅Ρ€Ρ‹ ΡˆΠ½ΡƒΡ€Π° ΠΈ шпильки, поэтому пряди Π½Π΅ Ρ€Π°ΡΠΏΠΎΠ·Π½Π°Π²Π°Π»ΠΈΡΡŒ. ΠΏΠΎ ΠΏΠΎΡ€Π°ΠΌ.

ΠœΡ‹ сСквСнировали всС Ρ‚Ρ€ΠΈ ΠΏΡ€ΠΈΠ²Π΅Π΄Π΅Π½Π½Ρ‹Ρ… Π½ΠΈΠΆΠ΅ Π½Π°Π±ΠΎΡ€Π° Π”ΠΠšΒ (лСстница 1–10Β ΠΊΠ±). Π’ ΠΏΡ€Π΅ΠΏΠ°Ρ€Π°Ρ‚Π΅ МаксвСлла (гСль Π½ΠΈΠΆΠ΅ слСва) Π±Ρ‹Π»ΠΎ ΠΏΡ€ΠΈΠ»ΠΈΡ‡Π½ΠΎΠ΅ количСство Π±ΠΈΠ±Π»ΠΈΠΎΡ‚Π΅ΠΊΠΈ, Π½ΠΎ Π΄Π»ΠΈΠ½Π° чтСния сСквСнирования Π±Ρ‹Π»Π° Π½Π΅ Ρ‚Π°ΠΊΠΎΠΉ большой, ΠΊΠ°ΠΊ Ρ…ΠΎΡ‚Π΅Π»ΠΎΡΡŒ Π±Ρ‹, Ρ‡Ρ‚ΠΎ ΠΈΠΌΠ΅Π΅Ρ‚ смысл, учитывая Π²ΠΈΠ΄ΠΈΠΌΡ‹Π΅ нСбольшиС Ρ€Π°Π·ΠΌΡ‹Ρ‚Ρ‹Π΅ полосы. (статистичСский ΠΎΡ‚Ρ‡Π΅Ρ‚)

ΠŸΠΎΠ΄Π³ΠΎΡ‚ΠΎΠ²ΠΊΠ° Π±ΠΈΠ±Π»ΠΈΠΎΡ‚Π΅ΠΊΠΈ

Когда ΠΌΡ‹ Π²ΠΏΠ΅Ρ€Π²Ρ‹Π΅ Π½Π°Ρ‡Π°Π»ΠΈ устранСниС Π½Π΅ΠΏΠΎΠ»Π°Π΄ΠΎΠΊ MinION, Π² Π»Π°Π±ΠΎΡ€Π°Ρ‚ΠΎΡ€ΠΈΠΈ Π±Ρ‹Π»ΠΎ Ρ‚Ρ€ΡƒΠ΄Π½ΠΎ ΡΠ»Π΅Π΄ΠΎΠ²Π°Ρ‚ΡŒ ΠΏΡ€ΠΎΡ‚ΠΎΠΊΠΎΠ»Π°ΠΌ, доступным Ρ‡Π΅Ρ€Π΅Π· MAP. Нам Π½ΡƒΠΆΠ΅Π½ Π±Ρ‹Π» лист, Ρ‡Ρ‚ΠΎΠ±Ρ‹ просто Ρ€Π°ΡΠΏΠ΅Ρ‡Π°Ρ‚Π°Ρ‚ΡŒ ΠΈ ΡΠ»Π΅Π΄ΠΎΠ²Π°Ρ‚ΡŒ со скамСйки, поэтому ΠΌΡ‹ создали это:

https://docs.google.com/document/d/1evxayjfru96_cawbepccccc7rfrv_zm1ludscza8lwcu/edit?usp=sharing

НСсколько мСсяцСв Π½Π°Π·Π°Π΄, onp Π²Ρ‹ΡˆΠ΅Π» с ΠΊΠΎΠ½Ρ‚Ρ€ΠΎΠ»Π΅ΠΌ PDF для Π±ΠΈΠ±Π»ΠΈΠΎΡ‚Π΅ΠΊΠΈ, ΠΊΠΎΡ‚ΠΎΡ€Ρ‹ΠΉ ΠΎΡ‚Π»ΠΈΡ‡Π½Ρ‹ΠΉ:

ONP_MinION_lib_prep_protocol_SQK-NSK007.pdf

ΠŸΠΎΠ΄Π³ΠΎΡ‚ΠΎΠ²ΠΊΠ° Π±ΠΈΠ±Π»ΠΈΠΎΡ‚Π΅ΠΊΠΈ довольно проста. Одна ваТная Π²Π΅Ρ‰ΡŒ, ΠΊΠΎΡ‚ΠΎΡ€ΡƒΡŽ я ΡƒΠ·Π½Π°Π» ΠΎ NEB Blunt/TA Master Mix:

Π’ΠΎΡ‚ грустный ΠΌΠΎΠΌΠ΅Π½Ρ‚, ΠΊΠΎΠ³Π΄Π° Π²Ρ‹ ΠΏΠΎΠ½ΠΈΠΌΠ°Π΅Ρ‚Π΅, Ρ‡Ρ‚ΠΎ Ρ‡Ρ‚ΠΎ-Ρ‚ΠΎ являСтся Π½Π΅Π·Π°ΠΏΠ»Π°Π½ΠΈΡ€ΠΎΠ²Π°Π½Π½Ρ‹ΠΌ, нСизвСстным ΠΎΠ³Ρ€Π°Π½ΠΈΡ‡ΠΈΠ²Π°ΡŽΡ‰ΠΈΠΌ Ρ€Π΅Π°Π³Π΅Π½Ρ‚ΠΎΠΌ @nanopore @NEBiolabs pic. twitter.com/VbcgKMYMuC

β€” Π›ΠΈΠ·Π° Коэн (@monsterbashseq) 2 августа 2016 Π³.

ΠŸΠΎΠ΄Π³ΠΎΡ‚ΠΎΠ²ΠΊΠ° Π±ΠΈΠ±Π»ΠΈΠΎΡ‚Π΅ΠΊΠΈ ΠΈ Π·Π°Π³Ρ€ΡƒΠ·ΠΊΠ° ΠΎΠ±Ρ€Π°Π·Ρ†ΠΎΠ² Π² ΠΏΡ€ΠΎΡ‚ΠΎΡ‡Π½ΡƒΡŽ ΠΊΡŽΠ²Π΅Ρ‚Ρƒ ΠΌΠΎΠ³ΡƒΡ‚ Π±Ρ‹Ρ‚ΡŒ слоТными ΠΈ Π½Π΅Ρ€Π²Π½Ρ‹ΠΌΠΈ для Ρ‚Π΅Ρ…, ΠΊΡ‚ΠΎ Π½Π΅ ΡƒΠΌΠ΅Π΅Ρ‚ Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚Π°Ρ‚ΡŒ Π² Π»Π°Π±ΠΎΡ€Π°Ρ‚ΠΎΡ€ΠΈΠΈ. Π£ мСня Π±ΠΎΠ»Π΅Π΅ 4 Π»Π΅Ρ‚ ΠΎΠΏΡ‹Ρ‚Π° Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚Ρ‹ Π² молСкулярной Π»Π°Π±ΠΎΡ€Π°Ρ‚ΠΎΡ€ΠΈΠΈ, я знаю, ΠΊΠ°ΠΊ ΠΎΠ±Ρ€Π°Ρ‰Π°Ρ‚ΡŒΡΡ с Ρ€Π΅Π°Π³Π΅Π½Ρ‚Π°ΠΌΠΈ, быстро Π²Ρ€Π°Ρ‰Π°Ρ‚ΡŒ, ΠΏΠΈΠΏΠ΅Ρ‚ΠΈΡ€ΠΎΠ²Π°Ρ‚ΡŒ нСбольшиС ΠΎΠ±ΡŠΠ΅ΠΌΡ‹, ΠΊΠ°ΠΊ Π±Ρ‹Ρ‚ΡŒ остороТным, Ρ‡Ρ‚ΠΎΠ±Ρ‹ Π½Π΅ Ρ‚Ρ€Π°Ρ‚ΠΈΡ‚ΡŒ Ρ€Π΅Π°Π³Π΅Π½Ρ‚Ρ‹ Π²ΠΏΡƒΡΡ‚ΡƒΡŽ. Π’Π΅ΠΌ, ΠΊΡ‚ΠΎ Π½Π΅ часто занимаСтся молСкулярными Π»Π°Π±ΠΎΡ€Π°Ρ‚ΠΎΡ€Π½Ρ‹ΠΌΠΈ исслСдованиями, слСдуСт ΠΎΠ±Ρ€Π°Ρ‚ΠΈΡ‚ΡŒ Π²Π½ΠΈΠΌΠ°Π½ΠΈΠ΅ Π½Π° вязкиС, Π»ΠΈΠΏΠΊΠΈΠ΅ смСси Ρ„Π΅Ρ€ΠΌΠ΅Π½Ρ‚ΠΎΠ², ΠΊΠΎΡ‚ΠΎΡ€Ρ‹Π΅ входят Π² состав Π³Π»ΠΈΡ†Π΅Ρ€ΠΈΠ½Π°. Π’Ρ‹ Π΄ΡƒΠΌΠ°Π΅Ρ‚Π΅, Ρ‡Ρ‚ΠΎ высасываСтС ΠΎΠΏΡ€Π΅Π΄Π΅Π»Π΅Π½Π½Ρ‹ΠΉ объСм, Π½ΠΎ , Ρ€Π°Π²Π½ΠΎΠ΅ количСству , часто ΠΏΡ€ΠΈΠ»ΠΈΠΏΠ°Π΅Ρ‚ ΠΊ внСшнСй сторонС Π½Π°ΠΊΠΎΠ½Π΅Ρ‡Π½ΠΈΠΊΠ° ΠΏΠΈΠΏΠ΅Ρ‚ΠΊΠΈ. Π’Ρ‹ Π΄ΠΎΠ»ΠΆΠ½Ρ‹ Π²Ρ‹Ρ‚Π΅Ρ€Π΅Ρ‚ΡŒ Π΅Π³ΠΎ сбоку ΠΏΡ€ΠΎΠ±ΠΈΡ€ΠΊΠΈ, Ρ‡Ρ‚ΠΎΠ±Ρ‹ ΡΠ½ΡΡ‚ΡŒ Π΅Π³ΠΎ, Ρ‡Ρ‚ΠΎΠ±Ρ‹ Π½Π΅ Π΄ΠΎΠ±Π°Π²Π»ΡΡ‚ΡŒ Π΅Π³ΠΎ Π² свой объСм rxn, измСняя ΠΎΠΏΡ‚ΠΈΠΌΠ°Π»ΡŒΠ½ΡƒΡŽ ΠΊΠΎΠ½Ρ†Π΅Π½Ρ‚Ρ€Π°Ρ†ΠΈΡŽ ΠΈ (вСроятно, самоС Π²Π°ΠΆΠ½ΠΎΠ΅) Ρ‚Π°ΠΊΠΆΠ΅ тратя Ρ€Π΅Π°Π³Π΅Π½Ρ‚.

ΠŸΡ€ΠΎΡ‡Π΅Π΅ ΠΏΡ€ΠΎΡ‡Π΅Π΅ совСт:

  • РасчСт: M1V1 = M2V2 ваш Π΄Ρ€ΡƒΠ³.
  • НС ΡΠΌΠ΅ΡˆΠΈΠ²Π°ΠΉΡ‚Π΅ ΠΏΠΈΠΏΠ΅Ρ‚ΠΊΠΎΠΉ.
  • ВмСсто этого остороТно постукивайтС ΠΏΠΎ Ρ‚Ρ€ΡƒΠ±ΠΊΠ΅ ΠΈΠ»ΠΈ Π΄Π΅Ρ€Π³Π°ΠΉΡ‚Π΅ Π΅Π΅.
  • Часто ΠΏΡ€ΠΎΠΊΡ€ΡƒΡ‡ΠΈΠ²Π°ΠΉΡ‚Π΅ ΠΏΡ€ΠΎΠ±ΠΈΡ€ΠΊΠΈ, Ρ‡Ρ‚ΠΎΠ±Ρ‹ ΡƒΠ±Π΅Π΄ΠΈΡ‚ΡŒΡΡ, Ρ‡Ρ‚ΠΎ ΠΆΠΈΠ΄ΠΊΠΎΡΡ‚ΡŒ собираСтся Π½Π° Π΄Π½Π΅.
  • ΠžΡ‡ΠΈΡΡ‚ΠΊΠ° ΡˆΠ°Ρ€ΠΈΠΊΠΎΠ² Ρ‚Ρ€Π΅Π±ΡƒΠ΅Ρ‚ тСрпСния ΠΈ остороТности ΠΏΡ€ΠΈ ΠΏΠΈΠΏΠ΅Ρ‚ΠΈΡ€ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠΈ.
  • Π‘ΡƒΠ΄ΡŒΡ‚Π΅ Π°ΠΊΠΊΡƒΡ€Π°Ρ‚Π½Ρ‹ со своими ΠΏΡ€ΠΎΠ±ΠΈΡ€ΠΊΠ°ΠΌΠΈ (ΠΏΠΎΡΠΊΠΎΠ»ΡŒΠΊΡƒ Π΅ΡΡ‚ΡŒ нСсколько ΠΏΡ€ΠΎΠ±ΠΈΡ€ΠΎΠΊ с Ρ€Π΅Π°Π³Π΅Π½Ρ‚Π°ΠΌΠΈ, ΠΊΠΎΡ‚ΠΎΡ€Ρ‹Π΅ выглядят ΠΎΠ΄ΠΈΠ½Π°ΠΊΠΎΠ²ΠΎ). Π˜ΡΠΏΠΎΠ»ΡŒΠ·ΡƒΠΉΡ‚Π΅ ΠΊΠΎΠ½Ρ‚Ρ€ΠΎΠ»ΡŒΠ½Ρ‹ΠΉ список ΠΈ Π²Ρ‹Ρ‡Π΅Ρ€ΠΊΠΈΠ²Π°ΠΉΡ‚Π΅ ΠΊΠ°ΠΆΠ΄Ρ‹ΠΉ Ρ€Π°Π·, ΠΊΠΎΠ³Π΄Π° Π²Ρ‹ добавляСтС Ρ€Π΅Π°Π³Π΅Π½Ρ‚.

Π­Ρ‚ΠΎ Ρ‚ΠΎ, Ρ‡Ρ‚ΠΎ я ΡΡ‡ΠΈΡ‚Π°ΡŽ само собой Ρ€Π°Π·ΡƒΠΌΠ΅ΡŽΡ‰ΠΈΠΌΡΡ, ΠΊΠΎΠ³Π΄Π° рСгулярно Π²Ρ‹ΠΏΠΎΠ»Π½ΡΡŽ Π»Π°Π±ΠΎΡ€Π°Ρ‚ΠΎΡ€Π½ΡƒΡŽ Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚Ρƒ. ВрСбуСтся Π½Π΅ΠΊΠΎΡ‚ΠΎΡ€ΠΎΠ΅ врСмя, Ρ‡Ρ‚ΠΎΠ±Ρ‹ Π²ΡΠΏΠΎΠΌΠ½ΠΈΡ‚ΡŒ, ΠΊΠΎΠ³Π΄Π° я снова Π½Π°Ρ…ΠΎΠΆΡƒΡΡŒ Π² Π»Π°Π±ΠΎΡ€Π°Ρ‚ΠΎΡ€ΠΈΠΈ послС ΠΏΠ΅Ρ€Π΅Ρ€Ρ‹Π²Π° для Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚Ρ‹ Π½Π°Π΄ ΠΏΡ€ΠΎΠ΅ΠΊΡ‚Π°ΠΌΠΈ, ΠΎΡ€ΠΈΠ΅Π½Ρ‚ΠΈΡ€ΠΎΠ²Π°Π½Π½Ρ‹ΠΌΠΈ Π½Π° вычислСния.

https://www.flickr.com/photos/lpcohen/28040963554/in/dateposted-friend/

АппаратноС обСспСчСниС ΠΊΠΎΠΌΠΏΡŒΡŽΡ‚Π΅Ρ€Π°

Π’ октябрС 2015 Π³ΠΎΠ΄Π° ΠΏΡ€ΠΎΡˆΠ»ΠΎΠ³ΠΎ Π³ΠΎΠ΄Π°, ΠΊΠΎΠ³Π΄Π° ΠΌΡ‹ Π·Π°ΠΊΠ°Π·Ρ‹Π²Π°Π»ΠΈ всС Π½Π΅ΠΎΠ±Ρ…ΠΎΠ΄ΠΈΠΌΠΎΠ΅ для установки, трСбования ΠΊ ΠΊΠΎΠΌΠΏΡŒΡŽΡ‚Π΅Ρ€Π½ΠΎΠΌΡƒ ΠΎΠ±ΠΎΡ€ΡƒΠ΄ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΡŽ для MinION Π±Ρ‹Π»ΠΈ ΡΠ»Π΅Π΄ΡƒΡŽΡ‰ΠΈΠΌΠΈ: 8 Π“Π‘ ΠΎΠΏΠ΅Ρ€Π°Ρ‚ΠΈΠ²Π½ΠΎΠΉ памяти ΠΈ 128-Π΄ΡŽΠΉΠΌΠΎΠ²Ρ‹ΠΉ ТСсткий диск SSD с процСссором i7. Π’ΠΎΡ‚ Ρ‡Ρ‚ΠΎ ΠΌΡ‹ Π² ΠΈΡ‚ΠΎΠ³Π΅ Π·Π°ΠΊΠ°Π·Π°Π»ΠΈ (Ρ‡Ρ‚ΠΎ заняло нСсколько нСдСль ΠΏΠΎ ΡΠΏΠ΅Ρ†ΠΈΠ°Π»ΡŒΠ½ΠΎΠΌΡƒ Π·Π°ΠΊΠ°Π·Ρƒ ΠΈΠ· ΠΊΠΎΠΌΠΏΡŒΡŽΡ‚Π΅Ρ€Π½ΠΎΠ³ΠΎ тСхничСского Ρ†Π΅Π½Ρ‚Ρ€Π° ΠšΠ°Π»ΠΈΡ„ΠΎΡ€Π½ΠΈΠΉΡΠΊΠΎΠ³ΠΎ унивСрситСта Π² ДэвисС):

DH Π”Π΅Ρ‚Π°Π»ΡŒ β„–: F1M35UT ΠŸΡ€ΠΎΠΈΠ·Π²ΠΎΠ΄ΠΈΡ‚Π΅Π»ΡŒ: HP β„– производитСля: F1M35UT#ABA Мобильная рабочая станция HP ZBook 15 G2 15,6β€³ со свСтодиодной подсвСткой Intel Core i7 i74810MQ Quadcore (4 ядра) 2,80 Π“Π“Ρ† 8 Π“Π‘ DDR3L SDRAM RAM 256 Π“Π‘ SSD DVDWriter NVIDIA Quadro K1100M 2 Π“Π‘ Windows 7 Professional, 64-разрядная (английская), с Π²ΠΎΠ·ΠΌΠΎΠΆΠ½ΠΎΡΡ‚ΡŒΡŽ обновлСния Π΄ΠΎ Windows 8.1 Pro 19ДисплСй 20 x 1080 16:9 Bluetooth Английская ΠΊΠ»Π°Π²ΠΈΠ°Ρ‚ΡƒΡ€Π° БСспроводная локальная ΡΠ΅Ρ‚ΡŒ Π’Π΅Π±-ΠΊΠ°ΠΌΠ΅Ρ€Π° ВсСго 4 ΠΏΠΎΡ€Ρ‚Π° USB 3 ΠΏΠΎΡ€Ρ‚Π° USB 3.0 Π‘Π΅Ρ‚Π΅Π²ΠΎΠΉ (RJ45) ΠšΠΎΠΌΠ±ΠΈΠ½ΠΈΡ€ΠΎΠ²Π°Π½Π½Ρ‹ΠΉ ΠΏΠΎΡ€Ρ‚ для Π½Π°ΡƒΡˆΠ½ΠΈΠΊΠΎΠ²/ΠΌΠΈΠΊΡ€ΠΎΡ„ΠΎΠ½Π°

Для ΠΎΠ΄Π½ΠΎΠ³ΠΎ запуска трСбуСтся ΠΎΠΊΠΎΠ»ΠΎ 30-50 Π“Π‘, Π² зависимости ΠΎΡ‚ качСства Π±Π΅Π³Π°Ρ‚ΡŒ. Π€Π°ΠΉΠ»Ρ‹ .fast5 ΠΈΠΌΠ΅ΡŽΡ‚ большой Ρ€Π°Π·ΠΌΠ΅Ρ€, нСсмотря Π½Π° Ρ‚ΠΎ, Ρ‡Ρ‚ΠΎ Ρ€Π΅Π·ΡƒΠ»ΡŒΡ‚ΠΈΡ€ΡƒΡŽΡ‰ΠΈΠ΅ Ρ„Π°ΠΉΠ»Ρ‹ .fastq ΠΈΠΌΠ΅ΡŽΡ‚ нСбольшой Ρ€Π°Π·ΠΌΠ΅Ρ€ (<1 Π“Π‘). ОбъСм ТСсткого диска Π½Π° нашСм Π½ΠΎΡƒΡ‚Π±ΡƒΠΊΠ΅ MinION составляСт 256 Π“Π‘, ΠΈ Π΅Π³ΠΎ ΠΌΠΎΠΆΠ½ΠΎ быстро Π·Π°ΠΏΠΎΠ»Π½ΠΈΡ‚ΡŒ. ΠœΡ‹ ΠΊΡƒΠΏΠΈΠ»ΠΈ внСшний ТСсткий диск Π΅ΠΌΠΊΠΎΡΡ‚ΡŒΡŽ 2 Π’Π‘, Π½Π° ΠΊΠΎΡ‚ΠΎΡ€Ρ‹ΠΉ ΠΌΡ‹ ΠΌΠΎΠΆΠ΅ΠΌ Π½Π°ΡΡ‚Ρ€ΠΎΠΈΡ‚ΡŒ Metrichor для Π·Π°Π³Ρ€ΡƒΠ·ΠΊΠΈ чтСния послС Π±Π°Π·ΠΎΠ²ΠΎΠ³ΠΎ Π²Ρ‹Π·ΠΎΠ²Π°, сэкономив мСсто Π½Π° ТСстком дискС Π½ΠΎΡƒΡ‚Π±ΡƒΠΊΠ°.

ΠŸΡ€ΠΎΠ³Ρ€Π°ΠΌΠΌΠ½ΠΎΠ΅ обСспСчСниС ΠΈ Π΄Π°Π½Π½Ρ‹Π΅

  • Windows отстой
  • Π’ послСдниС мСсяцы появился Π½ΠΎΠ²Ρ‹ΠΉ GUI (графичСский ΠΏΠΎΠ»ΡŒΠ·ΠΎΠ²Π°Ρ‚Π΅Π»ΡŒΡΠΊΠΈΠΉ интСрфСйс) для MinKnow. ΠŸΡ€ΠΈΠ²Ρ‹ΠΊΠ°Ρ‚ΡŒ ΠΊ этому нСприятно, Π½ΠΎ Π² Ρ†Π΅Π»ΠΎΠΌ Π½Π΅ΠΏΠ»ΠΎΡ…ΠΎ.
  • ΠŸΡ€ΠΎΠ³Ρ€Π°ΠΌΠΌΠ½ΠΎΠ΅ обСспСчСниС Poretools для прСобразования .fast5 Π² .fastq содСрТит ошибки Π² Windows ΠΈ ΠΏΠ»ΠΎΡ…ΠΎ Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚Π°Π΅Ρ‚ с MinKnow. ВСроятно, Π΅ΡΡ‚ΡŒ способ Π·Π°ΡΡ‚Π°Π²ΠΈΡ‚ΡŒ ΠΈΡ… ΠΎΠ±ΠΎΠΈΡ… Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚Π°Ρ‚ΡŒ, Π½ΠΎ я ΡƒΠΆΠ΅ ΠΏΠΎΡ‚Ρ€Π°Ρ‚ΠΈΠ» ~ 2–4 часа Π½Π° устранСниС этой ΠΏΡ€ΠΎΠ±Π»Π΅ΠΌΡ‹, поэтому Π½Π° этом ΠΏΠΎΠΊΠ° ΠΏΠΎΠΊΠΎΠ½Ρ‡ΠΈΠ». ВмСсто этого ΠΌΡ‹ Π·Π°Π³Ρ€ΡƒΠΆΠ°Π»ΠΈ .fast5 Π½Π° сСрвСр Linux, Π° Π·Π°Ρ‚Π΅ΠΌ запускали Ρ‚Π°ΠΌ инструмСнты ΠΏΠΎΡ€.
  • Python-скрипты MinKnow ΠΈΠ½ΠΎΠ³Π΄Π° Π°Π²Π°Ρ€ΠΈΠΉΠ½ΠΎ Π·Π°Π²Π΅Ρ€ΡˆΠ°ΡŽΡ‚ Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚Ρƒ Π²ΠΎ врСмя выполнСния! Π’Ρ‹ ΠΌΠΎΠΆΠ΅Ρ‚Π΅ снова ΠΎΡ‚ΠΊΡ€Ρ‹Ρ‚ΡŒ ΠΏΡ€ΠΎΠ³Ρ€Π°ΠΌΠΌΠ½ΠΎΠ΅ обСспСчСниС MinKnow, снова Π·Π°ΠΏΡƒΡΡ‚ΠΈΡ‚ΡŒ сцСнарий, ΠΈ ΠΎΠ½ Π΄ΠΎΠ»ΠΆΠ΅Π½ Π½Π°Ρ‡Π°Ρ‚ΡŒ Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚Ρƒ с Ρ‚ΠΎΠ³ΠΎ мСста, Π³Π΄Π΅ остановился.
  • Π˜ΡΠΏΠΎΠ»ΡŒΠ·ΡƒΠΉΡ‚Π΅ 48-часовой сцСнарий MinKnow для сСквСнирования.
  • Наш ΠΏΠΎΡ‚ΠΎΠΊ Π΄Π°Π½Π½Ρ‹Ρ… ΠΈΠ΄Π΅Ρ‚ ΠΎΡ‚ Π½Π΅ΠΎΠ±Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚Π°Π½Π½ΠΎΠ³ΠΎ сигнала ΠΎΡ‚ MinION ( Π½ΠΎΡƒΡ‚Π±ΡƒΠΊ ) -> Π·Π°Π³Ρ€ΡƒΠ·ΠΊΠ° Π½Π° сСрвСр Metricor для Π±Π°Π·ΠΎΠ²ΠΎΠ³ΠΎ Π²Ρ‹Π·ΠΎΠ²Π° -> Π·Π°Π³Ρ€ΡƒΠ·ΠΊΠ° Π½Π° внСшний ТСсткий диск (Β«ΠΏΡ€ΠΎΠΉΠ΄Π΅Π½ΠΎΒ» ΠΈΠ»ΠΈ Β«Π½Π΅ ΠΏΡ€ΠΎΠΉΠ΄Π΅Π½ΠΎΒ» Π² зависимости ΠΎΡ‚ Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‡Π΅Π³ΠΎ процСсса Metrichor Π²Ρ‹Π±Ρ€Π°Π½Π½Ρ‹ΠΉ, Π½Π°ΠΏΡ€ΠΈΠΌΠ΅Ρ€, 1D ΠΈΠ»ΠΈ 2D ΠΈΠ»ΠΈ ΡˆΡ‚Ρ€ΠΈΡ…-ΠΊΠΎΠ΄) -> ΠΏΠΎΠ΄ΠΊΠ»ΡŽΡ‡ΠΈΡ‚ΡŒ внСшний ТСсткий диск ΠΊ Π½ΠΎΡƒΡ‚Π±ΡƒΠΊΡƒ с Linux ΠΈΠ»ΠΈ Linux (ΠΏΠΎ ΠΊΠ°ΠΊΠΎΠΉ-Ρ‚ΠΎ ΠΏΡ€ΠΈΡ‡ΠΈΠ½Π΅ это ΠΏΡ€ΠΎΡ‰Π΅ Π½Π° Π½ΠΎΡƒΡ‚Π±ΡƒΠΊΠ΅ с Linux, Ρ‡Π΅ΠΌ с Windows…) для ΠΏΠ΅Ρ€Π΅Π΄Π°Ρ‡ΠΈ Π½Π° Π‘Π΅Ρ€Π²Π΅Ρ€ Linux -> Π½Π° сСрвСрС Linux запуститС ПО Poretools для прСобразования Π² fastq/fasta -> Π°Π½Π°Π»ΠΈΠ·
  • ВсС это каТСтся ΠΊΠ°ΠΊΠΈΠΌ-Ρ‚ΠΎ Π½Π΅Π»Π΅ΠΏΡ‹ΠΌ. Если Π΅ΡΡ‚ΡŒ Π»ΡƒΡ‡ΡˆΠΈΠΉ способ, поТалуйста, Π΄Π°ΠΉΡ‚Π΅ Π½Π°ΠΌ Π·Π½Π°Ρ‚ΡŒ!

Π‘Π΅ΠΌΠΈΠ½Π°Ρ€Ρ‹

Π’ условиях Π±ΡƒΠ΄ΡƒΡ‰Π΅Π³ΠΎ сСминара, Π³Π΄Π΅ студСнты Π±ΡƒΠ΄ΡƒΡ‚ Π΄Π΅Π»Π°Ρ‚ΡŒ это Π²ΠΏΠ΅Ρ€Π²Ρ‹Π΅, Π½ΠΎ сСйчас Ρƒ нас большС ΠΎΠΏΡ‹Ρ‚Π°, ΠΏΠΎΡ‚Π΅Π½Ρ†ΠΈΠ°Π»ΡŒΠ½ΠΎΠ΅ расписаниС ΠΌΠΎΠΆΠ΅Ρ‚ Π±Ρ‹Ρ‚ΡŒ ΠΏΡ€ΠΈΠΌΠ΅Ρ€Π½ΠΎ Ρ‚Π°ΠΊΠΈΠΌ:

Π”Π΅Π½ΡŒ 1: Π‘Π±ΠΎΡ€ ΠΎΠ±Ρ€Π°Π·Ρ†Π°, ΠΊΡƒΠ»ΡŒΡ‚ΡƒΡ€Π°

Π”Π΅Π½ΡŒ 2: Π˜Π·Π²Π»Π΅Ρ‡Π΅Π½ΠΈΠ΅ Π”ΠΠš, Π°Π½Π°Π»ΠΈΠ· Π½Π° Π³Π΅Π»Π΅, ΠΎΠΏΡ€Π΅Π΄Π΅Π»Π΅Π½ΠΈΠ΅ количСства

Π”Π΅Π½ΡŒ 3: ΠŸΠΎΠ΄Π³ΠΎΡ‚ΠΎΠ²ΠΊΠ° Π±ΠΈΠ±Π»ΠΈΠΎΡ‚Π΅ΠΊΠΈ, ΠΏΠΎΡΠ»Π΅Π΄ΠΎΠ²Π°Ρ‚Π΅Π»ΡŒΠ½ΠΎΡΡ‚ΡŒ (это Π±ΡƒΠ΄Π΅Ρ‚ Π΄ΠΎΠ»Π³ΠΈΠΉ дСнь)

Π”Π΅Π½ΡŒ 4: ΠŸΠΎΠ»ΡƒΡ‡Π΅Π½ΠΈΠ΅ ΠΏΠΎΡΠ»Π΅Π΄ΠΎΠ²Π°Ρ‚Π΅Π»ΡŒΠ½ΠΎΡΡ‚Π΅ΠΉ, Π·Π°Π³Ρ€ΡƒΠ·ΠΊΠ°, ΠΎΡ†Π΅Π½ΠΊΠ° ΠΏΠΎΠΊΠ°Π·Π°Π½ΠΈΠΉ, Π½Π°Ρ‡Π°Π»ΠΎ сборки

Π”Π΅Π½ΡŒ 5: ΠžΡ†Π΅Π½ΠΊΠ° сборки, Π°Π½Π½ΠΎΡ‚ΠΈΡ€ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠ΅

Π­Ρ‚ΠΎ ΠΏΠΎΡ…ΠΎΠΆΠ΅ Π½Π° Π³Ρ€Π°Ρ„ΠΈΠΊ для Pore Camp, ΠΊΠΎΡ‚ΠΎΡ€Ρ‹ΠΌ Ρ€ΡƒΠΊΠΎΠ²ΠΎΠ΄ΠΈΡ‚ Ник Π›ΠΎΠΌΠ°Π½ ΠΈΠ· БирмингСмского унивСрситСта Π² Π’Π΅Π»ΠΈΠΊΠΎΠ±Ρ€ΠΈΡ‚Π°Π½ΠΈΠΈ. Π£ Π½ΠΈΡ… Π΅ΡΡ‚ΡŒ ΠΎΡ‚Π»ΠΈΡ‡Π½Ρ‹Π΅ ΠΌΠ°Ρ‚Π΅Ρ€ΠΈΠ°Π»Ρ‹ ΠΈ ΠΎΠΏΡ‹Ρ‚, ΠΊΠΎΡ‚ΠΎΡ€Ρ‹ΠΌΠΈ ΠΎΠ½ΠΈ ΠΌΠΎΠ³ΡƒΡ‚ ΠΏΠΎΠ΄Π΅Π»ΠΈΡ‚ΡŒΡΡ:

http://porecamp.github.io/

Π‘Ρ‚ΠΎΠΈΠΌΠΎΡΡ‚ΡŒ

  • Пока нСизвСстно, ΠΊΠ°ΠΊΠΎΠ²Π° ΡΡ‚ΠΎΠΈΠΌΠΎΡΡ‚ΡŒ ΠΎΠ΄Π½ΠΎΠ³ΠΎ ΠΎΠ±Ρ€Π°Π·Ρ†Π°.
  • Π‘Ρ‚ΠΎΠΈΠΌΠΎΡΡ‚ΡŒ устранСния Π½Π΅ΠΏΠΎΠ»Π°Π΄ΠΎΠΊ?

Π― составил ΠΊΡ€Π°Ρ‚ΠΊΠΈΠΉ список ΠΏΠΎΠΊΡƒΠΏΠΎΠΊ ONP MinION:

https://docs.google.com/spreadsheets/d/1yBncz75kgwExCXy7sC9LsMaDGs8OJJJGg9f4o3DcoQE/edit?usp=sharing

Как ΠΏΡ€Π°Π²ΠΈΠ»ΠΎ, это ΠΏΡ€Π΅Π΄ΠΌΠ΅Ρ‚Ρ‹ для ΠΏΠΎΠΊΡƒΠΏΠΊΠΈ. :

  • Π‘Ρ‚Π°Ρ€Ρ‚ΠΎΠ²Ρ‹ΠΉ ΠΏΠ°ΠΊΠ΅Ρ‚ Mk1B поставляСтся с 2 ΠΏΡ€ΠΎΡ‚ΠΎΡ‡Π½Ρ‹ΠΌΠΈ ΠΊΡŽΠ²Π΅Ρ‚Π°ΠΌΠΈ
  • ΠΊΠΎΠΌΠΏΡŒΡŽΡ‚Π΅Ρ€
  • Π Π΅Π°Π³Π΅Π½Ρ‚Ρ‹ ONP
  • сторонниС Ρ€Π΅Π°Π³Π΅Π½Ρ‚Ρ‹ (NEB)

ΠŸΠΎΠ»ΡƒΡ‡Π΅Π½ΠΈΠ΅ ΠΏΠΎΠΌΠΎΡ‰ΠΈ

  • Π£ сообщСства MAP Π΅ΡΡ‚ΡŒ ΠΎΡ‚Π²Π΅Ρ‚Ρ‹ Π½Π° Π½Π΅ΠΊΠΎΡ‚ΠΎΡ€Ρ‹Π΅ вопросы
  • НСт Π½ΠΎΠΌΠ΅Ρ€Π° Ρ‚Π΅Π»Π΅Ρ„ΠΎΠ½Π° для Π·Π²ΠΎΠ½ΠΊΠ° Π² ONP. Π’ ΠΎΡ‚Π»ΠΈΡ‡ΠΈΠ΅ ΠΎΡ‚Β Illumina, Ρƒ Illumina Π΅ΡΡ‚ΡŒ фантастичСская тСлСфонная линия обслуТивания ΠΊΠ»ΠΈΠ΅Π½Ρ‚ΠΎΠ², с Ρ…ΠΎΡ€ΠΎΡˆΠΎ ΠΎΠ±ΡƒΡ‡Π΅Π½Π½Ρ‹ΠΌΠΈ тСхничСскими спСциалистами Π½Π° Π΄Ρ€ΡƒΠ³ΠΎΠΌ ΠΊΠΎΠ½Ρ†Π΅, Ρ‡Ρ‚ΠΎΠ±Ρ‹ ΠΎΡ‚Π²Π΅Ρ‚ΠΈΡ‚ΡŒ Π½Π° экстрСнныС Ρ‚Π΅Π»Π΅Ρ„ΠΎΠ½Π½Ρ‹Π΅ Π·Π²ΠΎΠ½ΠΊΠΈ. Π Π΅Π°Π³Π΅Π½Ρ‚Ρ‹ ΠΈ ΠΏΡ€ΠΎΡ‚ΠΎΡ‡Π½Ρ‹Π΅ ячСйки Π΄ΠΎΡ€ΠΎΠ³ΠΈ. Когда Π²Ρ‹ Π½Π°Ρ…ΠΎΠ΄ΠΈΡ‚Π΅ΡΡŒ Π² Π»Π°Π±ΠΎΡ€Π°Ρ‚ΠΎΡ€ΠΈΠΈ ΠΈ Π²ΠΎΠ·Π½ΠΈΠΊΠ°Π΅Ρ‚ ΠΏΡ€ΠΎΠ±Π»Π΅ΠΌΠ°, Π½Π°ΠΏΡ€ΠΈΠΌΠ΅Ρ€ ΠΏΡƒΠ·Ρ‹Ρ€Π΅ΠΊ Π½Π° ΠΏΡ€ΠΎΡ‚ΠΎΡ‡Π½ΠΎΠΉ ΠΊΡŽΠ²Π΅Ρ‚Π΅ ΠΈΠ»ΠΈ Π½ΠΈΠ·ΠΊΠΎΠ΅ число ΠΏΠΎΡ€ послС контроля качСства, часто Π½Π΅ΠΎΠ±Ρ…ΠΎΠ΄ΠΈΠΌΠΎ ΠΏΠΎΠ·Π²ΠΎΠ½ΠΈΡ‚ΡŒ ΠΈ ΠΏΠΎΠ³ΠΎΠ²ΠΎΡ€ΠΈΡ‚ΡŒ с Ρ‡Π΅Π»ΠΎΠ²Π΅ΠΊΠΎΠΌ ΠΏΠΎ Ρ‚Π΅Π»Π΅Ρ„ΠΎΠ½Ρƒ, Ρ‡Ρ‚ΠΎΠ±Ρ‹ Π·Π°Π΄Π°Ρ‚ΡŒ вопрос, Ρ‡Ρ‚ΠΎΠ±Ρ‹ Π½Π΅ Ρ‚Ρ€Π°Ρ‚ΠΈΡ‚ΡŒ зря врСмя ΠΈΠ»ΠΈ дСньги.
  • Π£ мСня Π±Ρ‹Π»ΠΎ ΠΌΠ½ΠΎΠ³ΠΎ Ρ…ΠΎΡ€ΠΎΡˆΠΈΡ… Ρ€Π°Π·Π³ΠΎΠ²ΠΎΡ€ΠΎΠ² ΠΏΠΎ элСктронной ΠΏΠΎΡ‡Ρ‚Π΅ со слуТбой тСхничСской ΠΏΠΎΠ΄Π΄Π΅Ρ€ΠΆΠΊΠΈ ONP, Π½ΠΎ Π½Π΅Ρ‚ Π½ΠΈΡ‡Π΅Π³ΠΎ Π»ΡƒΡ‡ΡˆΠ΅, Ρ‡Π΅ΠΌ ΠΏΠΎΠ·Π²ΠΎΠ½ΠΈΡ‚ΡŒ ΠΊΠΎΠΌΡƒ-Ρ‚ΠΎ ΠΏΠΎ Ρ‚Π΅Π»Π΅Ρ„ΠΎΠ½Ρƒ ΠΈ ΠΎΠ±ΡΡƒΠ΄ΠΈΡ‚ΡŒ ΠΏΡ€ΠΎΠ±Π»Π΅ΠΌΡƒ. Часто Π΅ΡΡ‚ΡŒ Π²Π΅Ρ‰ΠΈ, Π½Π°Π΄ ΠΊΠΎΡ‚ΠΎΡ€Ρ‹ΠΌΠΈ Π½ΡƒΠΆΠ½ΠΎ ΠΏΠΎΡ€Π°Π±ΠΎΡ‚Π°Ρ‚ΡŒ послС элСктронного письма, ΠΈ Ρ‚Ρ€ΡƒΠ΄Π½ΠΎ ΡΠ»Π΅Π΄ΠΈΡ‚ΡŒ Π·Π° Π½ΠΈΠΌΠΈ, пСрСходя Ρ‚ΡƒΠ΄Π° ΠΈ ΠΎΠ±Ρ€Π°Ρ‚Π½ΠΎ ΠΏΠΎ элСктронной ΠΏΠΎΡ‡Ρ‚Π΅.
  • Ѐункция LiveChatting Π½Π° Π²Π΅Π±-сайтС ONP Π²Π΅Π»ΠΈΠΊΠΎΠ»Π΅ΠΏΠ½Π°! (Π’ Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‡ΠΈΠ΅ часы Π’Π΅Π»ΠΈΠΊΠΎΠ±Ρ€ΠΈΡ‚Π°Π½ΠΈΠΈ Π² Π½ΠΈΠΆΠ½Π΅ΠΉ части Π²Π΅Π±-сайта ΠΌΠ°Π³Π°Π·ΠΈΠ½Π° Π΅ΡΡ‚ΡŒ функция Β«Π£ вас Π΅ΡΡ‚ΡŒ вопрос?Β». Π’ Π½Π΅Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‡Π΅Π΅ врСмя Ρ‚Π°ΠΌ Π΅ΡΡ‚ΡŒ надпись Β«ΠžΡΡ‚Π°Π²ΠΈΡ‚ΡŒ сообщСниС».

Благодаря этому процСссу я понял, Ρ‡Ρ‚ΠΎ Ρƒ мСня ΠΌΠ½ΠΎΠ³ΠΎ вопросов ΠΈ ΠΌΠ°Π»ΠΎ ΠΎΡ‚Π²Π΅Ρ‚ΠΎΠ². Π£ MAP ΠΌΠ½ΠΎΠ³ΠΎ вопросов Π½Π° Ρ„ΠΎΡ€ΡƒΠΌΠ΅, Π½ΠΎ ΠΌΠ°Π»ΠΎ руководств. Поиск ΠΏΠΎ Ρ„Ρ€Π°Π·Π΅ отстой. Если Π²Ρ‹ ΠΈΡ‰Π΅Ρ‚Π΅ Ρ„Ρ€Π°Π·Ρƒ Π² ΠΊΠ°Π²Ρ‹Ρ‡ΠΊΠ°Ρ…, ΠΎΠ½Π° всС Ρ€Π°Π²Π½ΠΎ Π±ΡƒΠ΄Π΅Ρ‚ ΠΈΡΠΊΠ°Ρ‚ΡŒ ΠΎΡ‚Π΄Π΅Π»ΡŒΠ½Ρ‹Π΅ слова. НапримСр:

ΠžΡΡ‚Π°Π²ΡˆΠΈΠ΅ΡΡ вопросы:

1. ΠŸΠΎΡ‡Π΅ΠΌΡƒ число ΠΏΠΎΡ€ ΠΏΡ€ΠΎΡ‚ΠΎΡ‡Π½ΠΎΠΉ ΠΊΡŽΠ²Π΅Ρ‚Ρ‹ колСблСтся? Каково ΠΎΠΏΡ‚ΠΈΠΌΠ°Π»ΡŒΠ½ΠΎΠ΅ число ΠΏΠΎΡ€ для ΠΏΡ€ΠΎΡ‚ΠΎΡ‡Π½ΠΎΠΉ ΠΊΡŽΠ²Π΅Ρ‚Ρ‹?

2. Как считывания 1D Π²Π»ΠΈΡΡŽΡ‚ Π½Π° сборку? МоТСм Π»ΠΈ ΠΌΡ‹ ΠΈΡΠΏΠΎΠ»ΡŒΠ·ΠΎΠ²Π°Ρ‚ΡŒ Β«Π½Π΅ΡƒΠ΄Π°Ρ‡Π½Ρ‹Π΅Β» чтСния для Ρ‡Π΅Π³ΠΎ-Π»ΠΈΠ±ΠΎ?

3. Бколько Π²Ρ€Π΅ΠΌΠ΅Π½ΠΈ Π·Π°ΠΉΠΌΠ΅Ρ‚ ΠΏΡ€ΠΎΠ³ΠΎΠ½?

4. Бколько мСста Π½Π° ТСстком дискС трСбуСтся для ΠΎΠ΄Π½ΠΎΠ³ΠΎ запуска?

5. Когда считывания Β«ΡƒΡΠΏΠ΅ΡˆΠ½Ρ‹Β», Π° ΠΊΠΎΠ³Π΄Π° Β«Π½Π΅ΡƒΠ΄Π°Ρ‡Π½Ρ‹Β»? Π•ΡΡ‚ΡŒ Π»ΠΈ Ρ†Π΅Π½Π½ΠΎΡΡ‚ΡŒ Π² Π½Π΅ΡƒΠ΄Π°Ρ‡Π½Ρ‹Ρ… чтСниях?

6. Как максимально эффСктивно ΠΈΡΠΏΠΎΠ»ΡŒΠ·ΠΎΠ²Π°Ρ‚ΡŒ ΠΏΡ€ΠΎΡ‚ΠΎΡ‡Π½Ρ‹Π΅ ΠΊΡŽΠ²Π΅Ρ‚Ρ‹? Β ΠŸΠΎΡ…ΠΎΠΆΠ΅, сущСствуСт ΠΌΠ½ΠΎΠ³ΠΎ нСизвСстных, связанных с ΡΡ„Ρ„Π΅ΠΊΡ‚ΠΈΠ²Π½ΠΎΡΡ‚ΡŒΡŽ ΠΏΡ€ΠΎΡ‚ΠΎΡ‡Π½Ρ‹Ρ… ячССк. ΠœΡ‹ ΠΏΠΎΠΏΡ‹Ρ‚Π°Π»ΠΈΡΡŒ ΠΏΠΎΠ²Ρ‚ΠΎΡ€Π½ΠΎ ΠΈΡΠΏΠΎΠ»ΡŒΠ·ΠΎΠ²Π°Ρ‚ΡŒ ΠΏΡ€ΠΎΠΌΡ‹Ρ‚ΡƒΡŽ ΠΏΡ€ΠΎΡ‚ΠΎΡ‡Π½ΡƒΡŽ ΠΊΡŽΠ²Π΅Ρ‚Ρƒ. Π’ΠΎ врСмя ΠΏΠ΅Ρ€Π²ΠΎΠ½Π°Ρ‡Π°Π»ΡŒΠ½ΠΎΠ³ΠΎ контроля качСства Π² ΠΏΡ€ΠΎΡ‚ΠΎΡ‡Π½ΠΎΠΉ ΠΊΡŽΠ²Π΅Ρ‚Π΅ Π±Ρ‹Π»ΠΎ >400 ΠΏΠΎΡ€. ПослС Ρ‚ΠΎΠ³ΠΎ, ΠΊΠ°ΠΊ ΠΌΡ‹ Π·Π°Π³Ρ€ΡƒΠ·ΠΈΠ»ΠΈ Π±ΠΈΠ±Π»ΠΈΠΎΡ‚Π΅ΠΊΡƒ ΠΈ Π½Π°Ρ‡Π°Π»ΠΈ ΠΏΡ€ΠΎΠ³ΠΎΠ½, количСство ΠΏΠΎΡ€ Π±Ρ‹Π»ΠΎ Π² ΠΏΡ€Π΅Π΄Π΅Π»Π°Ρ… 80–100. Π§Π΅Ρ€Π΅Π· 2 часа это число ΡƒΠΏΠ°Π»ΠΎ Π΄ΠΎ ~ 30 с. Π― Π΄ΠΎΠ±Π°Π²ΠΈΠ» большС Π±ΠΈΠ±Π»ΠΈΠΎΡ‚Π΅ΠΊΠΈ, ΠΈ количСство ΠΏΠΎΡ€ большС Π½ΠΈΠΊΠΎΠ³Π΄Π° Π½Π΅ ΡƒΠ²Π΅Π»ΠΈΡ‡ΠΈΠ²Π°Π»ΠΎΡΡŒ. ЯвляСтся Π»ΠΈ это Ρ€Π΅Π·ΡƒΠ»ΡŒΡ‚Π°Ρ‚ΠΎΠΌ ΡƒΡ…ΡƒΠ΄ΡˆΠ΅Π½ΠΈΡ качСства ΠΏΠΎΡ€? На ΡΠ»Π΅Π΄ΡƒΡŽΡ‰Π΅Π΅ ΡƒΡ‚Ρ€ΠΎ снова Π·Π°Π³Ρ€ΡƒΠ·ΠΈΠ» Π±ΠΈΠ±Π»ΠΈΠΎΡ‚Π΅ΠΊΡƒ. НС Ρ‚Π°ΠΊ ΠΌΠ½ΠΎΠ³ΠΎ ΠΈΠ·ΠΌΠ΅Π½Π΅Π½ΠΈΠΉ. РСшил ΡΠΌΠ΅Π½ΠΈΡ‚ΡŒ ΠΏΡ€ΠΎΡ‚ΠΎΡ‡Π½ΡƒΡŽ ячСйку ΠΈ ΠΏΠΎΠΏΡ€ΠΎΠ±ΠΎΠ²Π°Ρ‚ΡŒ Π½ΠΎΠ²ΡƒΡŽ.

7. Π‘ΡƒΡ‰Π΅ΡΡ‚Π²ΡƒΡŽΡ‚ Π»ΠΈ эффСкты ΠΏΠ°ΠΊΠ΅Ρ‚Π½ΠΎΠΉ ΠΏΠΎΠ΄Π³ΠΎΡ‚ΠΎΠ²ΠΊΠΈ Π±ΠΈΠ±Π»ΠΈΠΎΡ‚Π΅ΠΊΠΈ ΠΈ/ΠΈΠ»ΠΈ ΠΏΡ€ΠΎΡ‚ΠΎΡ‡Π½Ρ‹Ρ… ΠΊΡŽΠ²Π΅Ρ‚? Π”ΠΎΠ»ΠΆΠ½Ρ‹ Π»ΠΈ ΠΌΡ‹ с ΠΎΡΡ‚ΠΎΡ€ΠΎΠΆΠ½ΠΎΡΡ‚ΡŒΡŽ ΠΎΡ‚Π½ΠΎΡΠΈΡ‚ΡŒΡΡ ΠΊ объСдинСнию ΠΏΠΎΠΊΠ°Π·Π°Π½ΠΈΠΉ ΠΈΠ· Π½Π΅ΡΠΊΠΎΠ»ΡŒΠΊΠΈΡ… ΠΏΡ€ΠΎΡ‚ΠΎΡ‡Π½Ρ‹Ρ… ячССк?

Π‘ΡƒΠ΄ΡƒΡ‰Π΅Π΅

Π’ Π±ΡƒΠ΄ΡƒΡ‰Π΅ΠΌ Ρ†Π΅Π»ΡŒ состоит Π² Ρ‚ΠΎΠΌ, Ρ‡Ρ‚ΠΎΠ±Ρ‹ ΠΎΡ‚ΠΎΠΉΡ‚ΠΈ ΠΎΡ‚ Π·Π°Π±ΠΎΡ‚ ΠΎ дСталях Ρ‚Π΅Ρ…Π½ΠΎΠ»ΠΎΠ³ΠΈΠΈ ΠΈ ΡΠΎΡΡ€Π΅Π΄ΠΎΡ‚ΠΎΡ‡ΠΈΡ‚ΡŒΡΡ Π½Π° Π°Π½Π°Π»ΠΈΠ·Π΅ Π΄Π°Π½Π½Ρ‹Ρ… ΠΈ ΠΈΡ… Π·Π½Π°Ρ‡Π΅Π½ΠΈΠΈ. ЦСль Π΄ΠΎΠ»ΠΆΠ½Π° Π·Π°ΠΊΠ»ΡŽΡ‡Π°Ρ‚ΡŒΡΡ Π² Ρ‚ΠΎΠΌ, Ρ‡Ρ‚ΠΎΠ±Ρ‹ ΡΠΎΡΡ€Π΅Π΄ΠΎΡ‚ΠΎΡ‡ΠΈΡ‚ΡŒΡΡ Π½Π° Π±ΠΈΠΎΠ»ΠΎΠ³ΠΈΠΈ ΠΈ Π½Π° Ρ‚ΠΎΠΌ, ΠΏΠΎΡ‡Π΅ΠΌΡƒ ΠΌΡ‹ заинтСрСсованы Π² сСквСнировании всСго ΠΈ вся. Π§Ρ‚ΠΎ ΠΌΡ‹ ΠΌΠΎΠΆΠ΅ΠΌ ΡΠ΄Π΅Π»Π°Ρ‚ΡŒ со всСй этой ΠΈΠ½Ρ„ΠΎΡ€ΠΌΠ°Ρ†ΠΈΠ΅ΠΉ Ρ‚Π΅ΠΏΠ΅Ρ€ΡŒ, ΠΊΠΎΠ³Π΄Π° ΠΌΡ‹ ΠΌΠΎΠΆΠ΅ΠΌ ΡΠ΅ΠΊΠ²Π΅Π½ΠΈΡ€ΠΎΠ²Π°Ρ‚ΡŒ Π³Π΅Π½ΠΎΠΌ Π½ΠΎΠ²ΠΎΠ³ΠΎ Π²ΠΈΠ΄Π° Π±Π°ΠΊΡ‚Π΅Ρ€ΠΈΠΉ Π·Π° нСдСлю?

ΠžΡΡ‚Π°Π²Π»ΡΠΉΡ‚Π΅ ΠΊΠΎΠΌΠΌΠ΅Π½Ρ‚Π°Ρ€ΠΈΠΈ ΠΈ ΠΎΠ±Ρ€Π°Ρ‰Π°ΠΉΡ‚Π΅ΡΡŒ!

https://www.flickr.com/photos/lpcohen/28193032994/

Нравится:

Нравится Π—Π°Π³Ρ€ΡƒΠ·ΠΊΠ°. ..

fastq — ΠœΠΎΠ³Ρƒ Π»ΠΈ я ΠΈΠ·Π²Π»Π΅Ρ‡ΡŒ ΠΏΡ€ΠΎΡ‚ΠΎΡ‡Π½ΡƒΡŽ ΠΊΡŽΠ²Π΅Ρ‚Ρƒ MinION ΠΈΠ· USB-ΠΏΠΎΡ€Ρ‚Π° Π²ΠΎ врСмя выполнСния основного Π²Ρ‹Π·ΠΎΠ²Π°?

спросил 2 Π³ΠΎΠ΄Π°, 7 мСсяцСв Π½Π°Π·Π°Π΄

ИзмСнСно 4 мСсяца Π½Π°Π·Π°Π΄

ΠŸΡ€ΠΎΡΠΌΠΎΡ‚Ρ€Π΅Π½ΠΎ 695 Ρ€Π°Π·

$\begingroup$

МоТно Π»ΠΈ ΠΈΠ·Π²Π»Π΅Ρ‡ΡŒ ΠΏΡ€ΠΎΡ‚ΠΎΡ‡Π½ΡƒΡŽ ΠΊΡŽΠ²Π΅Ρ‚Ρƒ MinION ΠΈΠ· USB-ΠΏΠΎΡ€Ρ‚Π° ΠΏΡ€ΠΈ Π²Ρ‹ΠΏΠΎΠ»Π½Π΅Π½ΠΈΠΈ Π±Π°Π·ΠΎΠ²ΠΎΠ³ΠΎ Π²Ρ‹Π·ΠΎΠ²Π°? ΠŸΠΎΡΠΊΠΎΠ»ΡŒΠΊΡƒ это Π·Π°Π½ΠΈΠΌΠ°Π΅Ρ‚ ΠΌΠ½ΠΎΠ³ΠΎ Π²Ρ€Π΅ΠΌΠ΅Π½ΠΈ ΠΈ Π½Π΅Π²ΠΎΠ·ΠΌΠΎΠΆΠ½ΠΎ Π΄ΠΎΠΆΠ΄Π°Ρ‚ΡŒΡΡ Π·Π°Π²Π΅Ρ€ΡˆΠ΅Π½ΠΈΡ, повлияСт Π»ΠΈ это Π½Π° бСйсколл?

$\endgroup$

$\begingroup$

МоТно, потСряСтС ΠΏΠ΅Ρ€Π΅Π΄Π°Ρ‡Ρƒ ΠΎΡ‚ Миньона. ВСроятно, Π±Ρ‹Π»ΠΎ Π±Ρ‹ Π»ΡƒΡ‡ΡˆΠ΅ просто ΠΎΡΡ‚Π°Π½ΠΎΠ²ΠΈΡ‚ΡŒ Π±Π΅Π³. ΠšΠΎΠΌΠΏΡŒΡŽΡ‚Π΅Ρ€ Π±ΡƒΠ΄Π΅Ρ‚ ΠΏΡ€ΠΎΠ΄ΠΎΠ»ΠΆΠ°Ρ‚ΡŒ Π±Π°Π·ΠΎΠ²Ρ‹ΠΉ Π²Ρ‹Π·ΠΎΠ², ΠΏΠΎΠΊΠ° это Π½Π΅ Π±ΡƒΠ΄Π΅Ρ‚ сдСлано. ВсС Π½Π΅ΠΎΠ±Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚Π°Π½Π½Ρ‹Π΅ чтСния хранятся локально Π½Π° машинС, поэтому всС Π΄ΠΎΠ»ΠΆΠ½ΠΎ Π±Ρ‹Ρ‚ΡŒ Π² порядкС.

$\endgroup$

$\begingroup$

Π”Π°, всС Π΄ΠΎΠ»ΠΆΠ½ΠΎ Π±Ρ‹Ρ‚ΡŒ Π² порядкС, особСнно Ссли ΠΏΡ€ΠΎΠ³ΠΎΠ½ Π·Π°Π²Π΅Ρ€ΡˆΠ΅Π½. MinKNOW Π΄ΠΎΠ»ΠΆΠ΅Π½ ΠΏΠΎ-ΠΏΡ€Π΅ΠΆΠ½Π΅ΠΌΡƒ ΠΏΡ€ΠΎΠ΄ΠΎΠ»ΠΆΠ°Ρ‚ΡŒ Π±Π°Π·ΠΎΠ²Ρ‹ΠΉ Π²Ρ‹Π·ΠΎΠ² Π΄Π°ΠΆΠ΅ послС ΠΎΡ‚ΠΊΠ»ΡŽΡ‡Π΅Π½ΠΈΡ MinION. К соТалСнию, я Π½Π΅ ΠΌΠΎΠ³Ρƒ Π½Π°ΠΉΡ‚ΠΈ Ρ…ΠΎΡ€ΠΎΡˆΠΈΡ… сообщСний ΠΎΠ± этом Π² сообщСствС ONT, ΠΏΠΎΡ‚ΠΎΠΌΡƒ Ρ‡Ρ‚ΠΎ поиск Π² настоящСС врСмя Π½Π΅ Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚Π°Π΅Ρ‚. Π­Ρ‚ΠΎΡ‚ пост ΠΌΠΎΠΆΠ΅Ρ‚ Π±Ρ‹Ρ‚ΡŒ ΠΏΠΎΠ»Π΅Π·Π΅Π½ (Π½Π°ΠΉΠ΄Π΅Π½ΠΎ ΠΏΡ€ΠΈ поискС Π² ΠΌΠΎΠ΅ΠΉ элСктронной ΠΏΠΎΡ‡Ρ‚Π΅), Π½ΠΎ Π΅ΠΌΡƒ ΡƒΠΆΠ΅ Π΄Π²Π° Π³ΠΎΠ΄Π°:

ΠŸΡ€ΠΈΠ²Π΅Ρ‚, спасибо Π·Π° ваш пост. ΠšΠΎΠ½Π΅Ρ‡Π½ΠΎ, Π²Ρ‹ ΠΌΠΎΠΆΠ΅Ρ‚Π΅ ΡΠ½ΡΡ‚ΡŒ ΠΏΡ€ΠΎΡ‚ΠΎΡ‡Π½ΡƒΡŽ ΠΊΡŽΠ²Π΅Ρ‚Ρƒ ΠΈ ΠΏΡ€ΠΎΠΌΡ‹Ρ‚ΡŒ Π΅Π΅, Π½Π΅ влияя Π½Π° Ρ€Π΅ΠΆΠΈΠΌ навСрстывания. ΠŸΠΎΠΆΠ°Π»ΡƒΠΉΡΡ‚Π°, посСтитС страницу Π·Π°Π³Ρ€ΡƒΠ·ΠΎΠΊ здСсь для получСния самой послСднСй вСрсии установщика.
— Монолина Π‘ΠΈΠ½Π½ΠΈ, ONT

Если Π² Π±ΡƒΠ΄ΡƒΡ‰Π΅ΠΌ Π²Ρ‹, вСроятно, Π±ΡƒΠ΄Π΅Ρ‚Π΅ Π²Ρ‹ΠΏΠΎΠ»Π½ΡΡ‚ΡŒ Π±ΠΎΠ»Π΅Π΅ Π΄Π»ΠΈΡ‚Π΅Π»ΡŒΠ½Ρ‹Π΅ ΠΏΡ€ΠΎΠ³ΠΎΠ½Ρ‹ (> 6 часов), я Π±Ρ‹ ΠΏΠΎΡ€Π΅ΠΊΠΎΠΌΠ΅Π½Π΄ΠΎΠ²Π°Π» приобрСсти Π΄Π΅ΡˆΠ΅Π²ΡƒΡŽ Π²ΠΈΠ΄Π΅ΠΎΠΊΠ°Ρ€Ρ‚Ρƒ с ΠΏΠΎΠ΄Π΄Π΅Ρ€ΠΆΠΊΠΎΠΉ CUDA (ΠΏΠΎ ΠΊΡ€Π°ΠΉΠ½Π΅ΠΉ ΠΌΠ΅Ρ€Π΅, v10), Ρ‡Ρ‚ΠΎΠ±Ρ‹ ΡΡΠΊΠΎΠ½ΠΎΠΌΠΈΡ‚ΡŒ врСмя Π² Π±ΡƒΠ΄ΡƒΡ‰Π΅ΠΌ.

$\endgroup$

Π—Π°Ρ€Π΅Π³ΠΈΡΡ‚Ρ€ΠΈΡ€ΡƒΠΉΡ‚Π΅ΡΡŒ ΠΈΠ»ΠΈ Π²ΠΎΠΉΠ΄ΠΈΡ‚Π΅ Π² систСму

Π—Π°Ρ€Π΅Π³ΠΈΡΡ‚Ρ€ΠΈΡ€ΡƒΠΉΡ‚Π΅ΡΡŒ с ΠΏΠΎΠΌΠΎΡ‰ΡŒΡŽ Google

Π—Π°Ρ€Π΅Π³ΠΈΡΡ‚Ρ€ΠΈΡ€ΠΎΠ²Π°Ρ‚ΡŒΡΡ Ρ‡Π΅Ρ€Π΅Π· Facebook

Π—Π°Ρ€Π΅Π³ΠΈΡΡ‚Ρ€ΠΈΡ€ΡƒΠΉΡ‚Π΅ΡΡŒ, ΠΈΡΠΏΠΎΠ»ΡŒΠ·ΡƒΡ адрСс элСктронной ΠΏΠΎΡ‡Ρ‚Ρ‹ ΠΈ ΠΏΠ°Ρ€ΠΎΠ»ΡŒ

ΠžΠΏΡƒΠ±Π»ΠΈΠΊΠΎΠ²Π°Ρ‚ΡŒ ΠΊΠ°ΠΊ Π³ΠΎΡΡ‚ΡŒ

ЭлСктронная ΠΏΠΎΡ‡Ρ‚Π°

ΠžΠ±ΡΠ·Π°Ρ‚Π΅Π»ΡŒΠ½ΠΎ, Π½ΠΎ Π½Π΅ отобраТаСтся

ΠžΠΏΡƒΠ±Π»ΠΈΠΊΠΎΠ²Π°Ρ‚ΡŒ ΠΊΠ°ΠΊ Π³ΠΎΡΡ‚ΡŒ

ЭлСктронная ΠΏΠΎΡ‡Ρ‚Π°

ВрСбуСтся, Π½ΠΎ Π½Π΅ отобраТаСтся

НаТимая Β«ΠžΠΏΡƒΠ±Π»ΠΈΠΊΠΎΠ²Π°Ρ‚ΡŒ свой ΠΎΡ‚Π²Π΅Ρ‚Β», Π²Ρ‹ ΡΠΎΠ³Π»Π°ΡˆΠ°Π΅Ρ‚Π΅ΡΡŒ с нашими условиями обслуТивания ΠΈ ΠΏΠΎΠ΄Ρ‚Π²Π΅Ρ€ΠΆΠ΄Π°Π΅Ρ‚Π΅, Ρ‡Ρ‚ΠΎ ΠΏΡ€ΠΎΡ‡ΠΈΡ‚Π°Π»ΠΈ ΠΈ поняли Π½Π°ΡˆΡƒ ΠΏΠΎΠ»ΠΈΡ‚ΠΈΠΊΡƒ ΠΊΠΎΠ½Ρ„ΠΈΠ΄Π΅Π½Ρ†ΠΈΠ°Π»ΡŒΠ½ΠΎΡΡ‚ΠΈ ΠΈ кодСкс повСдСния.

Π”ΠΎΠ±Π°Π²ΠΈΡ‚ΡŒ ΠΊΠΎΠΌΠΌΠ΅Π½Ρ‚Π°Ρ€ΠΈΠΉ ΠžΡ‚ΠΌΠ΅Π½ΠΈΡ‚ΡŒ ΠΎΡ‚Π²Π΅Ρ‚

Π’Π°Ρˆ адрСс email Π½Π΅ Π±ΡƒΠ΄Π΅Ρ‚ ΠΎΠΏΡƒΠ±Π»ΠΈΠΊΠΎΠ²Π°Π½. ΠžΠ±ΡΠ·Π°Ρ‚Π΅Π»ΡŒΠ½Ρ‹Π΅ поля ΠΏΠΎΠΌΠ΅Ρ‡Π΅Π½Ρ‹ *

Π ΡƒΠ±Ρ€ΠΈΠΊΠΈ

  • Для Π½Π°Ρ‡ΠΈΠ½Π°ΡŽΡ‰ΠΈΡ…
  • Как Ρ€ΠΈΡΠΎΠ²Π°Ρ‚ΡŒ
  • ΠšΠ°Ρ€Π°Π½Π΄Π°Ρˆ
  • ΠŸΠΎΡΡ‚Π°ΠΏΠ½ΠΎ
  • Π Π°Π·Π½ΠΎΠ΅
  • Π‘ΠΎΠ²Π΅Ρ‚Ρ‹
  • Брисовка
  • Π£Ρ€ΠΎΠΊΠΈ
2023 © ВсС ΠΏΡ€Π°Π²Π° Π·Π°Ρ‰ΠΈΡ‰Π΅Π½Ρ‹.