ΠΠΈΠ½ΡΠΎΠ½ ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅ΡΠΎΡΠΊΠ°ΠΌ — 97 ΡΠΎΡΠΎ
Π ΠΈΡΡΠ½ΠΊΠΈ Π² ΠΊΠ»Π΅ΡΠΎΡΠΊΡ ΠΠΈΠ½ΡΠΎΠ½Ρ
ΠΠΈΠΊΡΠ΅Π»ΡΠ½ΡΠ΅ ΡΠΈΡΡΠ½ΠΊΠΈ Π² ΠΊΠ»Π΅ΡΠΊΡ
ΠΡΡΠΈΠ²ΠΊΠ° ΠΠΈΠ½ΡΠΎΠ½Ρ ΡΡ Π΅ΠΌΡ
ΠΠΈΠ½ΡΠΎΠ½Ρ ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅ΡΠΎΡΠΊΠ°ΠΌ Π² ΡΠ΅ΡΡΠ°Π΄ΠΈ
ΠΡΡΠΈΠ²ΠΊΠ° ΠΠΈΠ½ΡΠΎΠ½Ρ ΡΡ Π΅ΠΌΡ
Π ΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠ΅ ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅ΡΠΎΡΠΊΠ°ΠΌ ΠΏΠ΅ΡΡΠΎΠ½Π°ΠΆΠΈ
Π ΠΈΡΡΠ½ΠΊΠΈ ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅ΡΠΎΡΠΊΠ°ΠΌ ΠΠΈΠ½ΡΠΎΠ½
ΠΠΈΠ½ΡΠΎΠ½ ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅ΡΠΊΠ°ΠΌ
Π ΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠ΅ ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅ΡΠΊΠ°ΠΌ ΠΌΠΈΠ½ΡΠΎΠ½ΠΎΠ²
ΠΠΈΠ½ΡΠΎΠ½Ρ ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅ΡΠΎΡΠΊΠ°ΠΌ Π² ΡΠ΅ΡΡΠ°Π΄ΠΈ
Π ΠΈΡΡΠ½ΠΊΠΈ ΠΏΠΎ ΠΏΠΈΠΊΡΠ΅Π»ΡΠΌ ΠΠΈΠ½ΡΠΎΠ½
Π ΠΈΡΡΠ½ΠΊΠΈ ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅ΡΠΎΡΠΊΠ°ΠΌ ΠΠΈΠ½ΡΠΎΠ½
ΠΡΡΠΈΠ²ΠΊΠ° ΠΠΈΠ½ΡΠΎΠ½Ρ ΡΡ Π΅ΠΌΡ
Π ΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠ΅ ΠΏΠΎ ΠΊΠ²Π°Π΄ΡΠ°ΡΠΈΠΊΠ°ΠΌ
Π ΠΈΡΡΠ½ΠΊΠΈ ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅ΡΠΎΡΠΊΠ°ΠΌ Π»ΡΠ³ΠΊΠΈΠ΅
Π ΠΈΡΡΠ½ΠΊΠΈ ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅ΡΠΎΡΠΊΠ°ΠΌ ΠΏΠΈΠΊΡΠ΅Π»ΡΠΊΠ° ΠΌΠ°Π»Π΅Π½ΡΠΊΠΈΠ΅
ΠΡΡΠΈΠ²ΠΊΠ° ΠΠΈΠ½ΡΠΎΠ½Ρ ΡΡ Π΅ΠΌΡ
ΠΡΡΠΈΠ²ΠΊΠ° ΠΠΈΠ½ΡΠΎΠ½Ρ
Π ΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠ΅ ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅ΡΠΎΡΠΊΠ°ΠΌ Π΄Π»Ρ Π΄Π΅ΡΠ΅ΠΉ ΠΠΈΠ½ΡΠΎΠ½
ΠΠΈΠ½ΡΠΎΠ½ ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅ΡΠΊΠ°ΠΌ
Π‘Ρ Π΅ΠΌΡ ΠΠΊΠ²Π° ΠΠΈΠ΄Ρ ΠΠ°ΡΠ²Π΅Π»
Π‘Ρ Π΅ΠΌΡ Π²ΡΡΠΈΠ²ΠΊΠΈ ΠΊΡΠ΅ΡΡΠΎΠΌ ΠΠΈΠ½ΡΠΎΠ½Ρ
ΠΡΡΠΈΠ²ΠΊΠ° ΠΠΈΠ½ΡΠΎΠ½Ρ
Π ΠΈΡΡΠ½ΠΊΠΈ ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅ΡΠΊΠ°ΠΌ ΠΏΡΠΈΠΊΠΎΠ»ΡΠ½ΡΠ΅
ΠΡΡΠΈΠ²ΠΊΠ° ΠΠΈΠ½ΡΠΎΠ½Ρ
ΠΠ΅ΠΌΠΎΠ½ΡΠ½ΠΎΠΊ ΠΏΠΈΠΊΡΠ΅Π»Ρ Π°ΡΡ
Π ΠΈΡΡΠ½ΠΊΠΈ ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅ΡΠΎΡΠΊΠ°ΠΌ Π² ΡΠ΅ΡΡΠ°Π΄ΠΈ
ΠΠΎΠ²ΠΎΠ³ΠΎΠ΄Π½ΠΈΠ΅ ΠΠΈΠ½ΡΠΎΠ½ ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅ΡΠΎΡΠΊΠ°ΠΌ
Π ΠΈΡΡΠ½ΠΊΠΈ ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅ΡΠΎΡΠΊΠ°ΠΌ ΠΌΠ°ΡΠ΄ΠΆ ΡΠΈΠΌΠΏΡΠΎΠ½
ΠΠ°ΠΏΠΈΡΠ°Π½ ΠΠΌΠ΅ΡΠΈΠΊΠ° ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅ΡΠΎΡΠΊΠ°ΠΌ
Π‘Ρ Π΅ΠΌΠ° ΠΌΠΈΠ½ΡΠΎΠ½ΠΎΠ²
Π’Π΅ΡΠΌΠΎΠΌΠΎΠ·Π°ΠΉΠΊΡ ΡΡ Π΅ΠΌΠ° ΠΠΈΠ½ΡΠΎΠ½
ΠΠΈΠΊΡΠ΅Π»ΡΠ°ΡΡ Π±Π°ΡΡ ΡΠΈΠΌΠΏΡΠΎΠ½
Π ΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠ΅ ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅ΡΠΎΡΠΊΠ°ΠΌ pixellenger
Π ΠΈΡΡΠ½ΠΊΠΈ ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅ΡΠΎΡΠΊΠ°ΠΌ Π² Paint
ΠΠ°ΠΊΠΌΠ°Π½ 8 Π±ΠΈΡ
Π ΜΜΠΈΜΜΡΜΜΡΜΜΠ½ΜΜΠΎΜΜΠΊΜΜ ΠΏΜΜΠΎΜΜ ΠΊΜΜΠ»ΜΜΠ΅ΜΜΡΜΜΠΎΜΜΡΜΜΠΊΜΜΠ°ΜΜΠΌΜΜ
Π ΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠ΅ ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅ΡΠΎΡΠΊΠ°v
Π ΠΈΡΡΠ½ΠΊΠΈ ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅ΡΠΎΡΠΊΠ°ΠΌ Π² ΡΠ΅ΡΡΠ°Π΄ΠΈ ΡΡ Π΅ΠΌΡ
Π ΠΈΡΡΠ½ΠΊΠΈ ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅ΡΠΎΡΠΊΠ°ΠΌ Π½ΠΎΠ²ΠΎΠ³ΠΎΠ΄Π½ΠΈΠ΅ Π»ΡΠ³ΠΊΠΈΠ΅
ΠΠΈΠ½Π³Π²ΠΈΠ½ ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅ΡΠΊΠ°ΠΌ
Π ΠΈΡΡΠ½ΠΊΠΈ ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅ΡΠΎΡΠΊΠ°ΠΌ Π±Π°ΡΡ ΡΠΈΠΌΠΏΡΠΎΠ½
ΠΠΈΠΊΡΠ΅Π»Ρ Π°ΡΡ ΠΠΈΠΊΠ°ΡΡ
Π ΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠ΅ ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅ΡΠΎΡΠΊΠ°ΠΌ ΠΠ°Π½Π΄Π°
Π ΠΈΡΡΠ½ΠΊΠΈ ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅ΡΠΊΠ°ΠΌ ΠΠΈΠΊΠ°ΡΡ
ΠΡΠΈΡΠ° ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅ΡΠΎΡΠΊΠ°ΠΌ
ΠΠ°ΠΉΠΊ ΠΠ°Π·ΠΎΠ²ΡΠΊΠΈ ΠΏΠΈΠΊΡΠ΅Π»Ρ
ΠΠ°ΡΡΠΈΠ½Ρ Π² ΠΏΠΈΠΊΡΠ΅Π»ΡΡ
Π‘ΠΌΡΡΡΠΈΠΊΠΈ ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅ΡΠΎΡΠΊΠ°ΠΌ
Π ΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠ΅ ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅ΡΠΎΡΠΊΠ°ΠΌ Π² ΡΠ΅ΡΡΠ°Π΄ΠΈ ΠΌΠ°Π»Π΅Π½ΡΠΊΠΈΠ΅
Π ΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠ΅ ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅ΡΠΎΡΠΊΠ°ΠΌ ΠΠ½Π³ΡΠΈ Π±Π΅ΡΠ΄Π·
ΠΡΡΠΈΡΡ ΠΊΡΠ΅ΡΡΠΈΠΊΠΎΠΌ ΠΠ΅Π΄ΠΏΡΠ»Π°
ΠΠΈΠΊΡΠ΅Π»ΡΠ½ΠΎΠ΅ ΡΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠ΅
ΠΡΠ²Π΅ΡΡ Π½Π° ΡΠΏΠΎΠ½ΡΠΊΠΈΠ΅ ΠΊΡΠΎΡΡΠ²ΠΎΡΠ΄Ρ Π―ΠΌΠ°Π±ΡΡΠΈ ΠΠΈΠ½ΡΠΎΠ½
ΠΡΡΠΈΠ²ΠΊΠ° ΠΠΈΠ½ΡΠΎΠ½Ρ
Π ΠΈΡΠΎΠ²ΠΊΠ° ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅ΡΠΎΡΠΊΠ°ΠΌ ΠΊΡΠ°ΡΠΈΠ²ΡΠ΅ ΡΠ»ΠΎΠΆΠ½ΡΠ΅
Π€Π»Π°ΠΌΠΈΠ½Π³ΠΎ ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅ΡΠΎΡΠΊΠ°ΠΌ
Π ΠΈΡΡΠ½ΠΊΠΈ ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅ΡΠΎΡΠΊΠ°ΠΌ
Π€Π΅Π½Π΅ΡΠΊΠ° ΠΠΈΠ½ΡΠΎΠ½
Π ΠΈΡΡΠ½ΠΊΠΈ ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅ΡΠΎΡΠΊΠ°ΠΌ Π±ΠΎΠ»ΡΡΠΈΠ΅
ΠΠΈΠΊΡΠ΅Π»Ρ Π°ΡΡ
Π ΠΈΡΡΠ½ΠΊΠΈ ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅ΡΠΎΡΠΊΠ°ΠΌ ΠΠΆΠ΅ΠΉΠΊ
ΠΠΎΡΠΎΠ»Ρ ΠΠΈΠ½ΡΠΎΠ½ ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅ΡΠΎΡΠΊΠ°ΠΌ
Π ΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠ΅ ΠΏΠΎ ΠΊΠ²Π°Π΄ΡΠ°ΡΠΈΠΊΠ°ΠΌ
ΠΠΈΠΊΡΠ΅Π»ΡΠ½ΡΠ΅ ΠΠΈΠ½ΡΠΎΠ½Ρ
ΠΡΡΠΈΠ²ΠΊΠ° ΠΠΈΠ½ΡΠΎΠ½Ρ
ΠΠΈΠΊΡΠ΅Π»ΡΠ½ΡΠ΅ ΡΠΈΡΡΠ½ΠΊΠΈ Π½Π΅Π±ΠΎΠ»ΡΡΠΈΠ΅
ΠΠΈΠ»Π» ΠΈΠ· ΠΡΠ°Π²ΠΈΡΠΈ Π€ΠΎΠ»Π· ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅ΡΠΎΡΠΊΠ°ΠΌ
Π ΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠ΅ ΠΏΠΎ ΠΏΠΈΠΊΡΠ΅Π»ΡΠΌ
Π‘Ρ Π΅ΠΌΡ Π±ΠΈΡΠ΅ΡΠΎΠΏΠ»Π΅ΡΠ΅Π½ΠΈΡ ΠΠΈΠ½ΡΠΎΠ½Ρ
ΠΠΈΠΊΠ°ΡΡ Pixel Art
Π ΠΈΡΡΠ½ΠΊΠΈ ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅ΡΠΎΡΠΊΠ°ΠΌ Π‘ΠΌΡΡΡΠΈΠΊΠΈ
ΠΠ°ΡΠΈΡΠΎΠ²Π°ΡΡ ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅ΡΠΎΡΠΊΠ°ΠΌ
Π£ΡΠΎΡΠΊΠ° ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅ΡΠΊΠ°ΠΌ
Π ΠΈΡΡΠ½ΠΊΠΈ Π² ΠΊΠ»Π΅ΡΠΊΡ ΠΊΡΡΡΡΠ΅
ΠΡΡΠΈΠ²ΠΊΠ° ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅ΡΠΎΡΠΊΠ°ΠΌ
Π ΠΈΡΡΠ½ΠΊΠΈ Π² ΠΊΠ»Π΅ΡΠΎΡΠΊΡ
ΠΠΈΠΊΡΠ΅Π»ΡΠ½ΡΠΉ ΠΠΈΠ½ΡΠΎΠ½
ΠΠΈΠΊΡΠ΅Π»Ρ Π°ΡΡ Π² ΠΊΠ»Π΅ΡΠΊΡ
ΠΠΈΠΊΡΠ΅Π»Ρ Π°ΡΡ Π‘Π°ΡΡ ΠΏΠ°ΡΠΊ
Π ΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠ΅ ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅ΡΠΊΠ°ΠΌ
Π§Π΅ΡΠ΅ΠΏΠ°ΡΠΊΠΈ Π½ΠΈΠ½Π΄Π·Ρ ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅ΡΠΎΡΠΊΠ°ΠΌ
Π ΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠ΅ ΠΏΠΎΠΊΠ»Π΅ΡΠ°ΡΠΊΠ°ΠΌ
Π ΠΈΡΡΠ½ΠΊΠΈ ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅ΡΠΎΡΠΊΠ°ΠΌ Π»ΡΠ³ΠΊΠΈΠ΅
Π ΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠ΅ ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅ΡΠΎΡΠΊΠ°ΠΌ ΠΠ΄ΠΈΠ½ΠΎΡΠΎΠ³
Π ΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠ΅ ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅ΡΠΎΡΠΊΠ°ΠΌ ΡΠΈΠΌΠΏΡΠΎΠ½Ρ
ΠΠ·ΡΠΈΡΠ»Ρ ΠΏΠΈΠΊΡΠ΅Π»Ρ Π°ΡΡ
Π ΠΈΡΡΠ½ΠΊΠΈ ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅ΡΠΊΠ°ΠΌ Π€Π»Π°ΡΡΠ΅ΡΡΠ°ΠΉ
ΠΠΈΠΊΡΠ΅Π»Ρ Π°ΡΡΡ Π±ΠΎΠ»ΡΡΠΈΠ΅
Π―ΠΏΠΎΠ½ΡΠΊΠΈΠ΅ ΠΊΡΠΎΡΡΠ²ΠΎΡΠ΄ΡΠΌΠΈΠ½ΡΠ΅Π½
Π ΠΈΡΡΠ½ΠΊΠΈ ΠΈΠ· ΠΏΠΈΠΊΡΠ΅Π»Π΅ΠΉ
ΠΠΈΠ·Π° ΡΠΈΠΌΠΏΡΠΎΠ½ Pixel Art
ΠΠΈΠΊΡΠ΅Π»ΡΠ½ΡΠΉ ΡΠΈΡΡΠ½ΠΎΠΊ
Π ΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠ΅ ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅ΡΠΊΠ°ΠΌ ΠΠΈΠΊΠ°ΡΡ
Π ΠΈΡΡΠ½ΠΊΠΈ ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅ΡΠΎΡΠΊΠ°ΠΌ
Π ΠΈΡΡΠ½ΠΊΠΈ ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅ΡΠΎΡΠΊΠ°ΠΌ ΠΌΠ°Π»Π΅Π½ΡΠΊΠΈΠ΅
Π ΠΈΡΡΠ½ΠΊΠΈ ΠΏΠΎ ΠΊΠ»Π΅ΡΠΎΡΠΊΠ°ΠΌ ΠΠΈΠ½ΡΠΎΠ½
ΠΠΎΠΌΠΌΠ΅Π½ΡΠ°ΡΠΈΠΈ (0)ΠΠ°ΠΏΠΈΡΠ°ΡΡ
ΠΠ½ΡΠΎΡΠΌΠ°ΡΠΈΡ
ΠΠΎΡΠ΅ΡΠΈΡΠ΅Π»ΠΈ, Π½Π°Ρ
ΠΎΠ΄ΡΡΠΈΠ΅ΡΡ Π² Π³ΡΡΠΏΠΏΠ΅ ΠΠΎΡΡΠΈ, Π½Π΅ ΠΌΠΎΠ³ΡΡ ΠΎΡΡΠ°Π²Π»ΡΡΡ ΠΊΠΎΠΌΠΌΠ΅Π½ΡΠ°ΡΠΈΠΈ ΠΊ Π΄Π°Π½Π½ΠΎΠΉ ΠΏΡΠ±Π»ΠΈΠΊΠ°ΡΠΈΠΈ.
Π£Π·Π½Π°Π΅ΠΌ ΠΊΠ°ΠΊ ΠΏΡΠ°Π²ΠΈΠ»ΡΠ½ΠΎ Π½Π°ΡΠΈΡΠΎΠ²Π°ΡΡ ΠΌΠΈΠ½ΡΠΎΠ½Π°-Π΄Π΅Π²ΠΎΡΠΊΡ: ΠΏΠΎΡΡΠ°ΠΏΠ½Π°Ρ ΠΈΠ½ΡΡΡΡΠΊΡΠΈΡ
ΠΠΈΠ½ΡΠΎΠ½Ρ β ΡΠΌΠ΅ΡΠ½ΡΠ΅ ΠΆΠΈΠ·Π½Π΅ΡΠ°Π΄ΠΎΡΡΠ½ΡΠ΅ ΡΡΡΠ΅ΡΡΠ²Π° ΠΈΠ· ΠΏΠΎΠΏΡΠ»ΡΡΠ½ΠΎΠ³ΠΎ ΠΌΡΠ»ΡΡΡΠΈΠ»ΡΠΌΠ° Β«ΠΠ°Π΄ΠΊΠΈΠΉ ΡΒ». ΠΠ½ΠΈ ΠΎΡΠ΅Π½Ρ ΡΡΠΎΠ³Π°ΡΠ΅Π»ΡΠ½ΡΠ΅, ΠΌΠΈΠ»ΡΠ΅ ΠΈ Π·Π°Π±Π°Π²Π½ΡΠ΅, Π»ΡΠ±ΡΡ ΠΏΠΎΠΊΡΡΠ°ΡΡ ΠΈ ΠΏΠΎΠ²Π΅ΡΠ΅Π»ΠΈΡΡΡΡ. Π‘Π΅Π³ΠΎΠ΄Π½Ρ ΠΌΡ ΠΏΠΎΡΠΌΠΎΡΡΠΈΠΌ, ΠΊΠ°ΠΊ Π½Π°ΡΠΈΡΠΎΠ²Π°ΡΡ ΠΌΠΈΠ½ΡΠΎΠ½Π°-Π΄Π΅Π²ΠΎΡΠΊΡ.
Π ΠΈΡΡΠ΅ΠΌ ΡΡΠΊΠΈΠ·
Π‘ΡΡΠ°Π½Π½ΡΠ΅ ΡΡΡΠ΅ΡΡΠ²Π° ΠΎΡΠ΅Π½Ρ ΠΏΠΎΡ
ΠΎΠΆΠΈ Π΄ΡΡΠ³ Π½Π° Π΄ΡΡΠ³Π°. ΠΠ΄Π½Π°ΠΊΠΎ Ρ ΠΊΠ°ΠΆΠ΄ΠΎΠ³ΠΎ ΠΈΠ· ΠΈΡ
Π΅ΡΡΡ ΠΊΠ°ΠΊΠ°Ρ-Π½ΠΈΠ±ΡΠ΄Ρ ΠΎΡΠ»ΠΈΡΠΈΡΠ΅Π»ΡΠ½Π°Ρ ΡΠ΅ΡΡΠ°. ΠΠ΄Π½ΠΈ ΠΈΠΌΠ΅ΡΡ Π΅Π΄ΠΈΠ½ΡΡΠ²Π΅Π½Π½ΡΠΉ Π³Π»Π°Π·, Π΄ΡΡΠ³ΠΈΠ΅ — ΡΠΈΠΎΠ»Π΅ΡΠΎΠ²ΡΠ΅ Π²ΠΎΠ»ΠΎΡΡ, ΡΡΠ΅ΡΡΠΈ — Π²ΠΎΠΎΠ±ΡΠ΅ Π»ΡΡΡΠ΅. ΠΠΌΠ΅Π½Π½ΠΎ ΠΏΠΎΡΡΠΎΠΌΡ Π±Π°Π·ΠΎΠ²ΡΠ΅ ΡΠΎΡΠΌΡ ΠΌΠΈΠ½ΡΠΎΠ½ΠΎΠ² Π±ΡΠ΄ΡΡ ΠΎΠ΄ΠΈΠ½Π°ΠΊΠΎΠ²ΡΠΌΠΈ. ΠΠ°ΡΠ½Π΅ΠΌ Ρ ΡΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΡ ΡΡΠ°Π½Π΄Π°ΡΡΠ½ΠΎΠ³ΠΎ ΡΡΠΊΠΈΠ·Π°. Π’Π΅Π»ΠΎ ΠΌΠΈΠ½ΡΠΎΠ½Π° ΠΏΡΠ΅Π΄ΡΡΠ°Π²Π»ΡΠ΅Ρ ΡΠΎΠ±ΠΎΠΉ Π²ΡΡΡΠ½ΡΡΡΠΉ ΠΎΠ²Π°Π» ΠΈΠ»ΠΈ Π½Π΅ΠΏΡΠ°Π²ΠΈΠ»ΡΠ½ΡΠΉ ΠΏΡΡΠΌΠΎΡΠ³ΠΎΠ»ΡΠ½ΠΈΠΊ Π±Π΅Π· ΡΠ³Π»ΠΎΠ². ΠΠΌΠ΅Π½Π½ΠΎ ΡΡΡ ΡΠΈΠ³ΡΡΡ ΠΈ Π½ΡΠΆΠ½ΠΎ Π±ΡΠ΄Π΅Ρ Π½Π°ΡΠΈΡΠΎΠ²Π°ΡΡ. Π’Π΅ΠΏΠ΅ΡΡ ΠΈΠ·ΠΎΠ±ΡΠ°Π·ΠΈΠΌ ΠΎΡΠΊΠΈ. ΠΠ°ΡΠ° Π΄Π΅Π²ΠΎΡΠΊΠ° Π±ΡΠ΄Π΅Ρ Ρ ΠΎΠ΄Π½ΠΈΠΌ Π³Π»Π°Π·ΠΎΠΌ, Π·Π½Π°ΡΠΈΡ, ΠΈ ΠΎΠΊΡΠ»ΡΡΡ Π½ΡΠΆΠ½ΠΎ ΡΠΎΠ·Π΄Π°ΡΡ ΡΠΎΠΎΡΠ²Π΅ΡΡΡΠ²ΡΡΡΠΈΠ΅. ΠΠ°ΡΠΈΡΡΠΉΡΠ΅ ΠΊΡΡΠ³, Π²Π½ΡΡΡΠΈ Π½Π΅Π³ΠΎ Π΅ΡΠ΅ ΠΎΠ΄ΠΈΠ½, Π° Π·Π°ΡΠ΅ΠΌ ΡΠ΅Π·ΠΈΠ½ΠΊΡ Π΄Π»Ρ ΠΎΡΠΊΠΎΠ² Ρ ΠΎΠ±Π΅ΠΈΡ
ΡΡΠΎΡΠΎΠ½ Π»ΠΈΠ½Π·Ρ. ΠΠ°Π»Π΅Π΅ ΠΎΡΠΌΠ΅ΡΡΡΠ΅ Π»ΠΈΠ½ΠΈΠΈ Π³Π»Π°Π· β Π΄Π²Π΅ ΡΠ΅ΡΡΠΎΡΠΊΠΈ Π²Π½ΡΡΡΠΈ ΠΊΡΡΠ³Π°. ΠΠ°ΡΠ΅ΠΌ ΠΏΠΎΡΡΠ°Π²ΡΡΠ΅ ΠΆΠΈΡΠ½ΡΡ ΡΠΎΡΠΊΡ ΠΏΠΎΡΡΠ΅Π΄ΠΈΠ½Π΅ ΠΎΠΊΡΠ»ΡΡΠ°. ΠΠΎΡ Π½Π°Ρ Π³Π»Π°Π· Π³ΠΎΡΠΎΠ². ΠΡΠ»ΠΈ Π²Ρ Π±ΡΠ΄Π΅ΡΠ΅ Π²Π½ΠΈΠΌΠ°ΡΠ΅Π»ΡΠ½Ρ, ΡΠΎ Π±ΡΡΡΡΠΎ ΡΠ°Π·Π±Π΅ΡΠ΅ΡΠ΅ΡΡ, ΠΊΠ°ΠΊ Π½Π°ΡΠΈΡΠΎΠ²Π°ΡΡ ΠΌΠΈΠ½ΡΠΎΠ½Π°-Π΄Π΅Π²ΠΎΡΠΊΡ ΠΏΠΎΡΡΠ°ΠΏΠ½ΠΎ. Π’Π΅ΠΏΠ΅ΡΡ ΠΈΠ·ΠΎΠ±ΡΠ°Π·ΠΈΠΌ ΡΡΠΊΠΈ β ΠΏΠΎ Π΄Π²Π΅ ΡΠΎΠ½ΠΊΠΈΠ΅ Π»ΠΈΠ½ΠΈΠΈ, ΠΈΡΡ
ΠΎΠ΄ΡΡΠΈΠ΅ ΠΎΡ ΡΠ΅Π½ΡΡΠ° ΠΎΠ²Π°Π»Π°. ΠΠ° ΠΎΡΠ½ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠΈ — ΡΠ°ΠΌ, Π³Π΄Π΅ Π΄ΠΎΠ»ΠΆΠ½Ρ Π±ΡΡΡ ΡΡΠΊΠΈ, — Π½Π°ΡΠΈΡΡΠΉΡΠ΅ ΠΏΠ΅ΡΡΠ°ΡΠΊΠΈ.
Π£ΡΠΎΠΊΠΈ ΡΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΡ. ΠΠ°ΠΊ ΠΏΡΠ°Π²ΠΈΠ»ΡΠ½ΠΎ Π½Π°ΡΠΈΡΠΎΠ²Π°ΡΡ ΠΊΠΎΡΠΈΡΠΊΡ ΠΏΡΠΎΡΡΡΠΌ…
Π£ ΠΌΠ½ΠΎΠ³ΠΈΡ Π½Π°ΡΠΈΠ½Π°ΡΡΠΈΡ Ρ ΡΠ΄ΠΎΠΆΠ½ΠΈΡ Π²ΠΎΠ·Π½ΠΈΠΊΠ°Π΅Ρ Π²ΠΎΠΏΡΠΎΡ, ΠΊΠ°ΠΊ Π½Π°ΡΠΈΡΠΎΠ²Π°ΡΡ ΠΊΠΎΡΠΈΡΠΊΡ. Π‘Π΄Π΅Π»Π°ΡΡ ΡΡΠΎ ΡΠΎΠ²ΡΠ΅ΠΌ Π½Π΅…
ΠΠ·ΠΎΠ±ΡΠ°ΠΆΠ°Π΅ΠΌ ΠΏΠ»Π°ΡΡΠ΅
Π§ΡΠΎΠ±Ρ ΡΠ°Π·ΠΎΠ±ΡΠ°ΡΡΡΡ, ΠΊΠ°ΠΊ Π½Π°ΡΠΈΡΠΎΠ²Π°ΡΡ ΠΌΠΈΠ½ΡΠΎΠ½Π°-Π΄Π΅Π²ΠΎΡΠΊΡ, ΡΠ°ΡΡΠΌΠΎΡΡΠΈΡΠ΅ ΠΊΠ°ΡΡΠΈΠ½ΠΊΠΈ, ΠΊΠΎΡΠΎΡΡΠ΅ ΠΌΠΎΠΆΠ½ΠΎ ΡΠ²ΠΈΠ΄Π΅ΡΡ Π·Π΄Π΅ΡΡ ΠΆΠ΅. ΠΠ°ΡΠ° Π»Π΅Π΄ΠΈ Π΄ΠΎΠ»ΠΆΠ½Π° ΠΈΠΌΠ΅ΡΡ ΠΊΡΠ°ΡΠΈΠ²ΡΡ ΠΎΠ΄Π΅ΠΆΠ΄Ρ ΠΈ ΠΏΡΡΠ½ΡΡ ΠΏΡΠΈΡΠ΅ΡΠΊΡ. ΠΠ»Π°ΡΡΠ΅ Π½Π°ΡΠΈΡΠΎΠ²Π°ΡΡ ΠΎΡΠ΅Π½Ρ ΠΏΡΠΎΡΡΠΎ. ΠΡΠΎΡΠ΅ΡΡΠΈΡΠ΅ Π³ΠΎΡΠΈΠ·ΠΎΠ½ΡΠ°Π»ΡΠ½ΡΡ Π»ΠΈΠ½ΠΈΡ ΡΠ°ΠΌ, Π³Π΄Π΅ Π·Π°ΠΊΠ°Π½ΡΠΈΠ²Π°ΡΡΡΡ ΡΡΠΊΠΈ, Π° ΡΠ°ΠΊΠΆΠ΅ Π΅ΡΠ΅ ΠΎΠ΄Π½Ρ — ΡΠ°ΠΌ, Π³Π΄Π΅ ΡΡΠΊΠΈ Π½Π°ΡΠΈΠ½Π°ΡΡΡΡ. ΠΠΎΡΠΈΡΡΠΉΡΠ΅ Π»ΡΠΌΠΊΠΈ, ΠΈ ΠΏΡΠ΅Π»Π΅ΡΡΠ½ΡΠΉ ΡΠ°ΡΠ°ΡΠ°Π½ΡΠΈΠΊ Π΄Π»Ρ ΠΌΠΈΠ½ΡΠΎΠ½Π° Π³ΠΎΡΠΎΠ². ΠΡΡΠ°Π»ΠΎΡΡ ΡΠΊΡΠ°ΡΠΈΡΡ Π΅Π³ΠΎ ΡΠ²Π΅ΡΠΎΡΠΊΠ°ΠΌΠΈ ΠΈΠ»ΠΈ Π³ΠΎΡΠΎΡΠΊΠΎΠΌ. Π‘Π½ΠΈΠ·Ρ ΠΏΠΎΠ΄ΡΠΈΡΡΠΉΡΠ΅ ΡΡΡΠΏΠ½ΠΈ Π½ΠΎΠ³. Π’Π΅ΠΏΠ΅ΡΡ Π½Π°Ρ ΡΠΈΡΡΠ½ΠΎΠΊ ΠΏΠΎΡΡΠΈ Π³ΠΎΡΠΎΠ², ΠΎΡΡΠ°Π»ΠΎΡΡ ΡΠΎΠ²ΡΠ΅ΠΌ Π½Π΅ΠΌΠ½ΠΎΠ³ΠΎ.
ΠΡΠΎΡΠΈΡΠΎΠ²ΡΠ²Π°Π΅ΠΌ Π΄Π΅ΡΠ°Π»ΠΈ
ΠΡ ΡΠΆΠ΅ ΠΏΠΎΠ½ΡΠ»ΠΈ, ΡΡΠΎ ΡΠ°Π·ΠΎΠ±ΡΠ°ΡΡΡΡ Π² ΡΠΎΠΌ, ΠΊΠ°ΠΊ Π½Π°ΡΠΈΡΠΎΠ²Π°ΡΡ ΠΌΠΈΠ½ΡΠΎΠ½Π°-Π΄Π΅Π²ΠΎΡΠΊΡ ΠΊΠ°ΡΠ°Π½Π΄Π°ΡΠΎΠΌ, Π²ΠΎΠ²ΡΠ΅ Π½Π΅ ΡΠ»ΠΎΠΆΠ½ΠΎ. ΠΠ΄Π½Π°ΠΊΠΎ Π½Π°Ρ ΡΠ΅Π΄Π΅Π²Ρ ΡΡΠ΅Π±ΡΠ΅Ρ ΠΏΠΎΠ΄Π³ΠΎΡΠΎΠ²ΠΊΠΈ. ΠΠ°ΠΌ Π½ΡΠΆΠ½ΠΎ ΠΏΠΎΠ»ΡΡΠΈΡΡ ΠΊΡΠ°ΡΠΈΠ²ΡΡ ΠΏΡΠΈΡΠ΅ΡΠΊΡ. ΠΠ»Ρ ΡΡΠΎΠ³ΠΎ ΡΠ½Π°ΡΠ°Π»Π° Π½Π°ΡΠΈΡΡΠ΅ΠΌ ΠΏΡΠΎΠ±ΠΎΡ Π½Π° ΠΌΠ°ΠΊΡΡΠΊΠ΅, ΠΏΡΠΎΠ²Π΅Π΄Ρ Π½Π΅ΡΠΊΠΎΠ»ΡΠΊΠΎ ΡΠΊΠΎΡΠ΅Π½Π½ΡΡ
Π»ΠΈΠ½ΠΈΠΉ. Π’Π΅ΠΏΠ΅ΡΡ ΠΈΠ·ΠΎΠ±ΡΠ°Π·ΠΈΠΌ Π²Π΅ΡΠ΅Π»ΡΠ΅ ΠΊΠΎΡΠΈΡΠΊΠΈ. ΠΠ°ΡΠΈΡΡΠΉΡΠ΅ ΠΏΠΎ Π΄Π²Π΅ ΡΠΎΠ½ΠΊΠΈΡ
Π»ΠΈΠ½ΠΈΠΈ, ΡΠΎΡΡΠ°ΡΠΈΡ
Π² ΡΠ°Π·Π½ΡΠ΅ ΡΡΠΎΡΠΎΠ½Ρ. ΠΠ° ΠΊΠΎΠ½ΡΠΈΠΊΠ΅ ΠΊΠ°ΠΆΠ΄ΠΎΠΉ ΠΊΠΎΡΠΈΡΠΊΠΈ ΡΠΎΠ·Π΄Π°ΠΉΡΠ΅ ΠΏΠΎ ΠΏΡΡΠΈΡΡΠΎΠΉ ΠΊΠΈΡΡΠΎΡΠΊΠ΅. ΠΠ»Ρ ΡΡΠΎΠ³ΠΎ ΠΏΡΠΎΠ²Π΅Π΄ΠΈΡΠ΅ Π½Π΅ΡΠΊΠΎΠ»ΡΠΊΠΎ ΠΊΠΎΡΠΎΡΠΊΠΈΡ
ΡΠ΅ΡΡΠΎΡΠ΅ΠΊ Π² ΡΠ°Π·Π½ΡΠ΅ ΡΡΠΎΡΠΎΠ½Ρ. ΠΡΠΈ ΠΆΠ΅Π»Π°Π½ΠΈΠΈ ΠΌΠΎΠΆΠ½ΠΎ ΠΈΠ·ΠΎΠ±ΡΠ°Π·ΠΈΡΡ Π±Π°Π½ΡΠΈΠΊΠΈ ΠΈΠ»ΠΈ Π²Π΅ΡΠ΅Π»ΡΠ΅ ΡΠ΅Π·ΠΈΠ½ΠΊΠΈ. Π£ΠΆΠ΅ ΠΏΠΎΡΡΠΈ ΠΏΠΎΠ½ΡΡΠ½ΠΎ, ΠΊΠ°ΠΊ Π½Π°ΡΠΈΡΠΎΠ²Π°ΡΡ ΠΌΠΈΠ½ΡΠΎΠ½Π°-Π΄Π΅Π²ΠΎΡΠΊΡ. ΠΡΡΠ°Π»ΠΎΡΡ ΠΈΠ·ΠΎΠ±ΡΠ°Π·ΠΈΡΡ ΡΠΎΡ. ΠΠ»Ρ ΡΡΠΎΠ³ΠΎ Π² Π½ΡΠΆΠ½ΠΎΠΌ ΠΌΠ΅ΡΡΠ΅ Π½Π°ΡΠΈΡΡΠΉΡΠ΅ Π΄Π²Π΅ Π½Π΅Π±ΠΎΠ»ΡΡΠΈΠ΅ Π΄ΡΠ³ΠΈ. ΠΠΎ ΡΡΡ ΠΏΡΠΎΡΠΈΡΡΠΉΡΠ΅ Π½Π΅ΡΠΊΠΎΠ»ΡΠΊΠΎ Π·ΡΠ±ΠΎΠ². Π’Π°ΠΊΠΈΠΌ ΠΎΠ±ΡΠ°Π·ΠΎΠΌ, ΠΊΠ°ΠΆΠ΅ΡΡΡ, ΡΡΠΎ Π΄Π΅Π²ΠΎΡΠΊΠ° ΡΠ»ΡΠ±Π°Π΅ΡΡΡ. ΠΡΡΠ°Π»ΠΎΡΡ ΡΠ°ΡΠΊΡΠ°ΡΠΈΡΡ Π½Π°ΡΡ ΠΌΠΎΠ΄Π΅Π»Ρ. ΠΠΎΠ·ΡΠΌΠΈΡΠ΅ ΠΊΡΠ°ΡΠΊΠΈ ΠΈΠ»ΠΈ ΡΠ²Π΅ΡΠ½ΡΠ΅ ΠΊΠ°ΡΠ°Π½Π΄Π°ΡΠΈ. ΠΠ°ΠΊ ΠΏΡΠ°Π²ΠΈΠ»ΠΎ, ΠΌΠΈΠ½ΡΠΎΠ½Ρ Π±ΡΠ²Π°ΡΡ ΠΆΠ΅Π»ΡΠΎΠ³ΠΎ ΡΠ²Π΅ΡΠ°. ΠΡ
ΠΎΡΠΊΠΈ β ΡΠ΅ΡΡΠ΅, Π° ΠΏΠ΅ΡΡΠ°ΡΠΊΠΈ ΠΈ ΡΡΡΠ»ΠΈ β ΡΠ΅ΡΠ½ΠΎΠ³ΠΎ ΠΎΡΡΠ΅Π½ΠΊΠ°. ΠΠ»Π°ΡΡΠ΅ ΠΌΠΎΠΆΠ΅Ρ Π±ΡΡΡ Π»ΡΠ±ΠΎΠ³ΠΎ ΡΠ²Π΅ΡΠ°. ΠΠΈΠ½ΡΠΎΠ½Ρ ΠΏΡΠ΅Π΄ΠΏΠΎΡΠΈΡΠ°ΡΡ ΡΠΈΠ½ΠΈΠΉ ΠΎΡΡΠ΅Π½ΠΎΠΊ. ΠΠ΅ Π·Π°Π±ΡΠ΄ΡΡΠ΅ Β«ΠΎΠΆΠΈΠ²ΠΈΡΡΒ» ΡΡΠΊΠΈΠΌΠΈ ΡΠΎΠ½Π°ΠΌΠΈ Π±Π°Π½ΡΠΈΠΊΠΈ, ΡΠΎΡ ΠΈΠ»ΠΈ Π³Π»Π°Π·Π°. ΠΡΠ°ΠΊ, ΡΠ΅ΠΏΠ΅ΡΡ Π²Ρ Π·Π½Π°Π΅ΡΠ΅, ΠΊΠ°ΠΊ Π½Π°ΡΠΈΡΠΎΠ²Π°ΡΡ ΠΌΠΈΠ½ΡΠΎΠ½Π°-Π΄Π΅Π²ΠΎΡΠΊΡ. ΠΠ·ΡΡΠΈΠ² ΡΡΠ°Π½Π΄Π°ΡΡΠ½ΡΡ ΡΠ΅Ρ
Π½ΠΈΠΊΡ, ΠΏΠΎΠΏΡΠΎΠ±ΡΠΉΡΠ΅ ΠΈΠ·ΠΎΠ±ΡΠ°Π·ΠΈΡΡ Π΄ΡΡΠ·Π΅ΠΉ Π²Π°ΡΠ΅Π³ΠΎ ΠΆΠΈΠ·Π½Π΅ΡΠ°Π΄ΠΎΡΡΠ½ΠΎΠ³ΠΎ ΡΡΡΠ΅ΡΡΠ²Π°.
ΠΠΌΠ΅ΡΡΠ΅ ΡΠΎ ΡΠ²ΠΎΠΈΠΌ ΡΠ΅Π±Π΅Π½ΠΊΠΎΠΌ Π²Ρ ΡΠΌΠΎΠΆΠ΅ΡΠ΅ ΡΠΎΠ·Π΄Π°ΡΡ ΡΠ΅Π»ΡΡ Π°ΡΠΌΠΈΡ ΡΠΌΠ΅ΡΠ½ΡΡ
ΠΈ Π±Π΅Π·ΠΎΠ±ΠΈΠ΄Π½ΡΡ
ΠΌΠ°Π»ΡΡΠ΅ΠΉ.
ΠΡΠΈΠΊΠ»ΡΡΠ΅Π½ΠΈΡ Ρ ONT MinION Π½Π° ΠΊΡΡΡΠ΅ ΠΌΠΈΠΊΡΠΎΠ±Π½ΠΎΠ³ΠΎ ΡΠ°Π·Π½ΠΎΠΎΠ±ΡΠ°Π·ΠΈΡ MBL
ΠΠΎΠ΅ Π²ΡΠ΅ΠΌΡ Π·Π΄Π΅ΡΡ, Π½Π° ΠΊΡΡΡΠ΅ ΠΌΠΈΠΊΡΠΎΠ±Π½ΠΎΠ³ΠΎ ΡΠ°Π·Π½ΠΎΠΎΠ±ΡΠ°Π·ΠΈΡ Π² MBL, ΠΏΠΎΠ΄ΠΎΡΠ»ΠΎ ΠΊ ΠΊΠΎΠ½ΡΡ ΠΏΠΎΡΠ»Π΅ ΡΠΎΠ³ΠΎ, ΠΊΠ°ΠΊ Ρ Π² ΡΠ΅ΡΠ΅Π½ΠΈΠ΅ ΠΏΠΎΡΠ»Π΅Π΄Π½ΠΈΡ 2 Π½Π΅Π΄Π΅Π»Ρ ΠΏΠΎΡΠ΅ΡΠ°Π» Π½Π°ΡΡ Π»Π°Π±ΠΎΡΠ°ΡΠΎΡΠΈΡ MinION Π΄Π»Ρ ΡΠ΅ΠΊΠ²Π΅Π½ΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΡ Π³Π΅Π½ΠΎΠΌΠΎΠ² ΠΈΠ· Π±Π°ΠΊΡΠ΅ΡΠΈΠ°Π»ΡΠ½ΡΡ ΠΈΠ·ΠΎΠ»ΡΡΠΎΠ², ΠΊΠΎΡΠΎΡΡΠ΅ ΡΡΡΠ΄Π΅Π½ΡΡ ΡΠΎΠ±ΡΠ°Π»ΠΈ Π² Trunk Π Π΅ΠΊΠ° Π² ΠΡΠ΄Ρ-Π₯ΠΎΡΠ», ΠΠ°ΡΡΠ°ΡΡΡΠ΅ΡΡ. (Π€ΠΎΡΠΎΠ³ΡΠ°ΡΠΈΡ ΠΠΆΠ°ΡΠ΅Π΄Π° ΠΠΈΠ΄Π±Π΅ΡΡΠ΅ΡΠ° ΠΈΠ· Β«EctocoolerΒ» Tenacibaculum sp., Π²ΡΠ΄Π΅Π»Π΅Π½Π½Π°Ρ Π Π΅Π±Π΅ΠΊΠΊΠΎΠΉ ΠΠΈΠΊΠΎΠ»).
Π Π»Π°Π±ΠΎΡΠ°ΡΠΎΡΠΈΠΈ DIB Π’ΠΈΡΡΡΠ° ΠΡΠ°ΡΠ½Π° ΠΌΡ Π±ΡΠ»ΠΈ Π² Π²ΠΎΡΡΠΎΡΠ³Π΅ ΠΎΡ ΡΠ΅ΠΊΠ²Π΅Π½ΡΠΎΡΠ° MinION ΠΎΡ Oxford Nanopore Technologies ΠΏΠΎ Π½Π΅ΡΠΊΠΎΠ»ΡΠΊΠΈΠΌ ΠΏΡΠΈΡΠΈΠ½Π°ΠΌ:
1) ΠΠ°Π»Π΅Π½ΡΠΊΠΈΠΉ ΠΈ ΠΏΠΎΡΡΠ°ΡΠΈΠ²Π½ΡΠΉ. ΠΡΠΎ Π΄Π΅Π»Π°Π΅Ρ MinION ΠΎΡΠ»ΠΈΡΠ½ΡΠΌ ΠΎΠ±ΡΡΠ°ΡΡΠΈΠΌ ΠΈΠ½ΡΡΡΡΠΌΠ΅Π½ΡΠΎΠΌ! ΠΠΎΠΆΠ½ΠΎ Π²Π·ΡΡΡ Π² ΠΌΠ°ΡΡΠ΅ΡΡΠΊΠΈΠ΅. Π‘ΡΡΠ΄Π΅Π½ΡΡ ΠΌΠΎΠ³ΡΡ ΡΠΎΠ±ΠΈΡΠ°ΡΡ ΠΎΠ±ΡΠ°Π·ΡΡ, ΠΈΠ·Π²Π»Π΅ΠΊΠ°ΡΡ ΠΠΠ, Π³ΠΎΡΠΎΠ²ΠΈΡΡ Π±ΠΈΠ±Π»ΠΈΠΎΡΠ΅ΠΊΠΈ, ΡΠ΅ΠΊΠ²Π΅Π½ΠΈΡΠΎΠ²Π°ΡΡ ΠΈ ΡΡΠΈΡΡΡΡ ΠΈΡΠΏΠΎΠ»ΡΠ·ΠΎΠ²Π°ΡΡ ΠΏΡΠΎΠ³ΡΠ°ΠΌΠΌΠ½ΡΠ΅ ΠΈΠ½ΡΡΡΡΠΌΠ΅Π½ΡΡ Π±ΠΈΠΎΠΈΠ½ΡΠΎΡΠΌΠ°ΡΠΈΠΊΠΈ Π΄Π»Ρ ΡΠ±ΠΎΡΠΊΠΈ ΠΈ Π°Π½Π½ΠΎΡΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΡ Π² ΡΠ΅ΡΠ΅Π½ΠΈΠ΅ 1 Π½Π΅Π΄Π΅Π»ΠΈ.
2. ) ΠΡ Π·Π°ΠΈΠ½ΡΠ΅ΡΠ΅ΡΠΎΠ²Π°Π½Ρ Π² ΡΠ°Π·ΡΠ°Π±ΠΎΡΠΊΠ΅ ΠΏΡΠΎΠ³ΡΠ°ΠΌΠΌΠ½ΠΎΠ³ΠΎ ΠΎΠ±Π΅ΡΠΏΠ΅ΡΠ΅Π½ΠΈΡ Π΄Π»Ρ ΠΏΠΎΡΠΎΠΊΠΎΠ²ΠΎΠΉ ΠΏΠ΅ΡΠ΅Π΄Π°ΡΠΈ, ΡΠΎΠ²ΠΌΠ΅ΡΡΠΈΠΌΠΎΠ³ΠΎ Ρ ΡΠ΅ΠΊΠ²Π΅Π½ΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠ΅ΠΌ ->
3.) ΠΠ»ΠΈΠ½Π½ΡΠ΅ ΡΡΠ΅Π½ΠΈΡ ΠΌΠΎΠΆΠ½ΠΎ ΠΈΡΠΏΠΎΠ»ΡΠ·ΠΎΠ²Π°ΡΡ ΡΠ°ΠΊ ΠΆΠ΅, ΠΊΠ°ΠΊ ΠΈ Π΄Π°Π½Π½ΡΠ΅ PacBio, Π΄Π»Ρ Π²ΡΠ΄Π΅Π»Π΅Π½ΠΈΡ ΡΠ±ΠΎΡΠΎΠΊ Π³Π΅Π½ΠΎΠΌΠ° ΠΈ ΡΡΠ°Π½ΡΠΊΡΠΈΠΏΡΠΎΠΌΠ° (!) ΠΈΠ· ΡΡΡΠ΅ΡΡΠ²ΡΡΡΠΈΡ Π΄Π°Π½Π½ΡΡ Illumina.
Π Π°Π±ΠΎΡΠ° Ρ Π»ΡΠ±ΠΎΠΉ Π½ΠΎΠ²ΠΎΠΉ ΡΠ΅Ρ Π½ΠΎΠ»ΠΎΠ³ΠΈΠ΅ΠΉ, ΠΎΡΠΎΠ±Π΅Π½Π½ΠΎ ΠΎΡ Π½ΠΎΠ²ΠΎΠΉ ΠΊΠΎΠΌΠΏΠ°Π½ΠΈΠΈ, ΡΡΠ΅Π±ΡΠ΅Ρ ΡΡΡΡΠ°Π½Π΅Π½ΠΈΡ Π½Π΅ΠΏΠΎΠ»Π°Π΄ΠΎΠΊ. Π₯ΠΎΡΡ ΠΏΠΎΡΡΡ Π² Π’Π²ΠΈΡΡΠ΅ΡΠ΅ β ΡΡΠΎ ΠΊΡΡΡΠΎ, ΠΎΠ½ΠΈ, ΠΊΠ°ΠΊ ΠΏΡΠ°Π²ΠΈΠ»ΠΎ, Π΄Π΅Π»Π°ΡΡ ΠΈΡ ΠΎΡΠ΅Π½Ρ ΠΏΡΠΎΡΡΡΠΌΠΈ. Π‘ΡΡΠ΅ΡΡΠ²ΡΠ΅Ρ ΡΠΎΠΎΠ±ΡΠ΅ΡΡΠ²ΠΎ MAP Π΄Π»Ρ ΠΏΠΎΠ»ΡΠ·ΠΎΠ²Π°ΡΠ΅Π»Π΅ΠΉ MinION, Π½ΠΎ ΡΡΠ΅Π±ΡΠ΅ΡΡΡ Π²Ρ ΠΎΠ΄ Π² ΡΠΈΡΡΠ΅ΠΌΡ, Π° ΠΏΡΠ±Π»ΠΈΡΠ½ΡΠΉ ΠΏΠΎΠΈΡΠΊ Π½Π΅Π²ΠΎΠ·ΠΌΠΎΠΆΠ΅Π½. ΠΠΎ ΡΡΠ°Π²Π½Π΅Π½ΠΈΡ Ρ ΡΠ΅ΠΊΠ²Π΅Π½ΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠ΅ΠΌ Illumina ΠΏΠΎΠΊΠ° Π½Π΅ ΡΠ°ΠΊ ΠΌΠ½ΠΎΠ³ΠΎ ΠΎΠΏΡΡΠ°.
ΠΠ»Π°Π³ΠΎΠ΄Π°ΡΠ½ΠΎΡΡΠΈ
ΠΡ ΠΎΠ±ΡΡΠ½ΠΎ ΡΠΎΡ ΡΠ°Π½ΡΡΡ Π² ΠΊΠΎΠ½ΡΠ΅, Π½ΠΎ, ΠΏΠΎΡΠΊΠΎΠ»ΡΠΊΡ ΡΡΠΎ Π΄Π»ΠΈΠ½Π½ΡΠΉ ΠΏΠΎΡΡ Π² Π±Π»ΠΎΠ³Π΅, Ρ ΠΏΠΎΠ΄ΡΠΌΠ°Π», ΡΡΠΎ Π½Π°ΡΠ½Ρ Ρ Π±Π»Π°Π³ΠΎΠ΄Π°ΡΠ½ΠΎΡΡΠΈ.
ΠΠ½Π΅ ΠΎΡΠ΅Π½Ρ ΠΏΠΎΠΌΠΎΠ³Π»ΠΈ ΡΠΎΠΎΠ±ΡΠ΅Π½ΠΈΡ Π² Π±Π»ΠΎΠ³Π°Ρ ΠΎΡ ΠΠΈΡΠ° Π ΠΎΠ±ΠΈΡΠΎΠ½Π° ΠΈ ΠΎΠ΄ΠΈΠ½ΠΎΠΊΠΎΠ³ΠΎ ΠΠΆΠΎΠΏΠ°ΡΠΊΠ΅ΡΠ°. ΠΠΏΡΡ ΠΠΈΠΊΠ° ΠΠΎΠΌΠ°Π½Π° ΠΈ ΠΠΆΠΎΡΠ° ΠΡΠΈΠΊΠ° ΡΠ°ΠΊΠΆΠ΅ ΠΎΠΊΠ°Π·Π°Π»ΡΡ ΠΏΠΎΠ»Π΅Π·Π½ΡΠΌ.
Π’Π΅ΠΌ Π½Π΅ ΠΌΠ΅Π½Π΅Π΅, Π½Π΅Ρ ΡΠ°Π²Π½ΡΡ
ΠΏΠΎ ΠΊΠΎΠ»ΠΈΡΠ΅ΡΡΠ²Ρ Π»ΡΠ΄Π΅ΠΉ, Ρ ΠΊΠΎΡΠΎΡΡΠΌΠΈ ΠΌΠΎΠΆΠ½ΠΎ Π»ΠΈΡΠ½ΠΎ ΠΏΠΎΠ³ΠΎΠ²ΠΎΡΠΈΡΡ ΠΎ ΡΠ΅Ρ
Π½ΠΈΡΠ΅ΡΠΊΠΈΡ
ΠΏΡΠΎΠ±Π»Π΅ΠΌΠ°Ρ
.
ΠΡΠ° ΠΏΠΎΠ΅Π·Π΄ΠΊΠ° ΡΡΠ°Π»Π° Π²ΠΎΠ·ΠΌΠΎΠΆΠ½ΠΎΠΉ Π±Π»Π°Π³ΠΎΠ΄Π°ΡΡ ΠΏΠΎΠ΄Π΄Π΅ΡΠΆΠΊΠ΅ ΠΌΠΎΠ΅Π³ΠΎ ΡΠ°ΡΡΠ½ΠΎΠ³ΠΎ ΡΠ°ΡΡΠ½ΠΎΠ³ΠΎ Π»ΠΈΡΠ°, Π’ΠΈΡΡΡΠ° ΠΡΠ°ΡΠ½Π°, ΠΊΠΎΡΠΎΡΡΠΉ ΠΏΡΠ΅Π΄ΠΎΡΡΠ°Π²ΠΈΠ» ΡΠΈΠ½Π°Π½ΡΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠ΅ Π΄Π»Ρ ΠΌΠΎΠ΅ΠΉ ΠΏΠΎΠ΅Π·Π΄ΠΊΠΈ ΠΈ Π²ΡΠ΅Ρ ΠΏΡΠΎΡΠΎΡΠ½ΡΡ ΡΡΠ΅Π΅ΠΊ ΠΈ ΡΠ΅Π°Π³Π΅Π½ΡΠΎΠ² Π΄Π»Ρ ΡΠ΅ΠΊΠ²Π΅Π½ΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΡ MinION. ΠΠ΅ΠΎΠ±Ρ ΠΎΠ΄ΠΈΠΌΠΎ Π±ΡΠ»ΠΎ ΠΈΠΌΠ΅ΡΡ ΡΡΠΎΡ Π΄Π²ΡΡ Π½Π΅Π΄Π΅Π»ΡΠ½ΡΠΉ Π±Π»ΠΎΠΊ Π²ΡΠ΅ΠΌΠ΅Π½ΠΈ, ΡΡΠΎΠ±Ρ ΡΠΎΡΡΠ΅Π΄ΠΎΡΠΎΡΠΈΡΡΡΡ Π½ΠΈ Π½Π° ΡΠ΅ΠΌ Π΄ΡΡΠ³ΠΎΠΌ, ΠΊΡΠΎΠΌΠ΅ ΠΊΠ°ΠΊ Π·Π°ΡΡΠ°Π²ΠΈΡΡ MinION ΡΠ°Π±ΠΎΡΠ°ΡΡ, Π·Π°Π΄Π°Π²Π°ΡΡ Π²ΠΎΠΏΡΠΎΡΡ ΠΈ Π²ΡΡΡΠ½ΡΡΡ, ΡΡΠΎ ΡΠ°Π±ΠΎΡΠ°Π΅Ρ (Π° ΡΡΠΎ Π½Π΅Ρ).
ΠΡΠΎΠ±Π°Ρ Π±Π»Π°Π³ΠΎΠ΄Π°ΡΠ½ΠΎΡΡΡ Π Π΅Π±Π΅ΠΊΠΊΠ΅ ΠΠΈΠΊΠΎΠ» ΠΈ ΠΠΈΡΡΡΠ΅Π½ ΠΡΠΎΠ½Π΄, ΡΠ»ΡΡΠ°ΡΠ΅Π»ΡΠΌ ΠΊΡΡΡΠ° Β«Π Π°Π·Π½ΠΎΠΎΠ±ΡΠ°Π·ΠΈΠ΅ ΠΌΠΈΠΊΡΠΎΠ±ΠΎΠ²Β» Π·Π° Π²ΡΠ΄Π΅Π»Π΅Π½ΠΈΠ΅ ΠΈ ΠΊΡΠ»ΡΡΠΈΠ²ΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠ΅ ΠΎΡΠ΅Π½Ρ Ρ
ΠΎΠ»ΠΎΠ΄Π½ΡΡ
ΠΎΠ±ΡΠ°Π·ΡΠΎΠ² Π±Π°ΠΊΡΠ΅ΡΠΈΠΉ. Π‘ΠΊΠΎΡΡ ΠΠΎΡΡΠΎΠ½ ΠΈΠ· ΠΠ°Π»ΠΈΡΠΎΡΠ½ΠΈΠΉΡΠΊΠΎΠ³ΠΎ ΡΠ½ΠΈΠ²Π΅ΡΡΠΈΡΠ΅ΡΠ° Π² ΠΡΠ²ΠΈΡΠ΅ (ΠΏΡΠ΅ΠΏΠΎΠ΄Π°Π²Π°ΡΠ΅Π»Ρ ΠΊΡΡΡΠ° ΠΌΠΈΠΊΡΠΎΠ±Π½ΠΎΠ³ΠΎ ΡΠ°Π·Π½ΠΎΠΎΠ±ΡΠ°Π·ΠΈΡ) ΡΡΠ³ΡΠ°Π» Π²Π°ΠΆΠ½ΡΡ ΡΠΎΠ»Ρ Π² ΠΈΠ·Π²Π»Π΅ΡΠ΅Π½ΠΈΠΈ ΠΠΠ.
https://www.flickr.com/photos/lpcohen/28192995104/
Π€Π°ΠΉΠ»Ρ: https://github.com/ljcohen/dib_ONP_MinION
Π‘Π»Π°ΠΉΠ΄Ρ ΠΏΡΠ΅Π·Π΅Π½ΡΠ°ΡΠΈΠΈ: https:// Π΄ΠΎΠΊΡΠΌΠ΅Π½ΡΡ.Π³ΡΠ³Π». com/presentation/d/1Zqd1ayumdZqYc5e8bfeul8-57trKGwGdOFUdPc2-mIU/edit?usp=sharing
Π‘ΡΠ°Π·Ρ ΠΏΠΎΡΠ»Π΅ Π²ΠΈΠ·ΠΈΡΠ° Π² ΠΡΠ΄Ρ-Π₯ΠΎΡΠ» Π² MBL Ρ ΠΎΡΠΏΡΠ°Π²ΠΈΠ»ΡΡ Π½Π° Π±ΠΈΠΎΠ»ΠΎΠ³ΠΈΡΠ΅ΡΠΊΡΡ ΡΡΠ°Π½ΡΠΈΡ ββΠΠ΅Π»Π»ΠΎΠ³ ΠΠΠ£ Π² ΠΊΠ°ΡΠ΅ΡΡΠ²Π΅ Π°ΡΡΠΈΡΡΠ΅Π½ΡΠ° ΠΏΠΎ ΠΊΡΡΡΡ NGS 2016Β ΠΈ Π½Π°ΠΏΠΈΡΠ°Π» ΡΡΠΊΠΎΠ²ΠΎΠ΄ΡΡΠ²ΠΎ ΠΏΠΎ Π°Π½Π°Π»ΠΈΠ·Ρ ONP. Π΄Π°Π½Π½ΡΠ΅:
http://angus.readthedocs.io/en/2016/analyzing_nanopore_data.html
ΠΠ°ΠΊΠΎΠ½Π΅Ρ-ΡΠΎ ΠΏΠΎΡΠ²ΠΈΠ»ΡΡ Π½ΠΎΠ²ΡΠΉ @nanopore Mk1B! #micdev2016 @MBLScience cc @ctitusbrown @jessicamizzi @pathogenomenick @Scalene pic.
twitter.com/txJBHpkiOI
β ΠΠΈΠ·Π° ΠΠΎΡΠ½ (@monsterbashseq) 28 ΠΈΡΠ»Ρ 2016 Π³.
ΠΠ°ΠΊΡΠΏΠΊΠΈ ΠΈ Π΄ΠΎΡΡΠ°Π²ΠΊΠ°
Π‘ΠΎΠ²Π΅Ρ: ΠΏΠΎΠ΄ΠΎΠΆΠ΄ΠΈΡΠ΅ 2-3 ΠΌΠ΅ΡΡΡΠ° Π΄Π»Ρ Π·Π°ΠΊΠ°Π·Π°. ΠΡ Π·Π°ΠΊΠ°Π·ΡΠ²Π°Π»ΠΈ Π·Π° ΠΌΠ΅ΡΡΡ Π²ΠΏΠ΅ΡΠ΅Π΄. Π ΡΠΎ Π²ΡΠ΅ΠΌΡ ΠΊΠ°ΠΊ ΡΠ»ΡΠΆΠ±Π° ΠΏΠΎΠ΄Π΄Π΅ΡΠΆΠΊΠΈ ΠΊΠ»ΠΈΠ΅Π½ΡΠΎΠ² ONP, Π²Π΅ΡΠΎΡΡΠ½ΠΎ, ΡΠ°Π±ΠΎΡΠ°Π»Π° ΡΠ²Π΅ΡΡ ΡΡΠΎΡΠ½ΠΎ, ΡΡΠΎΠ±Ρ ΠΎΡΠΏΡΠ°Π²ΠΈΡΡ Π½Π°ΡΠΈ ΠΏΡΠΎΡΠΎΡΠ½ΡΠ΅ ΡΡΠ΅ΠΉΠΊΠΈ ΠΈ Mk1B ΠΏΠΎΡΠ»Π΅ Π½Π΅ΡΠΊΠΎΠ»ΡΠΊΠΈΡ ΡΠ»Π΅ΠΊΡΡΠΎΠ½Π½ΡΡ ΠΏΠΈΡΠ΅ΠΌ, ΡΠ°ΡΠΎΠ² ΠΈ Π·Π²ΠΎΠ½ΠΊΠΎΠ² Ρ ΠΎΡΠΎΠ±ΡΠΌΠΈ ΡΡΠ»ΡΠ³Π°ΠΌΠΈ, Π² Π±ΡΠ΄ΡΡΠ΅ΠΌ Π½Π΅ΡΡΠ½ΠΎ, ΠΌΠΎΠΆΠ΅ΠΌ Π»ΠΈ ΠΌΡ ΡΠ°ΡΡΡΠΈΡΡΠ²Π°ΡΡ Π½Π° Π·Π°ΠΏΠ»Π°Π½ΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½Π½ΡΡ Π΄ΠΎΡΡΠ°Π²ΠΊΡ ΡΠΎ ΡΡΡΠ΄Π΅Π½ΡΠ°ΠΌΠΈ. ΠΠ»Ρ ΡΠ²ΡΠ·ΠΈ ΠΏΠΎΡΡΠ΅Π±ΠΎΠ²Π°Π»ΠΎΡΡ ΠΎΠΊΠΎΠ»ΠΎ Π΄ΡΠΆΠΈΠ½Ρ ΡΠ»Π΅ΠΊΡΡΠΎΠ½Π½ΡΡ ΠΏΠΈΡΠ΅ΠΌ, ΠΈ ΠΌΡ ΡΠ°ΠΊ ΠΈ Π½Π΅ ΡΠΌΠΎΠ³Π»ΠΈ ΠΏΠΎΠ»ΡΡΠΈΡΡ ΠΏΠΎΠ΄ΡΠ²Π΅ΡΠΆΠ΄Π΅Π½ΠΈΠ΅ ΡΠΎΠ³ΠΎ, ΡΡΠΎ ΠΏΡΠΎΡΠΎΡΠ½ΡΠ΅ ΡΡΠ΅ΠΉΠΊΠΈ Π±ΡΠ΄ΡΡ Π΄ΠΎΡΡΠ°Π²Π»Π΅Π½Ρ Π²ΠΎΠ²ΡΠ΅ΠΌΡ ΠΊ ΠΊΡΡΡΡ. ΠΠΎΠ»ΡΡΠ°Π΅ΡΡΡ, ΡΡΠΎ Π½Π°Ρ Π·Π°ΠΊΠ°Π· Π±ΡΠ» ΠΎΡΠΏΡΠ°Π²Π»Π΅Π½ ΠΈ ΠΏΡΠΈΠ±ΡΠ» Π²ΠΎΠ²ΡΠ΅ΠΌΡ, ΠΎΠ΄Π½Π°ΠΊΠΎ ΠΌΡ Π½Π΅ Π·Π½Π°Π»ΠΈ ΠΎΠ± ΡΡΠΎΠΌ, ΠΏΠΎΡΠΎΠΌΡ ΡΡΠΎ Π½Π°ΠΌ Π½Π΅ Π±ΡΠ» ΠΎΡΠΏΡΠ°Π²Π»Π΅Π½ ΡΡΠ΅ΠΊ-Π½ΠΎΠΌΠ΅Ρ. ΠΠ° ΠΎΡΠΏΡΠ°Π²ΠΊΡ ΠΏΠΈΡΠ΅ΠΌ ΠΏΠΎ ΡΠ»Π΅ΠΊΡΡΠΎΠ½Π½ΠΎΠΉ ΠΏΠΎΡΡΠ΅ ΠΈ ΠΎΠΆΠΈΠ΄Π°Π½ΠΈΠ΅ ΠΎΡΡΠ»Π΅ΠΆΠΈΠ²Π°Π½ΠΈΡ ΡΡΠΈΠΊΠΎΠ² ΡΡΠ»ΠΎ ΠΎΠΊΠΎΠ»ΠΎ Π΄Π½Ρ. Π ΡΡΠ°ΡΡΡΡ, ΠΊΠΎΡΠΎΠ±ΠΊΠΈ ΠΏΡΠ°Π²ΠΈΠ»ΡΠ½ΠΎ Ρ ΡΠ°Π½ΠΈΠ»ΠΈΡΡ Π½Π° ΡΠΊΠ»Π°Π΄Π΅ MBL.
ΠΠΎΡΡΠΎΡΠ½Π½ΠΎ ΡΠ²ΡΠ·ΡΠ²Π°ΠΉΡΠ΅ΡΡ Ρ ONP. ΠΡΠ΄ΡΡΠ΅ Π² ΠΊΡΡΡΠ΅ ΠΎΡΠΏΡΠ°Π²Π»Π΅Π½ΠΈΠΉ, Π·Π°ΠΏΡΠ°ΡΠΈΠ²Π°ΠΉΡΠ΅ Π½ΠΎΠΌΠ΅ΡΠ° Π΄Π»Ρ ΠΎΡΡΠ»Π΅ΠΆΠΈΠ²Π°Π½ΠΈΡ ΠΈ ΠΏΠΎΠ΄ΡΠ²Π΅ΡΠΆΠ΄Π΅Π½ΠΈΠ΅ ΠΎΡΠΏΡΠ°Π²ΠΊΠΈ. Π£Π·Π½Π°ΠΉΡΠ΅, ΠΊΡΠ΄Π° Π΄ΠΎΡΡΠ°Π²Π»ΡΠ΅ΡΡΡ ΠΏΠΎΡΡΠ»ΠΊΠ°, ΡΠ°ΠΊ ΠΊΠ°ΠΊ Π²Π²Π΅Π΄Π΅Π½Π½ΡΠΉ Π²Π°ΠΌΠΈ Π°Π΄ΡΠ΅Ρ ΠΌΠΎΠΆΠ΅Ρ Π½Π΅ ΡΠΎΠ²ΠΏΠ°Π΄Π°ΡΡ Ρ Π°Π΄ΡΠ΅ΡΠΎΠΌ, ΡΠΊΠ°Π·Π°Π½Π½ΡΠΌ Π½Π° ΠΊΠΎΡΠΎΠ±ΠΊΠ΅, ΠΈ Π²Π°Ρ Π·Π°ΠΊΠ°Π· Π±ΡΠ΄Π΅Ρ Π΄ΠΎΡΡΠ°Π²Π»Π΅Π½ Π½Π΅ ΡΡΠ΄Π°.
ΠΡΠΎΡΠΎΡΠ½ΡΠ΅ ΠΊΡΠ²Π΅ΡΡ
ΠΠ΅ΠΌΠ΅Π΄Π»Π΅Π½Π½ΠΎ ΠΏΡΠΎΠ²Π΅ΡΡΡΠ΅ ΠΏΡΠΎΡΠΎΡΠ½ΡΠ΅ ΠΊΡΠ²Π΅ΡΡ. ΠΡΠ·ΡΡΠΈ ΠΏΠ»ΠΎΡ ΠΈΠ΅:https://www.flickr.com/photos/lpcohen/27996712883/in/dateposted-friend/
ΠΡ Π·Π°ΠΊΠ°Π·Π°Π»ΠΈ 7 ΠΏΡΠΎΡΠΎΡΠ½ΡΡ ΡΡΠ΅Π΅ΠΊ (5 + 2, ΠΊΠΎΡΠΎΡΡΠ΅ ΠΏΠΎΡΡΠ°Π²Π»ΡΠ»ΠΈΡΡ ΡΠΎ ΡΡΠ°ΡΡΠΎΠ²ΡΠΌ ΠΏΠ°ΠΊΠ΅ΡΠΎΠΌ). ΠΈΠΌΠ΅ΡΡ Π½Π΅ΠΏΠΎΡΡΠΎΡΠ½Π½ΡΠ΅ ΡΠΈΡΠ»Π° ΠΏΠΎΡ, Π° Π½Π΅ΠΊΠΎΡΠΎΡΡΠ΅ ΠΏΡΠΈΠ±ΡΠ»ΠΈ Ρ ΠΏΡΠ·ΡΡΡΠΊΠ°ΠΌΠΈ. ΠΠ΄Π½Π° ΠΏΡΠΎΡΠΎΡΠ½Π°Ρ ΠΊΡΠ²Π΅ΡΠ° Π½Π΅ ΠΈΠΌΠ΅Π»Π° ΠΏΠΎΡ. ΠΠ°ΠΌ ΠΏΡΠΈΡΠ»Π°Π»ΠΈ Π·Π°ΠΌΠ΅Π½Ρ ΡΡΠΎΠΉ ΠΏΡΠΎΡΠΎΡΠ½ΠΎΠΉ ΠΊΡΠ²Π΅ΡΠ΅ Π² ΡΠ΅ΡΠ΅Π½ΠΈΠ΅ Π½Π΅ΡΠΊΠΎΠ»ΡΠΊΠΈΡ Π΄Π½Π΅ΠΉ, ΡΡΠΎ Π±ΡΠ»ΠΎ ΠΎΡΠ΅Π½Ρ ΠΏΠΎΠ»Π΅Π·Π½ΠΎ. ΠΠ΄Π½Π°ΠΊΠΎ Π΄Π»Ρ ΠΏΡΠΎΡΠΎΡΠ½ΡΡ ΡΡΠ΅Π΅ΠΊ, Π² ΠΊΠΎΡΠΎΡΡΡ Π±ΡΠ»ΠΈ ΠΏΡΠ·ΡΡΡΠΊΠΈ, ΡΠ΅Ρ Π½ΠΈΡΠ΅ΡΠΊΠΈΠΉ ΠΏΠ΅ΡΡΠΎΠ½Π°Π» ONP Π΄Π°Π» ΠΌΠ½Π΅ ΠΈΠ½ΡΡΡΡΠΊΡΠΈΠΈ Π½Π°Π±ΡΠ°ΡΡ Π½Π΅Π±ΠΎΠ»ΡΡΠΎΠ΅ ΠΊΠΎΠ»ΠΈΡΠ΅ΡΡΠ²ΠΎ ΠΆΠΈΠ΄ΠΊΠΎΡΡΠΈ ΠΎΠ±ΡΠ΅ΠΌΠΎΠΌ 15 ΠΌΠΊΠ», ΡΡΠΎΠ±Ρ ΠΏΠΎΠΏΡΡΠ°ΡΡΡΡ ΡΠ΄Π°Π»ΠΈΡΡ ΠΏΡΠ·ΡΡΡ, Π° Π·Π°ΡΠ΅ΠΌ ΡΠ½ΠΎΠ²Π° ΠΊΠΎΠ½ΡΡΠΎΠ»Ρ ΠΊΠ°ΡΠ΅ΡΡΠ²Π°. ΠΡΠΎ Π½Π΅ ΡΡΠ°Π±ΠΎΡΠ°Π»ΠΎ. ΠΡΠΎΠΈΠ·Π²ΠΎΠ΄ΠΈΡΠ΅Π»ΡΠ½ΠΎΡΡΡ ΡΡΠΈΡ ΠΏΡΠΎΡΠΎΡΠ½ΡΡ ΡΡΠ΅Π΅ΠΊ Π½Π΅ ΠΎΠΏΡΠ°Π²Π΄Π°Π»Π° Π½Π°ΡΠΈΡ ΠΎΠΆΠΈΠ΄Π°Π½ΠΈΠΉ.
ΠΡΠΈ ΠΎΠ±ΡΠ΅Π½ΠΈΠΈ Ρ ΠΊΠΎΠΌΠΏΠ°Π½ΠΈΠ΅ΠΉ Π½Π°ΠΌ ΡΠΊΠ°Π·Π°Π»ΠΈ, ΡΡΠΎ Π½Π° ΠΏΡΠΎΡΠΎΡΠ½ΡΠ΅ ΡΡΠ΅ΠΉΠΊΠΈ Π½Π΅ ΡΠ°ΡΠΏΡΠΎΡΡΡΠ°Π½ΡΠ΅ΡΡΡ Π³Π°ΡΠ°Π½ΡΠΈΡ.
ΠΠΊΡΡΡΠ°ΠΊΡΠΈΡ ΠΠΠ
Π ΠΏΡΠΎΡΠΎΠΊΠΎΠ»Π΅ ONP ΡΠΊΠ°Π·Π°Π½ΠΎ, ΡΡΠΎ Π΄Π»Ρ ΡΡΠΏΠ΅ΡΠ½ΠΎΠΉ ΠΏΠΎΠ΄Π³ΠΎΡΠΎΠ²ΠΊΠΈ Π±ΠΈΠ±Π»ΠΈΠΎΡΠ΅ΠΊΠΈ ΡΡΠ΅Π±ΡΠ΅ΡΡΡ Π½Π΅ ΠΌΠ΅Π½Π΅Π΅ 500β1000 Π½Π³ ΡΠΈΡΡΠΎΠΉ ΠΠΠ. ΠΠΎΠΏΡΠΎΠ±ΡΠΉΡΠ΅ ΡΡΡΠ΅ΠΌΠΈΡΡΡΡ ΠΊ Π±ΠΎΠ»ΡΡΠ΅ΠΌΡ, ΡΠ΅ΠΌ ΡΡΠΎ. ΠΠΎΡΡΠ°ΡΠ°ΠΉΡΠ΅ΡΡ ΠΏΠΎΠ»ΡΡΠΈΡΡ ΠΊΠ°ΠΊ ΠΌΠΎΠΆΠ½ΠΎ Π±ΠΎΠ»ΡΡΠ΅ ΠΠΠ Ρ ΠΌΠ°ΠΊΡΠΈΠΌΠ°Π»ΡΠ½ΠΎ Π²ΡΡΠΎΠΊΠΎΠΉ ΠΌΠΎΠ»Π΅ΠΊΡΠ»ΡΡΠ½ΠΎΠΉ ΠΌΠ°ΡΡΠΎΠΉ. ΠΡΠ΄ΡΡΠ΅ ΠΎΡΡΠΎΡΠΎΠΆΠ½Ρ ΡΠΎ ΡΠ²ΠΎΠ΅ΠΉ ΠΠΠ. ΠΠ΅ ΡΠΌΠ΅ΡΠΈΠ²Π°ΠΉΡΠ΅ ΠΆΠΈΠ΄ΠΊΠΎΡΡΠΈ ΠΏΠΈΠΏΠ΅ΡΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠ΅ΠΌ. Π‘ΠΊΠΎΡΡ ΠΠΎΡΡΠΎΠ½ ΡΠ΅ΠΊΠΎΠΌΠ΅Π½Π΄ΠΎΠ²Π°Π» Π΄Π»Ρ ΠΎΡΠΈΡΡΠΊΠΈ Π±Π°ΠΊΡΠ΅ΡΠΈΠ°Π»ΡΠ½ΡΡ ΠΈΠ·ΠΎΠ»ΡΡΠΎΠ² ΠΈΠ· ΠΆΠΈΠ΄ΠΊΠΎΠΉ ΠΊΡΠ»ΡΡΡΡΡ ΠΈΡΠΏΠΎΠ»ΡΠ·ΠΎΠ²Π°ΡΡ ΡΠΊΡΠΊΠ»ΡΠ·ΠΈΠΎΠ½Π½ΡΠ΅ ΠΊΠΎΠ»ΠΎΠ½ΠΊΠΈ Qiagen, ΠΈ Π½Π°ΠΌ ΡΡΠΎ ΠΎΡΠ΅Π½Ρ ΠΏΠΎΠΌΠΎΠ³Π»ΠΎ. ΠΡ Π½Π°ΡΠ°Π»ΠΈ Ρ ~ 2000 ΠΌΠΊΠ³ ΠΈ ΠΈΡΠΏΠΎΠ»ΡΠ·ΠΎΠ²Π°Π»ΠΈ ΡΡΠ°ΠΏ Π²ΠΎΡΡΡΠ°Π½ΠΎΠ²Π»Π΅Π½ΠΈΡ FFPE.
ΠΡΠΎΡΠΎΠΊΠΎΠ» ONP Π²ΠΊΠ»ΡΡΠ°Π΅Ρ ΠΎΠ±ΡΠ΅Π·ΠΊΡ Ρ ΠΏΠΎΠΌΠΎΡΡΡ Covaris gtube Π΄ΠΎ 8kb. ΠΠΎΠ³Π΄Π° Ρ ΠΈΡΠΊΠ»ΡΡΠΈΠ» ΡΡΠΎΡ ΡΠ°Π³, ΡΡΠΎΠ±Ρ ΡΠΎΡ
ΡΠ°Π½ΠΈΡΡ Π±ΠΎΠ»Π΅Π΅ Π΄Π»ΠΈΠ½Π½ΡΠ΅ Π½ΠΈΡΠΈ, Π²ΡΡ
ΠΎΠ΄ Π±ΡΠ» ΠΏΡΠ°ΠΊΡΠΈΡΠ΅ΡΠΊΠΈ Π½ΡΠ»Π΅Π²ΡΠΌ, Π° ΠΎΠ±ΡΠ°Π·ΡΡ Ρ Π°Π΄Π΅ΠΊΠ²Π°ΡΠ½ΡΠΌ Π²ΡΡ
ΠΎΠ΄ΠΎΠΌ ΠΈΠΌΠ΅Π»ΠΈ ΠΏΠ»ΠΎΡ
ΠΈΠ΅ ΡΠ΅Π·ΡΠ»ΡΡΠ°ΡΡ ΡΠ΅ΠΊΠ²Π΅Π½ΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΡ. ΠΡΠΈ ΠΎΠ±ΡΠ΅Π½ΠΈΠΈ Ρ ONP ΠΏΠΎ ΡΡΠΎΠΌΡ ΠΏΠΎΠ²ΠΎΠ΄Ρ ΠΌΡ Π·Π°ΠΏΠΎΠ΄ΠΎΠ·ΡΠΈΠ»ΠΈ, ΡΡΠΎ ΠΏΡΡΠ΄ΠΈ ΡΡΠ΅Π·Π°Π»ΠΈΡΡ ΡΠ°ΠΌΠΈ ΠΏΠΎ ΡΠ΅Π±Π΅ Π³Π΄Π΅-ΡΠΎ Π²ΠΎ Π²ΡΠ΅ΠΌΡ ΠΌΠ½ΠΎΠΆΠ΅ΡΡΠ²Π΅Π½Π½ΡΡ
ΡΠ΅Π°ΠΊΡΠΈΠΉ, Π·Π°ΡΠ΅ΠΌ ΠΈΡ
Π»ΠΈΠ±ΠΎ ΡΠΌΡΠ²Π°Π»ΠΎ Π½Π° ΡΡΠ°ΠΏΠ°Ρ
ΠΎΡΠΈΡΡΠΊΠΈ Π±ΡΡΠΈΠ½ΠΎΠΊ, Π»ΠΈΠ±ΠΎ ΡΡΠ΅Π·Π°Π»ΠΈ Π°Π΄Π°ΠΏΡΠ΅ΡΡ ΡΠ½ΡΡΠ° ΠΈ ΡΠΏΠΈΠ»ΡΠΊΠΈ, ΠΏΠΎΡΡΠΎΠΌΡ ΠΏΡΡΠ΄ΠΈ Π½Π΅ ΡΠ°ΡΠΏΠΎΠ·Π½Π°Π²Π°Π»ΠΈΡΡ. ΠΏΠΎ ΠΏΠΎΡΠ°ΠΌ.
ΠΡ ΡΠ΅ΠΊΠ²Π΅Π½ΠΈΡΠΎΠ²Π°Π»ΠΈ Π²ΡΠ΅ ΡΡΠΈ ΠΏΡΠΈΠ²Π΅Π΄Π΅Π½Π½ΡΡ Π½ΠΈΠΆΠ΅ Π½Π°Π±ΠΎΡΠ° ΠΠΠΒ (Π»Π΅ΡΡΠ½ΠΈΡΠ° 1β10Β ΠΊΠ±). Π ΠΏΡΠ΅ΠΏΠ°ΡΠ°ΡΠ΅ ΠΠ°ΠΊΡΠ²Π΅Π»Π»Π° (Π³Π΅Π»Ρ Π½ΠΈΠΆΠ΅ ΡΠ»Π΅Π²Π°) Π±ΡΠ»ΠΎ ΠΏΡΠΈΠ»ΠΈΡΠ½ΠΎΠ΅ ΠΊΠΎΠ»ΠΈΡΠ΅ΡΡΠ²ΠΎ Π±ΠΈΠ±Π»ΠΈΠΎΡΠ΅ΠΊΠΈ, Π½ΠΎ Π΄Π»ΠΈΠ½Π° ΡΡΠ΅Π½ΠΈΡ ΡΠ΅ΠΊΠ²Π΅Π½ΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΡ Π±ΡΠ»Π° Π½Π΅ ΡΠ°ΠΊΠΎΠΉ Π±ΠΎΠ»ΡΡΠΎΠΉ, ΠΊΠ°ΠΊ Ρ ΠΎΡΠ΅Π»ΠΎΡΡ Π±Ρ, ΡΡΠΎ ΠΈΠΌΠ΅Π΅Ρ ΡΠΌΡΡΠ», ΡΡΠΈΡΡΠ²Π°Ρ Π²ΠΈΠ΄ΠΈΠΌΡΠ΅ Π½Π΅Π±ΠΎΠ»ΡΡΠΈΠ΅ ΡΠ°Π·ΠΌΡΡΡΠ΅ ΠΏΠΎΠ»ΠΎΡΡ. (ΡΡΠ°ΡΠΈΡΡΠΈΡΠ΅ΡΠΊΠΈΠΉ ΠΎΡΡΠ΅Ρ)
ΠΠΎΠ΄Π³ΠΎΡΠΎΠ²ΠΊΠ° Π±ΠΈΠ±Π»ΠΈΠΎΡΠ΅ΠΊΠΈ
ΠΠΎΠ³Π΄Π° ΠΌΡ Π²ΠΏΠ΅ΡΠ²ΡΠ΅ Π½Π°ΡΠ°Π»ΠΈ ΡΡΡΡΠ°Π½Π΅Π½ΠΈΠ΅ Π½Π΅ΠΏΠΎΠ»Π°Π΄ΠΎΠΊ MinION, Π² Π»Π°Π±ΠΎΡΠ°ΡΠΎΡΠΈΠΈ Π±ΡΠ»ΠΎ ΡΡΡΠ΄Π½ΠΎ ΡΠ»Π΅Π΄ΠΎΠ²Π°ΡΡ ΠΏΡΠΎΡΠΎΠΊΠΎΠ»Π°ΠΌ, Π΄ΠΎΡΡΡΠΏΠ½ΡΠΌ ΡΠ΅ΡΠ΅Π· MAP. ΠΠ°ΠΌ Π½ΡΠΆΠ΅Π½ Π±ΡΠ» Π»ΠΈΡΡ, ΡΡΠΎΠ±Ρ ΠΏΡΠΎΡΡΠΎ ΡΠ°ΡΠΏΠ΅ΡΠ°ΡΠ°ΡΡ ΠΈ ΡΠ»Π΅Π΄ΠΎΠ²Π°ΡΡ ΡΠΎ ΡΠΊΠ°ΠΌΠ΅ΠΉΠΊΠΈ, ΠΏΠΎΡΡΠΎΠΌΡ ΠΌΡ ΡΠΎΠ·Π΄Π°Π»ΠΈ ΡΡΠΎ:
https://docs.google.com/document/d/1evxayjfru96_cawbepccccc7rfrv_zm1ludscza8lwcu/edit?usp=sharing
ΠΠ΅ΡΠΊΠΎΠ»ΡΠΊΠΎ ΠΌΠ΅ΡΡΡΠ΅Π² Π½Π°Π·Π°Π΄, onp Π²ΡΡΠ΅Π» Ρ ΠΊΠΎΠ½ΡΡΠΎΠ»Π΅ΠΌ PDF Π΄Π»Ρ Π±ΠΈΠ±Π»ΠΈΠΎΡΠ΅ΠΊΠΈ, ΠΊΠΎΡΠΎΡΡΠΉ ΠΎΡΠ»ΠΈΡΠ½ΡΠΉ:
ONP_MinION_lib_prep_protocol_SQK-NSK007.pdfΠΠΎΠ΄Π³ΠΎΡΠΎΠ²ΠΊΠ° Π±ΠΈΠ±Π»ΠΈΠΎΡΠ΅ΠΊΠΈ Π΄ΠΎΠ²ΠΎΠ»ΡΠ½ΠΎ ΠΏΡΠΎΡΡΠ°. ΠΠ΄Π½Π° Π²Π°ΠΆΠ½Π°Ρ Π²Π΅ΡΡ, ΠΊΠΎΡΠΎΡΡΡ Ρ ΡΠ·Π½Π°Π» ΠΎ NEB Blunt/TA Master Mix:
Π’ΠΎΡ Π³ΡΡΡΡΠ½ΡΠΉ ΠΌΠΎΠΌΠ΅Π½Ρ, ΠΊΠΎΠ³Π΄Π° Π²Ρ ΠΏΠΎΠ½ΠΈΠΌΠ°Π΅ΡΠ΅, ΡΡΠΎ ΡΡΠΎ-ΡΠΎ ΡΠ²Π»ΡΠ΅ΡΡΡ Π½Π΅Π·Π°ΠΏΠ»Π°Π½ΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½Π½ΡΠΌ, Π½Π΅ΠΈΠ·Π²Π΅ΡΡΠ½ΡΠΌ ΠΎΠ³ΡΠ°Π½ΠΈΡΠΈΠ²Π°ΡΡΠΈΠΌ ΡΠ΅Π°Π³Π΅Π½ΡΠΎΠΌ @nanopore @NEBiolabs pic.
twitter.com/VbcgKMYMuC
β ΠΠΈΠ·Π° ΠΠΎΡΠ½ (@monsterbashseq) 2 Π°Π²Π³ΡΡΡΠ° 2016 Π³.
ΠΠΎΠ΄Π³ΠΎΡΠΎΠ²ΠΊΠ° Π±ΠΈΠ±Π»ΠΈΠΎΡΠ΅ΠΊΠΈ ΠΈ Π·Π°Π³ΡΡΠ·ΠΊΠ° ΠΎΠ±ΡΠ°Π·ΡΠΎΠ² Π² ΠΏΡΠΎΡΠΎΡΠ½ΡΡ ΠΊΡΠ²Π΅ΡΡ ΠΌΠΎΠ³ΡΡ Π±ΡΡΡ ΡΠ»ΠΎΠΆΠ½ΡΠΌΠΈ ΠΈ Π½Π΅ΡΠ²Π½ΡΠΌΠΈ Π΄Π»Ρ ΡΠ΅Ρ , ΠΊΡΠΎ Π½Π΅ ΡΠΌΠ΅Π΅Ρ ΡΠ°Π±ΠΎΡΠ°ΡΡ Π² Π»Π°Π±ΠΎΡΠ°ΡΠΎΡΠΈΠΈ. Π£ ΠΌΠ΅Π½Ρ Π±ΠΎΠ»Π΅Π΅ 4 Π»Π΅Ρ ΠΎΠΏΡΡΠ° ΡΠ°Π±ΠΎΡΡ Π² ΠΌΠΎΠ»Π΅ΠΊΡΠ»ΡΡΠ½ΠΎΠΉ Π»Π°Π±ΠΎΡΠ°ΡΠΎΡΠΈΠΈ, Ρ Π·Π½Π°Ρ, ΠΊΠ°ΠΊ ΠΎΠ±ΡΠ°ΡΠ°ΡΡΡΡ Ρ ΡΠ΅Π°Π³Π΅Π½ΡΠ°ΠΌΠΈ, Π±ΡΡΡΡΠΎ Π²ΡΠ°ΡΠ°ΡΡ, ΠΏΠΈΠΏΠ΅ΡΠΈΡΠΎΠ²Π°ΡΡ Π½Π΅Π±ΠΎΠ»ΡΡΠΈΠ΅ ΠΎΠ±ΡΠ΅ΠΌΡ, ΠΊΠ°ΠΊ Π±ΡΡΡ ΠΎΡΡΠΎΡΠΎΠΆΠ½ΡΠΌ, ΡΡΠΎΠ±Ρ Π½Π΅ ΡΡΠ°ΡΠΈΡΡ ΡΠ΅Π°Π³Π΅Π½ΡΡ Π²ΠΏΡΡΡΡΡ. Π’Π΅ΠΌ, ΠΊΡΠΎ Π½Π΅ ΡΠ°ΡΡΠΎ Π·Π°Π½ΠΈΠΌΠ°Π΅ΡΡΡ ΠΌΠΎΠ»Π΅ΠΊΡΠ»ΡΡΠ½ΡΠΌΠΈ Π»Π°Π±ΠΎΡΠ°ΡΠΎΡΠ½ΡΠΌΠΈ ΠΈΡΡΠ»Π΅Π΄ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΡΠΌΠΈ, ΡΠ»Π΅Π΄ΡΠ΅Ρ ΠΎΠ±ΡΠ°ΡΠΈΡΡ Π²Π½ΠΈΠΌΠ°Π½ΠΈΠ΅ Π½Π° Π²ΡΠ·ΠΊΠΈΠ΅, Π»ΠΈΠΏΠΊΠΈΠ΅ ΡΠΌΠ΅ΡΠΈ ΡΠ΅ΡΠΌΠ΅Π½ΡΠΎΠ², ΠΊΠΎΡΠΎΡΡΠ΅ Π²Ρ ΠΎΠ΄ΡΡ Π² ΡΠΎΡΡΠ°Π² Π³Π»ΠΈΡΠ΅ΡΠΈΠ½Π°. ΠΡ Π΄ΡΠΌΠ°Π΅ΡΠ΅, ΡΡΠΎ Π²ΡΡΠ°ΡΡΠ²Π°Π΅ΡΠ΅ ΠΎΠΏΡΠ΅Π΄Π΅Π»Π΅Π½Π½ΡΠΉ ΠΎΠ±ΡΠ΅ΠΌ, Π½ΠΎ , ΡΠ°Π²Π½ΠΎΠ΅ ΠΊΠΎΠ»ΠΈΡΠ΅ΡΡΠ²Ρ , ΡΠ°ΡΡΠΎ ΠΏΡΠΈΠ»ΠΈΠΏΠ°Π΅Ρ ΠΊ Π²Π½Π΅ΡΠ½Π΅ΠΉ ΡΡΠΎΡΠΎΠ½Π΅ Π½Π°ΠΊΠΎΠ½Π΅ΡΠ½ΠΈΠΊΠ° ΠΏΠΈΠΏΠ΅ΡΠΊΠΈ. ΠΡ Π΄ΠΎΠ»ΠΆΠ½Ρ Π²ΡΡΠ΅ΡΠ΅ΡΡ Π΅Π³ΠΎ ΡΠ±ΠΎΠΊΡ ΠΏΡΠΎΠ±ΠΈΡΠΊΠΈ, ΡΡΠΎΠ±Ρ ΡΠ½ΡΡΡ Π΅Π³ΠΎ, ΡΡΠΎΠ±Ρ Π½Π΅ Π΄ΠΎΠ±Π°Π²Π»ΡΡΡ Π΅Π³ΠΎ Π² ΡΠ²ΠΎΠΉ ΠΎΠ±ΡΠ΅ΠΌ rxn, ΠΈΠ·ΠΌΠ΅Π½ΡΡ ΠΎΠΏΡΠΈΠΌΠ°Π»ΡΠ½ΡΡ ΠΊΠΎΠ½ΡΠ΅Π½ΡΡΠ°ΡΠΈΡ ΠΈ (Π²Π΅ΡΠΎΡΡΠ½ΠΎ, ΡΠ°ΠΌΠΎΠ΅ Π²Π°ΠΆΠ½ΠΎΠ΅) ΡΠ°ΠΊΠΆΠ΅ ΡΡΠ°ΡΡ ΡΠ΅Π°Π³Π΅Π½Ρ.
ΠΡΠΎΡΠ΅Π΅ ΠΏΡΠΎΡΠ΅Π΅ ΡΠΎΠ²Π΅Ρ:
- Π Π°ΡΡΠ΅Ρ: M1V1 = M2V2 Π²Π°Ρ Π΄ΡΡΠ³.
- ΠΠ΅ ΡΠΌΠ΅ΡΠΈΠ²Π°ΠΉΡΠ΅ ΠΏΠΈΠΏΠ΅ΡΠΊΠΎΠΉ.
- ΠΠΌΠ΅ΡΡΠΎ ΡΡΠΎΠ³ΠΎ ΠΎΡΡΠΎΡΠΎΠΆΠ½ΠΎ ΠΏΠΎΡΡΡΠΊΠΈΠ²Π°ΠΉΡΠ΅ ΠΏΠΎ ΡΡΡΠ±ΠΊΠ΅ ΠΈΠ»ΠΈ Π΄Π΅ΡΠ³Π°ΠΉΡΠ΅ Π΅Π΅.
- Π§Π°ΡΡΠΎ ΠΏΡΠΎΠΊΡΡΡΠΈΠ²Π°ΠΉΡΠ΅ ΠΏΡΠΎΠ±ΠΈΡΠΊΠΈ, ΡΡΠΎΠ±Ρ ΡΠ±Π΅Π΄ΠΈΡΡΡΡ, ΡΡΠΎ ΠΆΠΈΠ΄ΠΊΠΎΡΡΡ ΡΠΎΠ±ΠΈΡΠ°Π΅ΡΡΡ Π½Π° Π΄Π½Π΅.
- ΠΡΠΈΡΡΠΊΠ° ΡΠ°ΡΠΈΠΊΠΎΠ² ΡΡΠ΅Π±ΡΠ΅Ρ ΡΠ΅ΡΠΏΠ΅Π½ΠΈΡ ΠΈ ΠΎΡΡΠΎΡΠΎΠΆΠ½ΠΎΡΡΠΈ ΠΏΡΠΈ ΠΏΠΈΠΏΠ΅ΡΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠΈ.
- ΠΡΠ΄ΡΡΠ΅ Π°ΠΊΠΊΡΡΠ°ΡΠ½Ρ ΡΠΎ ΡΠ²ΠΎΠΈΠΌΠΈ ΠΏΡΠΎΠ±ΠΈΡΠΊΠ°ΠΌΠΈ (ΠΏΠΎΡΠΊΠΎΠ»ΡΠΊΡ Π΅ΡΡΡ Π½Π΅ΡΠΊΠΎΠ»ΡΠΊΠΎ ΠΏΡΠΎΠ±ΠΈΡΠΎΠΊ Ρ ΡΠ΅Π°Π³Π΅Π½ΡΠ°ΠΌΠΈ, ΠΊΠΎΡΠΎΡΡΠ΅ Π²ΡΠ³Π»ΡΠ΄ΡΡ ΠΎΠ΄ΠΈΠ½Π°ΠΊΠΎΠ²ΠΎ). ΠΡΠΏΠΎΠ»ΡΠ·ΡΠΉΡΠ΅ ΠΊΠΎΠ½ΡΡΠΎΠ»ΡΠ½ΡΠΉ ΡΠΏΠΈΡΠΎΠΊ ΠΈ Π²ΡΡΠ΅ΡΠΊΠΈΠ²Π°ΠΉΡΠ΅ ΠΊΠ°ΠΆΠ΄ΡΠΉ ΡΠ°Π·, ΠΊΠΎΠ³Π΄Π° Π²Ρ Π΄ΠΎΠ±Π°Π²Π»ΡΠ΅ΡΠ΅ ΡΠ΅Π°Π³Π΅Π½Ρ.
ΠΡΠΎ ΡΠΎ, ΡΡΠΎ Ρ ΡΡΠΈΡΠ°Ρ ΡΠ°ΠΌΠΎ ΡΠΎΠ±ΠΎΠΉ ΡΠ°Π·ΡΠΌΠ΅ΡΡΠΈΠΌΡΡ, ΠΊΠΎΠ³Π΄Π° ΡΠ΅Π³ΡΠ»ΡΡΠ½ΠΎ Π²ΡΠΏΠΎΠ»Π½ΡΡ Π»Π°Π±ΠΎΡΠ°ΡΠΎΡΠ½ΡΡ ΡΠ°Π±ΠΎΡΡ. Π’ΡΠ΅Π±ΡΠ΅ΡΡΡ Π½Π΅ΠΊΠΎΡΠΎΡΠΎΠ΅ Π²ΡΠ΅ΠΌΡ, ΡΡΠΎΠ±Ρ Π²ΡΠΏΠΎΠΌΠ½ΠΈΡΡ, ΠΊΠΎΠ³Π΄Π° Ρ ΡΠ½ΠΎΠ²Π° Π½Π°Ρ ΠΎΠΆΡΡΡ Π² Π»Π°Π±ΠΎΡΠ°ΡΠΎΡΠΈΠΈ ΠΏΠΎΡΠ»Π΅ ΠΏΠ΅ΡΠ΅ΡΡΠ²Π° Π΄Π»Ρ ΡΠ°Π±ΠΎΡΡ Π½Π°Π΄ ΠΏΡΠΎΠ΅ΠΊΡΠ°ΠΌΠΈ, ΠΎΡΠΈΠ΅Π½ΡΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½Π½ΡΠΌΠΈ Π½Π° Π²ΡΡΠΈΡΠ»Π΅Π½ΠΈΡ.
https://www.flickr.com/photos/lpcohen/28040963554/in/dateposted-friend/
ΠΠΏΠΏΠ°ΡΠ°ΡΠ½ΠΎΠ΅ ΠΎΠ±Π΅ΡΠΏΠ΅ΡΠ΅Π½ΠΈΠ΅ ΠΊΠΎΠΌΠΏΡΡΡΠ΅ΡΠ°
Π ΠΎΠΊΡΡΠ±ΡΠ΅ 2015 Π³ΠΎΠ΄Π° ΠΏΡΠΎΡΠ»ΠΎΠ³ΠΎ Π³ΠΎΠ΄Π°, ΠΊΠΎΠ³Π΄Π° ΠΌΡ Π·Π°ΠΊΠ°Π·ΡΠ²Π°Π»ΠΈ Π²ΡΠ΅ Π½Π΅ΠΎΠ±Ρ
ΠΎΠ΄ΠΈΠΌΠΎΠ΅ Π΄Π»Ρ ΡΡΡΠ°Π½ΠΎΠ²ΠΊΠΈ, ΡΡΠ΅Π±ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΡ ΠΊ ΠΊΠΎΠΌΠΏΡΡΡΠ΅ΡΠ½ΠΎΠΌΡ ΠΎΠ±ΠΎΡΡΠ΄ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΡ Π΄Π»Ρ MinION Π±ΡΠ»ΠΈ ΡΠ»Π΅Π΄ΡΡΡΠΈΠΌΠΈ: 8 ΠΠ ΠΎΠΏΠ΅ΡΠ°ΡΠΈΠ²Π½ΠΎΠΉ ΠΏΠ°ΠΌΡΡΠΈ ΠΈ 128-Π΄ΡΠΉΠΌΠΎΠ²ΡΠΉ ΠΆΠ΅ΡΡΠΊΠΈΠΉ Π΄ΠΈΡΠΊ SSD Ρ ΠΏΡΠΎΡΠ΅ΡΡΠΎΡΠΎΠΌ i7. ΠΠΎΡ ΡΡΠΎ ΠΌΡ Π² ΠΈΡΠΎΠ³Π΅ Π·Π°ΠΊΠ°Π·Π°Π»ΠΈ (ΡΡΠΎ Π·Π°Π½ΡΠ»ΠΎ Π½Π΅ΡΠΊΠΎΠ»ΡΠΊΠΎ Π½Π΅Π΄Π΅Π»Ρ ΠΏΠΎ ΡΠΏΠ΅ΡΠΈΠ°Π»ΡΠ½ΠΎΠΌΡ Π·Π°ΠΊΠ°Π·Ρ ΠΈΠ· ΠΊΠΎΠΌΠΏΡΡΡΠ΅ΡΠ½ΠΎΠ³ΠΎ ΡΠ΅Ρ
Π½ΠΈΡΠ΅ΡΠΊΠΎΠ³ΠΎ ΡΠ΅Π½ΡΡΠ° ΠΠ°Π»ΠΈΡΠΎΡΠ½ΠΈΠΉΡΠΊΠΎΠ³ΠΎ ΡΠ½ΠΈΠ²Π΅ΡΡΠΈΡΠ΅ΡΠ° Π² ΠΡΠ²ΠΈΡΠ΅):
DH ΠΠ΅ΡΠ°Π»Ρ β: F1M35UT ΠΡΠΎΠΈΠ·Π²ΠΎΠ΄ΠΈΡΠ΅Π»Ρ: HP β ΠΏΡΠΎΠΈΠ·Π²ΠΎΠ΄ΠΈΡΠ΅Π»Ρ: F1M35UT#ABA ΠΠΎΠ±ΠΈΠ»ΡΠ½Π°Ρ ΡΠ°Π±ΠΎΡΠ°Ρ ΡΡΠ°Π½ΡΠΈΡ HP ZBook 15 G2 15,6β³ ΡΠΎ ΡΠ²Π΅ΡΠΎΠ΄ΠΈΠΎΠ΄Π½ΠΎΠΉ ΠΏΠΎΠ΄ΡΠ²Π΅ΡΠΊΠΎΠΉ Intel Core i7 i74810MQ Quadcore (4 ΡΠ΄ΡΠ°) 2,80 ΠΠΡ 8 ΠΠ DDR3L SDRAM RAM 256 ΠΠ SSD DVDWriter NVIDIA Quadro K1100M 2 ΠΠ Windows 7 Professional, 64-ΡΠ°Π·ΡΡΠ΄Π½Π°Ρ (Π°Π½Π³Π»ΠΈΠΉΡΠΊΠ°Ρ), Ρ Π²ΠΎΠ·ΠΌΠΎΠΆΠ½ΠΎΡΡΡΡ ΠΎΠ±Π½ΠΎΠ²Π»Π΅Π½ΠΈΡ Π΄ΠΎ Windows 8.1 Pro 19ΠΠΈΡΠΏΠ»Π΅ΠΉ 20 x 1080 16:9 Bluetooth ΠΠ½Π³Π»ΠΈΠΉΡΠΊΠ°Ρ ΠΊΠ»Π°Π²ΠΈΠ°ΡΡΡΠ° ΠΠ΅ΡΠΏΡΠΎΠ²ΠΎΠ΄Π½Π°Ρ Π»ΠΎΠΊΠ°Π»ΡΠ½Π°Ρ ΡΠ΅ΡΡ ΠΠ΅Π±-ΠΊΠ°ΠΌΠ΅ΡΠ° ΠΡΠ΅Π³ΠΎ 4 ΠΏΠΎΡΡΠ° USB 3 ΠΏΠΎΡΡΠ° USB 3.0 Π‘Π΅ΡΠ΅Π²ΠΎΠΉ (RJ45) ΠΠΎΠΌΠ±ΠΈΠ½ΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½Π½ΡΠΉ ΠΏΠΎΡΡ Π΄Π»Ρ Π½Π°ΡΡΠ½ΠΈΠΊΠΎΠ²/ΠΌΠΈΠΊΡΠΎΡΠΎΠ½Π°
ΠΠ»Ρ ΠΎΠ΄Π½ΠΎΠ³ΠΎ Π·Π°ΠΏΡΡΠΊΠ° ΡΡΠ΅Π±ΡΠ΅ΡΡΡ ΠΎΠΊΠΎΠ»ΠΎ 30-50 ΠΠ, Π² Π·Π°Π²ΠΈΡΠΈΠΌΠΎΡΡΠΈ ΠΎΡ ΠΊΠ°ΡΠ΅ΡΡΠ²Π° Π±Π΅Π³Π°ΡΡ. Π€Π°ΠΉΠ»Ρ .fast5 ΠΈΠΌΠ΅ΡΡ Π±ΠΎΠ»ΡΡΠΎΠΉ ΡΠ°Π·ΠΌΠ΅Ρ, Π½Π΅ΡΠΌΠΎΡΡΡ Π½Π° ΡΠΎ, ΡΡΠΎ ΡΠ΅Π·ΡΠ»ΡΡΠΈΡΡΡΡΠΈΠ΅ ΡΠ°ΠΉΠ»Ρ .fastq ΠΈΠΌΠ΅ΡΡ Π½Π΅Π±ΠΎΠ»ΡΡΠΎΠΉ ΡΠ°Π·ΠΌΠ΅Ρ (<1 ΠΠ). ΠΠ±ΡΠ΅ΠΌ ΠΆΠ΅ΡΡΠΊΠΎΠ³ΠΎ Π΄ΠΈΡΠΊΠ° Π½Π° Π½Π°ΡΠ΅ΠΌ Π½ΠΎΡΡΠ±ΡΠΊΠ΅ MinION ΡΠΎΡΡΠ°Π²Π»ΡΠ΅Ρ 256 ΠΠ, ΠΈ Π΅Π³ΠΎ ΠΌΠΎΠΆΠ½ΠΎ Π±ΡΡΡΡΠΎ Π·Π°ΠΏΠΎΠ»Π½ΠΈΡΡ. ΠΡ ΠΊΡΠΏΠΈΠ»ΠΈ Π²Π½Π΅ΡΠ½ΠΈΠΉ ΠΆΠ΅ΡΡΠΊΠΈΠΉ Π΄ΠΈΡΠΊ Π΅ΠΌΠΊΠΎΡΡΡΡ 2 Π’Π, Π½Π° ΠΊΠΎΡΠΎΡΡΠΉ ΠΌΡ ΠΌΠΎΠΆΠ΅ΠΌ Π½Π°ΡΡΡΠΎΠΈΡΡ Metrichor Π΄Π»Ρ Π·Π°Π³ΡΡΠ·ΠΊΠΈ ΡΡΠ΅Π½ΠΈΡ ΠΏΠΎΡΠ»Π΅ Π±Π°Π·ΠΎΠ²ΠΎΠ³ΠΎ Π²ΡΠ·ΠΎΠ²Π°, ΡΡΠΊΠΎΠ½ΠΎΠΌΠΈΠ² ΠΌΠ΅ΡΡΠΎ Π½Π° ΠΆΠ΅ΡΡΠΊΠΎΠΌ Π΄ΠΈΡΠΊΠ΅ Π½ΠΎΡΡΠ±ΡΠΊΠ°.
ΠΡΠΎΠ³ΡΠ°ΠΌΠΌΠ½ΠΎΠ΅ ΠΎΠ±Π΅ΡΠΏΠ΅ΡΠ΅Π½ΠΈΠ΅ ΠΈ Π΄Π°Π½Π½ΡΠ΅
- Windows ΠΎΡΡΡΠΎΠΉ
- Π ΠΏΠΎΡΠ»Π΅Π΄Π½ΠΈΠ΅ ΠΌΠ΅ΡΡΡΡ ΠΏΠΎΡΠ²ΠΈΠ»ΡΡ Π½ΠΎΠ²ΡΠΉ GUI (Π³ΡΠ°ΡΠΈΡΠ΅ΡΠΊΠΈΠΉ ΠΏΠΎΠ»ΡΠ·ΠΎΠ²Π°ΡΠ΅Π»ΡΡΠΊΠΈΠΉ ΠΈΠ½ΡΠ΅ΡΡΠ΅ΠΉΡ) Π΄Π»Ρ MinKnow. ΠΡΠΈΠ²ΡΠΊΠ°ΡΡ ΠΊ ΡΡΠΎΠΌΡ Π½Π΅ΠΏΡΠΈΡΡΠ½ΠΎ, Π½ΠΎ Π² ΡΠ΅Π»ΠΎΠΌ Π½Π΅ΠΏΠ»ΠΎΡ ΠΎ.
- ΠΡΠΎΠ³ΡΠ°ΠΌΠΌΠ½ΠΎΠ΅ ΠΎΠ±Π΅ΡΠΏΠ΅ΡΠ΅Π½ΠΈΠ΅ Poretools Π΄Π»Ρ ΠΏΡΠ΅ΠΎΠ±ΡΠ°Π·ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΡ .fast5 Π² .fastq ΡΠΎΠ΄Π΅ΡΠΆΠΈΡ ΠΎΡΠΈΠ±ΠΊΠΈ Π² Windows ΠΈ ΠΏΠ»ΠΎΡ ΠΎ ΡΠ°Π±ΠΎΡΠ°Π΅Ρ Ρ MinKnow. ΠΠ΅ΡΠΎΡΡΠ½ΠΎ, Π΅ΡΡΡ ΡΠΏΠΎΡΠΎΠ± Π·Π°ΡΡΠ°Π²ΠΈΡΡ ΠΈΡ ΠΎΠ±ΠΎΠΈΡ ΡΠ°Π±ΠΎΡΠ°ΡΡ, Π½ΠΎ Ρ ΡΠΆΠ΅ ΠΏΠΎΡΡΠ°ΡΠΈΠ» ~ 2β4 ΡΠ°ΡΠ° Π½Π° ΡΡΡΡΠ°Π½Π΅Π½ΠΈΠ΅ ΡΡΠΎΠΉ ΠΏΡΠΎΠ±Π»Π΅ΠΌΡ, ΠΏΠΎΡΡΠΎΠΌΡ Π½Π° ΡΡΠΎΠΌ ΠΏΠΎΠΊΠ° ΠΏΠΎΠΊΠΎΠ½ΡΠΈΠ». ΠΠΌΠ΅ΡΡΠΎ ΡΡΠΎΠ³ΠΎ ΠΌΡ Π·Π°Π³ΡΡΠΆΠ°Π»ΠΈ .fast5 Π½Π° ΡΠ΅ΡΠ²Π΅Ρ Linux, Π° Π·Π°ΡΠ΅ΠΌ Π·Π°ΠΏΡΡΠΊΠ°Π»ΠΈ ΡΠ°ΠΌ ΠΈΠ½ΡΡΡΡΠΌΠ΅Π½ΡΡ ΠΏΠΎΡ.
- Python-ΡΠΊΡΠΈΠΏΡΡ MinKnow ΠΈΠ½ΠΎΠ³Π΄Π° Π°Π²Π°ΡΠΈΠΉΠ½ΠΎ Π·Π°Π²Π΅ΡΡΠ°ΡΡ ΡΠ°Π±ΠΎΡΡ Π²ΠΎ Π²ΡΠ΅ΠΌΡ Π²ΡΠΏΠΎΠ»Π½Π΅Π½ΠΈΡ! ΠΡ ΠΌΠΎΠΆΠ΅ΡΠ΅ ΡΠ½ΠΎΠ²Π° ΠΎΡΠΊΡΡΡΡ ΠΏΡΠΎΠ³ΡΠ°ΠΌΠΌΠ½ΠΎΠ΅ ΠΎΠ±Π΅ΡΠΏΠ΅ΡΠ΅Π½ΠΈΠ΅ MinKnow, ΡΠ½ΠΎΠ²Π° Π·Π°ΠΏΡΡΡΠΈΡΡ ΡΡΠ΅Π½Π°ΡΠΈΠΉ, ΠΈ ΠΎΠ½ Π΄ΠΎΠ»ΠΆΠ΅Π½ Π½Π°ΡΠ°ΡΡ ΡΠ°Π±ΠΎΡΡ Ρ ΡΠΎΠ³ΠΎ ΠΌΠ΅ΡΡΠ°, Π³Π΄Π΅ ΠΎΡΡΠ°Π½ΠΎΠ²ΠΈΠ»ΡΡ.
- ΠΡΠΏΠΎΠ»ΡΠ·ΡΠΉΡΠ΅ 48-ΡΠ°ΡΠΎΠ²ΠΎΠΉ ΡΡΠ΅Π½Π°ΡΠΈΠΉ MinKnow Π΄Π»Ρ ΡΠ΅ΠΊΠ²Π΅Π½ΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΡ.
- ΠΠ°Ρ ΠΏΠΎΡΠΎΠΊ Π΄Π°Π½Π½ΡΡ ΠΈΠ΄Π΅Ρ ΠΎΡ Π½Π΅ΠΎΠ±ΡΠ°Π±ΠΎΡΠ°Π½Π½ΠΎΠ³ΠΎ ΡΠΈΠ³Π½Π°Π»Π° ΠΎΡ MinION ( Π½ΠΎΡΡΠ±ΡΠΊ ) -> Π·Π°Π³ΡΡΠ·ΠΊΠ° Π½Π° ΡΠ΅ΡΠ²Π΅Ρ Metricor Π΄Π»Ρ Π±Π°Π·ΠΎΠ²ΠΎΠ³ΠΎ Π²ΡΠ·ΠΎΠ²Π° -> Π·Π°Π³ΡΡΠ·ΠΊΠ° Π½Π° Π²Π½Π΅ΡΠ½ΠΈΠΉ ΠΆΠ΅ΡΡΠΊΠΈΠΉ Π΄ΠΈΡΠΊ (Β«ΠΏΡΠΎΠΉΠ΄Π΅Π½ΠΎΒ» ΠΈΠ»ΠΈ Β«Π½Π΅ ΠΏΡΠΎΠΉΠ΄Π΅Π½ΠΎΒ» Π² Π·Π°Π²ΠΈΡΠΈΠΌΠΎΡΡΠΈ ΠΎΡ ΡΠ°Π±ΠΎΡΠ΅Π³ΠΎ ΠΏΡΠΎΡΠ΅ΡΡΠ° Metrichor Π²ΡΠ±ΡΠ°Π½Π½ΡΠΉ, Π½Π°ΠΏΡΠΈΠΌΠ΅Ρ, 1D ΠΈΠ»ΠΈ 2D ΠΈΠ»ΠΈ ΡΡΡΠΈΡ -ΠΊΠΎΠ΄) -> ΠΏΠΎΠ΄ΠΊΠ»ΡΡΠΈΡΡ Π²Π½Π΅ΡΠ½ΠΈΠΉ ΠΆΠ΅ΡΡΠΊΠΈΠΉ Π΄ΠΈΡΠΊ ΠΊ Π½ΠΎΡΡΠ±ΡΠΊΡ Ρ Linux ΠΈΠ»ΠΈ Linux (ΠΏΠΎ ΠΊΠ°ΠΊΠΎΠΉ-ΡΠΎ ΠΏΡΠΈΡΠΈΠ½Π΅ ΡΡΠΎ ΠΏΡΠΎΡΠ΅ Π½Π° Π½ΠΎΡΡΠ±ΡΠΊΠ΅ Ρ Linux, ΡΠ΅ΠΌ Ρ Windowsβ¦) Π΄Π»Ρ ΠΏΠ΅ΡΠ΅Π΄Π°ΡΠΈ Π½Π° Π‘Π΅ΡΠ²Π΅Ρ Linux -> Π½Π° ΡΠ΅ΡΠ²Π΅ΡΠ΅ Linux Π·Π°ΠΏΡΡΡΠΈΡΠ΅ ΠΠ Poretools Π΄Π»Ρ ΠΏΡΠ΅ΠΎΠ±ΡΠ°Π·ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΡ Π² fastq/fasta -> Π°Π½Π°Π»ΠΈΠ·
- ΠΡΠ΅ ΡΡΠΎ ΠΊΠ°ΠΆΠ΅ΡΡΡ ΠΊΠ°ΠΊΠΈΠΌ-ΡΠΎ Π½Π΅Π»Π΅ΠΏΡΠΌ. ΠΡΠ»ΠΈ Π΅ΡΡΡ Π»ΡΡΡΠΈΠΉ ΡΠΏΠΎΡΠΎΠ±, ΠΏΠΎΠΆΠ°Π»ΡΠΉΡΡΠ°, Π΄Π°ΠΉΡΠ΅ Π½Π°ΠΌ Π·Π½Π°ΡΡ!
Π‘Π΅ΠΌΠΈΠ½Π°ΡΡ
Π ΡΡΠ»ΠΎΠ²ΠΈΡΡ Π±ΡΠ΄ΡΡΠ΅Π³ΠΎ ΡΠ΅ΠΌΠΈΠ½Π°ΡΠ°, Π³Π΄Π΅ ΡΡΡΠ΄Π΅Π½ΡΡ Π±ΡΠ΄ΡΡ Π΄Π΅Π»Π°ΡΡ ΡΡΠΎ Π²ΠΏΠ΅ΡΠ²ΡΠ΅, Π½ΠΎ ΡΠ΅ΠΉΡΠ°Ρ Ρ Π½Π°Ρ Π±ΠΎΠ»ΡΡΠ΅ ΠΎΠΏΡΡΠ°, ΠΏΠΎΡΠ΅Π½ΡΠΈΠ°Π»ΡΠ½ΠΎΠ΅ ΡΠ°ΡΠΏΠΈΡΠ°Π½ΠΈΠ΅ ΠΌΠΎΠΆΠ΅Ρ Π±ΡΡΡ ΠΏΡΠΈΠΌΠ΅ΡΠ½ΠΎ ΡΠ°ΠΊΠΈΠΌ:
ΠΠ΅Π½Ρ 1: Π‘Π±ΠΎΡ ΠΎΠ±ΡΠ°Π·ΡΠ°, ΠΊΡΠ»ΡΡΡΡΠ°
ΠΠ΅Π½Ρ 2: ΠΠ·Π²Π»Π΅ΡΠ΅Π½ΠΈΠ΅ ΠΠΠ, Π°Π½Π°Π»ΠΈΠ· Π½Π° Π³Π΅Π»Π΅, ΠΎΠΏΡΠ΅Π΄Π΅Π»Π΅Π½ΠΈΠ΅ ΠΊΠΎΠ»ΠΈΡΠ΅ΡΡΠ²Π°
ΠΠ΅Π½Ρ 3: ΠΠΎΠ΄Π³ΠΎΡΠΎΠ²ΠΊΠ° Π±ΠΈΠ±Π»ΠΈΠΎΡΠ΅ΠΊΠΈ, ΠΏΠΎΡΠ»Π΅Π΄ΠΎΠ²Π°ΡΠ΅Π»ΡΠ½ΠΎΡΡΡ (ΡΡΠΎ Π±ΡΠ΄Π΅Ρ Π΄ΠΎΠ»Π³ΠΈΠΉ Π΄Π΅Π½Ρ)
ΠΠ΅Π½Ρ 4: ΠΠΎΠ»ΡΡΠ΅Π½ΠΈΠ΅ ΠΏΠΎΡΠ»Π΅Π΄ΠΎΠ²Π°ΡΠ΅Π»ΡΠ½ΠΎΡΡΠ΅ΠΉ, Π·Π°Π³ΡΡΠ·ΠΊΠ°, ΠΎΡΠ΅Π½ΠΊΠ° ΠΏΠΎΠΊΠ°Π·Π°Π½ΠΈΠΉ, Π½Π°ΡΠ°Π»ΠΎ ΡΠ±ΠΎΡΠΊΠΈ
ΠΠ΅Π½Ρ 5: ΠΡΠ΅Π½ΠΊΠ° ΡΠ±ΠΎΡΠΊΠΈ, Π°Π½Π½ΠΎΡΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠ΅
ΠΡΠΎ ΠΏΠΎΡ
ΠΎΠΆΠ΅ Π½Π° Π³ΡΠ°ΡΠΈΠΊ Π΄Π»Ρ Pore Camp, ΠΊΠΎΡΠΎΡΡΠΌ ΡΡΠΊΠΎΠ²ΠΎΠ΄ΠΈΡ ΠΠΈΠΊ ΠΠΎΠΌΠ°Π½ ΠΈΠ· ΠΠΈΡΠΌΠΈΠ½Π³Π΅ΠΌΡΠΊΠΎΠ³ΠΎ ΡΠ½ΠΈΠ²Π΅ΡΡΠΈΡΠ΅ΡΠ° Π² ΠΠ΅Π»ΠΈΠΊΠΎΠ±ΡΠΈΡΠ°Π½ΠΈΠΈ. Π£ Π½ΠΈΡ
Π΅ΡΡΡ ΠΎΡΠ»ΠΈΡΠ½ΡΠ΅ ΠΌΠ°ΡΠ΅ΡΠΈΠ°Π»Ρ ΠΈ ΠΎΠΏΡΡ, ΠΊΠΎΡΠΎΡΡΠΌΠΈ ΠΎΠ½ΠΈ ΠΌΠΎΠ³ΡΡ ΠΏΠΎΠ΄Π΅Π»ΠΈΡΡΡΡ:
http://porecamp.github.io/
Π‘ΡΠΎΠΈΠΌΠΎΡΡΡ
- ΠΠΎΠΊΠ° Π½Π΅ΠΈΠ·Π²Π΅ΡΡΠ½ΠΎ, ΠΊΠ°ΠΊΠΎΠ²Π° ΡΡΠΎΠΈΠΌΠΎΡΡΡ ΠΎΠ΄Π½ΠΎΠ³ΠΎ ΠΎΠ±ΡΠ°Π·ΡΠ°.
- Π‘ΡΠΎΠΈΠΌΠΎΡΡΡ ΡΡΡΡΠ°Π½Π΅Π½ΠΈΡ Π½Π΅ΠΏΠΎΠ»Π°Π΄ΠΎΠΊ?
Π― ΡΠΎΡΡΠ°Π²ΠΈΠ» ΠΊΡΠ°ΡΠΊΠΈΠΉ ΡΠΏΠΈΡΠΎΠΊ ΠΏΠΎΠΊΡΠΏΠΎΠΊ ONP MinION:
https://docs.google.com/spreadsheets/d/1yBncz75kgwExCXy7sC9LsMaDGs8OJJJGg9f4o3DcoQE/edit?usp=sharing
ΠΠ°ΠΊ ΠΏΡΠ°Π²ΠΈΠ»ΠΎ, ΡΡΠΎ ΠΏΡΠ΅Π΄ΠΌΠ΅ΡΡ Π΄Π»Ρ ΠΏΠΎΠΊΡΠΏΠΊΠΈ. :
- Π‘ΡΠ°ΡΡΠΎΠ²ΡΠΉ ΠΏΠ°ΠΊΠ΅Ρ Mk1B ΠΏΠΎΡΡΠ°Π²Π»ΡΠ΅ΡΡΡ Ρ 2 ΠΏΡΠΎΡΠΎΡΠ½ΡΠΌΠΈ ΠΊΡΠ²Π΅ΡΠ°ΠΌΠΈ
- ΠΊΠΎΠΌΠΏΡΡΡΠ΅Ρ
- Π Π΅Π°Π³Π΅Π½ΡΡ ONP
- ΡΡΠΎΡΠΎΠ½Π½ΠΈΠ΅ ΡΠ΅Π°Π³Π΅Π½ΡΡ (NEB)
ΠΠΎΠ»ΡΡΠ΅Π½ΠΈΠ΅ ΠΏΠΎΠΌΠΎΡΠΈ
- Π£ ΡΠΎΠΎΠ±ΡΠ΅ΡΡΠ²Π° MAP Π΅ΡΡΡ ΠΎΡΠ²Π΅ΡΡ Π½Π° Π½Π΅ΠΊΠΎΡΠΎΡΡΠ΅ Π²ΠΎΠΏΡΠΎΡΡ
- ΠΠ΅Ρ Π½ΠΎΠΌΠ΅ΡΠ° ΡΠ΅Π»Π΅ΡΠΎΠ½Π° Π΄Π»Ρ Π·Π²ΠΎΠ½ΠΊΠ° Π² ONP. Π ΠΎΡΠ»ΠΈΡΠΈΠ΅ ΠΎΡΒ Illumina, Ρ Illumina Π΅ΡΡΡ ΡΠ°Π½ΡΠ°ΡΡΠΈΡΠ΅ΡΠΊΠ°Ρ ΡΠ΅Π»Π΅ΡΠΎΠ½Π½Π°Ρ Π»ΠΈΠ½ΠΈΡ ΠΎΠ±ΡΠ»ΡΠΆΠΈΠ²Π°Π½ΠΈΡ ΠΊΠ»ΠΈΠ΅Π½ΡΠΎΠ², Ρ Ρ
ΠΎΡΠΎΡΠΎ ΠΎΠ±ΡΡΠ΅Π½Π½ΡΠΌΠΈ ΡΠ΅Ρ
Π½ΠΈΡΠ΅ΡΠΊΠΈΠΌΠΈ ΡΠΏΠ΅ΡΠΈΠ°Π»ΠΈΡΡΠ°ΠΌΠΈ Π½Π° Π΄ΡΡΠ³ΠΎΠΌ ΠΊΠΎΠ½ΡΠ΅, ΡΡΠΎΠ±Ρ ΠΎΡΠ²Π΅ΡΠΈΡΡ Π½Π° ΡΠΊΡΡΡΠ΅Π½Π½ΡΠ΅ ΡΠ΅Π»Π΅ΡΠΎΠ½Π½ΡΠ΅ Π·Π²ΠΎΠ½ΠΊΠΈ.
Π Π΅Π°Π³Π΅Π½ΡΡ ΠΈ ΠΏΡΠΎΡΠΎΡΠ½ΡΠ΅ ΡΡΠ΅ΠΉΠΊΠΈ Π΄ΠΎΡΠΎΠ³ΠΈ. ΠΠΎΠ³Π΄Π° Π²Ρ Π½Π°Ρ ΠΎΠ΄ΠΈΡΠ΅ΡΡ Π² Π»Π°Π±ΠΎΡΠ°ΡΠΎΡΠΈΠΈ ΠΈ Π²ΠΎΠ·Π½ΠΈΠΊΠ°Π΅Ρ ΠΏΡΠΎΠ±Π»Π΅ΠΌΠ°, Π½Π°ΠΏΡΠΈΠΌΠ΅Ρ ΠΏΡΠ·ΡΡΠ΅ΠΊ Π½Π° ΠΏΡΠΎΡΠΎΡΠ½ΠΎΠΉ ΠΊΡΠ²Π΅ΡΠ΅ ΠΈΠ»ΠΈ Π½ΠΈΠ·ΠΊΠΎΠ΅ ΡΠΈΡΠ»ΠΎ ΠΏΠΎΡ ΠΏΠΎΡΠ»Π΅ ΠΊΠΎΠ½ΡΡΠΎΠ»Ρ ΠΊΠ°ΡΠ΅ΡΡΠ²Π°, ΡΠ°ΡΡΠΎ Π½Π΅ΠΎΠ±Ρ ΠΎΠ΄ΠΈΠΌΠΎ ΠΏΠΎΠ·Π²ΠΎΠ½ΠΈΡΡ ΠΈ ΠΏΠΎΠ³ΠΎΠ²ΠΎΡΠΈΡΡ Ρ ΡΠ΅Π»ΠΎΠ²Π΅ΠΊΠΎΠΌ ΠΏΠΎ ΡΠ΅Π»Π΅ΡΠΎΠ½Ρ, ΡΡΠΎΠ±Ρ Π·Π°Π΄Π°ΡΡ Π²ΠΎΠΏΡΠΎΡ, ΡΡΠΎΠ±Ρ Π½Π΅ ΡΡΠ°ΡΠΈΡΡ Π·ΡΡ Π²ΡΠ΅ΠΌΡ ΠΈΠ»ΠΈ Π΄Π΅Π½ΡΠ³ΠΈ.
- Π£ ΠΌΠ΅Π½Ρ Π±ΡΠ»ΠΎ ΠΌΠ½ΠΎΠ³ΠΎ Ρ ΠΎΡΠΎΡΠΈΡ ΡΠ°Π·Π³ΠΎΠ²ΠΎΡΠΎΠ² ΠΏΠΎ ΡΠ»Π΅ΠΊΡΡΠΎΠ½Π½ΠΎΠΉ ΠΏΠΎΡΡΠ΅ ΡΠΎ ΡΠ»ΡΠΆΠ±ΠΎΠΉ ΡΠ΅Ρ Π½ΠΈΡΠ΅ΡΠΊΠΎΠΉ ΠΏΠΎΠ΄Π΄Π΅ΡΠΆΠΊΠΈ ONP, Π½ΠΎ Π½Π΅Ρ Π½ΠΈΡΠ΅Π³ΠΎ Π»ΡΡΡΠ΅, ΡΠ΅ΠΌ ΠΏΠΎΠ·Π²ΠΎΠ½ΠΈΡΡ ΠΊΠΎΠΌΡ-ΡΠΎ ΠΏΠΎ ΡΠ΅Π»Π΅ΡΠΎΠ½Ρ ΠΈ ΠΎΠ±ΡΡΠ΄ΠΈΡΡ ΠΏΡΠΎΠ±Π»Π΅ΠΌΡ. Π§Π°ΡΡΠΎ Π΅ΡΡΡ Π²Π΅ΡΠΈ, Π½Π°Π΄ ΠΊΠΎΡΠΎΡΡΠΌΠΈ Π½ΡΠΆΠ½ΠΎ ΠΏΠΎΡΠ°Π±ΠΎΡΠ°ΡΡ ΠΏΠΎΡΠ»Π΅ ΡΠ»Π΅ΠΊΡΡΠΎΠ½Π½ΠΎΠ³ΠΎ ΠΏΠΈΡΡΠΌΠ°, ΠΈ ΡΡΡΠ΄Π½ΠΎ ΡΠ»Π΅Π΄ΠΈΡΡ Π·Π° Π½ΠΈΠΌΠΈ, ΠΏΠ΅ΡΠ΅Ρ ΠΎΠ΄Ρ ΡΡΠ΄Π° ΠΈ ΠΎΠ±ΡΠ°ΡΠ½ΠΎ ΠΏΠΎ ΡΠ»Π΅ΠΊΡΡΠΎΠ½Π½ΠΎΠΉ ΠΏΠΎΡΡΠ΅.
- Π€ΡΠ½ΠΊΡΠΈΡ LiveChatting Π½Π° Π²Π΅Π±-ΡΠ°ΠΉΡΠ΅ ONP Π²Π΅Π»ΠΈΠΊΠΎΠ»Π΅ΠΏΠ½Π°! (Π ΡΠ°Π±ΠΎΡΠΈΠ΅ ΡΠ°ΡΡ ΠΠ΅Π»ΠΈΠΊΠΎΠ±ΡΠΈΡΠ°Π½ΠΈΠΈ Π² Π½ΠΈΠΆΠ½Π΅ΠΉ ΡΠ°ΡΡΠΈ Π²Π΅Π±-ΡΠ°ΠΉΡΠ° ΠΌΠ°Π³Π°Π·ΠΈΠ½Π° Π΅ΡΡΡ ΡΡΠ½ΠΊΡΠΈΡ Β«Π£ Π²Π°Ρ Π΅ΡΡΡ Π²ΠΎΠΏΡΠΎΡ?Β». Π Π½Π΅ΡΠ°Π±ΠΎΡΠ΅Π΅ Π²ΡΠ΅ΠΌΡ ΡΠ°ΠΌ Π΅ΡΡΡ Π½Π°Π΄ΠΏΠΈΡΡ Β«ΠΡΡΠ°Π²ΠΈΡΡ ΡΠΎΠΎΠ±ΡΠ΅Π½ΠΈΠ΅Β».
ΠΠ»Π°Π³ΠΎΠ΄Π°ΡΡ ΡΡΠΎΠΌΡ ΠΏΡΠΎΡΠ΅ΡΡΡ Ρ ΠΏΠΎΠ½ΡΠ», ΡΡΠΎ Ρ ΠΌΠ΅Π½Ρ ΠΌΠ½ΠΎΠ³ΠΎ Π²ΠΎΠΏΡΠΎΡΠΎΠ² ΠΈ ΠΌΠ°Π»ΠΎ ΠΎΡΠ²Π΅ΡΠΎΠ². Π£ MAP ΠΌΠ½ΠΎΠ³ΠΎ Π²ΠΎΠΏΡΠΎΡΠΎΠ² Π½Π° ΡΠΎΡΡΠΌΠ΅, Π½ΠΎ ΠΌΠ°Π»ΠΎ ΡΡΠΊΠΎΠ²ΠΎΠ΄ΡΡΠ². ΠΠΎΠΈΡΠΊ ΠΏΠΎ ΡΡΠ°Π·Π΅ ΠΎΡΡΡΠΎΠΉ. ΠΡΠ»ΠΈ Π²Ρ ΠΈΡΠ΅ΡΠ΅ ΡΡΠ°Π·Ρ Π² ΠΊΠ°Π²ΡΡΠΊΠ°Ρ
, ΠΎΠ½Π° Π²ΡΠ΅ ΡΠ°Π²Π½ΠΎ Π±ΡΠ΄Π΅Ρ ΠΈΡΠΊΠ°ΡΡ ΠΎΡΠ΄Π΅Π»ΡΠ½ΡΠ΅ ΡΠ»ΠΎΠ²Π°. ΠΠ°ΠΏΡΠΈΠΌΠ΅Ρ:
ΠΡΡΠ°Π²ΡΠΈΠ΅ΡΡ Π²ΠΎΠΏΡΠΎΡΡ:
1. ΠΠΎΡΠ΅ΠΌΡ ΡΠΈΡΠ»ΠΎ ΠΏΠΎΡ ΠΏΡΠΎΡΠΎΡΠ½ΠΎΠΉ ΠΊΡΠ²Π΅ΡΡ ΠΊΠΎΠ»Π΅Π±Π»Π΅ΡΡΡ? ΠΠ°ΠΊΠΎΠ²ΠΎ ΠΎΠΏΡΠΈΠΌΠ°Π»ΡΠ½ΠΎΠ΅ ΡΠΈΡΠ»ΠΎ ΠΏΠΎΡ Π΄Π»Ρ ΠΏΡΠΎΡΠΎΡΠ½ΠΎΠΉ ΠΊΡΠ²Π΅ΡΡ?
2. ΠΠ°ΠΊ ΡΡΠΈΡΡΠ²Π°Π½ΠΈΡ 1D Π²Π»ΠΈΡΡΡ Π½Π° ΡΠ±ΠΎΡΠΊΡ? ΠΠΎΠΆΠ΅ΠΌ Π»ΠΈ ΠΌΡ ΠΈΡΠΏΠΎΠ»ΡΠ·ΠΎΠ²Π°ΡΡ Β«Π½Π΅ΡΠ΄Π°ΡΠ½ΡΠ΅Β» ΡΡΠ΅Π½ΠΈΡ Π΄Π»Ρ ΡΠ΅Π³ΠΎ-Π»ΠΈΠ±ΠΎ?
3. Π‘ΠΊΠΎΠ»ΡΠΊΠΎ Π²ΡΠ΅ΠΌΠ΅Π½ΠΈ Π·Π°ΠΉΠΌΠ΅Ρ ΠΏΡΠΎΠ³ΠΎΠ½?
4. Π‘ΠΊΠΎΠ»ΡΠΊΠΎ ΠΌΠ΅ΡΡΠ° Π½Π° ΠΆΠ΅ΡΡΠΊΠΎΠΌ Π΄ΠΈΡΠΊΠ΅ ΡΡΠ΅Π±ΡΠ΅ΡΡΡ Π΄Π»Ρ ΠΎΠ΄Π½ΠΎΠ³ΠΎ Π·Π°ΠΏΡΡΠΊΠ°?
5. ΠΠΎΠ³Π΄Π° ΡΡΠΈΡΡΠ²Π°Π½ΠΈΡ Β«ΡΡΠΏΠ΅ΡΠ½ΡΒ», Π° ΠΊΠΎΠ³Π΄Π° Β«Π½Π΅ΡΠ΄Π°ΡΠ½ΡΒ»? ΠΡΡΡ Π»ΠΈ ΡΠ΅Π½Π½ΠΎΡΡΡ Π² Π½Π΅ΡΠ΄Π°ΡΠ½ΡΡ ΡΡΠ΅Π½ΠΈΡΡ ?
6. ΠΠ°ΠΊ ΠΌΠ°ΠΊΡΠΈΠΌΠ°Π»ΡΠ½ΠΎ ΡΡΡΠ΅ΠΊΡΠΈΠ²Π½ΠΎ ΠΈΡΠΏΠΎΠ»ΡΠ·ΠΎΠ²Π°ΡΡ ΠΏΡΠΎΡΠΎΡΠ½ΡΠ΅ ΠΊΡΠ²Π΅ΡΡ? Β ΠΠΎΡ
ΠΎΠΆΠ΅, ΡΡΡΠ΅ΡΡΠ²ΡΠ΅Ρ ΠΌΠ½ΠΎΠ³ΠΎ Π½Π΅ΠΈΠ·Π²Π΅ΡΡΠ½ΡΡ
, ΡΠ²ΡΠ·Π°Π½Π½ΡΡ
Ρ ΡΡΡΠ΅ΠΊΡΠΈΠ²Π½ΠΎΡΡΡΡ ΠΏΡΠΎΡΠΎΡΠ½ΡΡ
ΡΡΠ΅Π΅ΠΊ. ΠΡ ΠΏΠΎΠΏΡΡΠ°Π»ΠΈΡΡ ΠΏΠΎΠ²ΡΠΎΡΠ½ΠΎ ΠΈΡΠΏΠΎΠ»ΡΠ·ΠΎΠ²Π°ΡΡ ΠΏΡΠΎΠΌΡΡΡΡ ΠΏΡΠΎΡΠΎΡΠ½ΡΡ ΠΊΡΠ²Π΅ΡΡ. ΠΠΎ Π²ΡΠ΅ΠΌΡ ΠΏΠ΅ΡΠ²ΠΎΠ½Π°ΡΠ°Π»ΡΠ½ΠΎΠ³ΠΎ ΠΊΠΎΠ½ΡΡΠΎΠ»Ρ ΠΊΠ°ΡΠ΅ΡΡΠ²Π° Π² ΠΏΡΠΎΡΠΎΡΠ½ΠΎΠΉ ΠΊΡΠ²Π΅ΡΠ΅ Π±ΡΠ»ΠΎ >400 ΠΏΠΎΡ. ΠΠΎΡΠ»Π΅ ΡΠΎΠ³ΠΎ, ΠΊΠ°ΠΊ ΠΌΡ Π·Π°Π³ΡΡΠ·ΠΈΠ»ΠΈ Π±ΠΈΠ±Π»ΠΈΠΎΡΠ΅ΠΊΡ ΠΈ Π½Π°ΡΠ°Π»ΠΈ ΠΏΡΠΎΠ³ΠΎΠ½, ΠΊΠΎΠ»ΠΈΡΠ΅ΡΡΠ²ΠΎ ΠΏΠΎΡ Π±ΡΠ»ΠΎ Π² ΠΏΡΠ΅Π΄Π΅Π»Π°Ρ
80β100. Π§Π΅ΡΠ΅Π· 2 ΡΠ°ΡΠ° ΡΡΠΎ ΡΠΈΡΠ»ΠΎ ΡΠΏΠ°Π»ΠΎ Π΄ΠΎ ~ 30 Ρ. Π― Π΄ΠΎΠ±Π°Π²ΠΈΠ» Π±ΠΎΠ»ΡΡΠ΅ Π±ΠΈΠ±Π»ΠΈΠΎΡΠ΅ΠΊΠΈ, ΠΈ ΠΊΠΎΠ»ΠΈΡΠ΅ΡΡΠ²ΠΎ ΠΏΠΎΡ Π±ΠΎΠ»ΡΡΠ΅ Π½ΠΈΠΊΠΎΠ³Π΄Π° Π½Π΅ ΡΠ²Π΅Π»ΠΈΡΠΈΠ²Π°Π»ΠΎΡΡ. Π―Π²Π»ΡΠ΅ΡΡΡ Π»ΠΈ ΡΡΠΎ ΡΠ΅Π·ΡΠ»ΡΡΠ°ΡΠΎΠΌ ΡΡ
ΡΠ΄ΡΠ΅Π½ΠΈΡ ΠΊΠ°ΡΠ΅ΡΡΠ²Π° ΠΏΠΎΡ? ΠΠ° ΡΠ»Π΅Π΄ΡΡΡΠ΅Π΅ ΡΡΡΠΎ ΡΠ½ΠΎΠ²Π° Π·Π°Π³ΡΡΠ·ΠΈΠ» Π±ΠΈΠ±Π»ΠΈΠΎΡΠ΅ΠΊΡ. ΠΠ΅ ΡΠ°ΠΊ ΠΌΠ½ΠΎΠ³ΠΎ ΠΈΠ·ΠΌΠ΅Π½Π΅Π½ΠΈΠΉ. Π Π΅ΡΠΈΠ» ΡΠΌΠ΅Π½ΠΈΡΡ ΠΏΡΠΎΡΠΎΡΠ½ΡΡ ΡΡΠ΅ΠΉΠΊΡ ΠΈ ΠΏΠΎΠΏΡΠΎΠ±ΠΎΠ²Π°ΡΡ Π½ΠΎΠ²ΡΡ.
7. Π‘ΡΡΠ΅ΡΡΠ²ΡΡΡ Π»ΠΈ ΡΡΡΠ΅ΠΊΡΡ ΠΏΠ°ΠΊΠ΅ΡΠ½ΠΎΠΉ ΠΏΠΎΠ΄Π³ΠΎΡΠΎΠ²ΠΊΠΈ Π±ΠΈΠ±Π»ΠΈΠΎΡΠ΅ΠΊΠΈ ΠΈ/ΠΈΠ»ΠΈ ΠΏΡΠΎΡΠΎΡΠ½ΡΡ ΠΊΡΠ²Π΅Ρ? ΠΠΎΠ»ΠΆΠ½Ρ Π»ΠΈ ΠΌΡ Ρ ΠΎΡΡΠΎΡΠΎΠΆΠ½ΠΎΡΡΡΡ ΠΎΡΠ½ΠΎΡΠΈΡΡΡΡ ΠΊ ΠΎΠ±ΡΠ΅Π΄ΠΈΠ½Π΅Π½ΠΈΡ ΠΏΠΎΠΊΠ°Π·Π°Π½ΠΈΠΉ ΠΈΠ· Π½Π΅ΡΠΊΠΎΠ»ΡΠΊΠΈΡ ΠΏΡΠΎΡΠΎΡΠ½ΡΡ ΡΡΠ΅Π΅ΠΊ?
ΠΡΠ΄ΡΡΠ΅Π΅
Π Π±ΡΠ΄ΡΡΠ΅ΠΌ ΡΠ΅Π»Ρ ΡΠΎΡΡΠΎΠΈΡ Π² ΡΠΎΠΌ, ΡΡΠΎΠ±Ρ ΠΎΡΠΎΠΉΡΠΈ ΠΎΡ Π·Π°Π±ΠΎΡ ΠΎ Π΄Π΅ΡΠ°Π»ΡΡ ΡΠ΅Ρ Π½ΠΎΠ»ΠΎΠ³ΠΈΠΈ ΠΈ ΡΠΎΡΡΠ΅Π΄ΠΎΡΠΎΡΠΈΡΡΡΡ Π½Π° Π°Π½Π°Π»ΠΈΠ·Π΅ Π΄Π°Π½Π½ΡΡ ΠΈ ΠΈΡ Π·Π½Π°ΡΠ΅Π½ΠΈΠΈ. Π¦Π΅Π»Ρ Π΄ΠΎΠ»ΠΆΠ½Π° Π·Π°ΠΊΠ»ΡΡΠ°ΡΡΡΡ Π² ΡΠΎΠΌ, ΡΡΠΎΠ±Ρ ΡΠΎΡΡΠ΅Π΄ΠΎΡΠΎΡΠΈΡΡΡΡ Π½Π° Π±ΠΈΠΎΠ»ΠΎΠ³ΠΈΠΈ ΠΈ Π½Π° ΡΠΎΠΌ, ΠΏΠΎΡΠ΅ΠΌΡ ΠΌΡ Π·Π°ΠΈΠ½ΡΠ΅ΡΠ΅ΡΠΎΠ²Π°Π½Ρ Π² ΡΠ΅ΠΊΠ²Π΅Π½ΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠΈ Π²ΡΠ΅Π³ΠΎ ΠΈ Π²ΡΡ. Π§ΡΠΎ ΠΌΡ ΠΌΠΎΠΆΠ΅ΠΌ ΡΠ΄Π΅Π»Π°ΡΡ ΡΠΎ Π²ΡΠ΅ΠΉ ΡΡΠΎΠΉ ΠΈΠ½ΡΠΎΡΠΌΠ°ΡΠΈΠ΅ΠΉ ΡΠ΅ΠΏΠ΅ΡΡ, ΠΊΠΎΠ³Π΄Π° ΠΌΡ ΠΌΠΎΠΆΠ΅ΠΌ ΡΠ΅ΠΊΠ²Π΅Π½ΠΈΡΠΎΠ²Π°ΡΡ Π³Π΅Π½ΠΎΠΌ Π½ΠΎΠ²ΠΎΠ³ΠΎ Π²ΠΈΠ΄Π° Π±Π°ΠΊΡΠ΅ΡΠΈΠΉ Π·Π° Π½Π΅Π΄Π΅Π»Ρ?
ΠΡΡΠ°Π²Π»ΡΠΉΡΠ΅ ΠΊΠΎΠΌΠΌΠ΅Π½ΡΠ°ΡΠΈΠΈ ΠΈ ΠΎΠ±ΡΠ°ΡΠ°ΠΉΡΠ΅ΡΡ!
https://www.flickr.com/photos/lpcohen/28193032994/
ΠΡΠ°Π²ΠΈΡΡΡ:
ΠΡΠ°Π²ΠΈΡΡΡ ΠΠ°Π³ΡΡΠ·ΠΊΠ°. ..
fastq — ΠΠΎΠ³Ρ Π»ΠΈ Ρ ΠΈΠ·Π²Π»Π΅ΡΡ ΠΏΡΠΎΡΠΎΡΠ½ΡΡ ΠΊΡΠ²Π΅ΡΡ MinION ΠΈΠ· USB-ΠΏΠΎΡΡΠ° Π²ΠΎ Π²ΡΠ΅ΠΌΡ Π²ΡΠΏΠΎΠ»Π½Π΅Π½ΠΈΡ ΠΎΡΠ½ΠΎΠ²Π½ΠΎΠ³ΠΎ Π²ΡΠ·ΠΎΠ²Π°?
ΡΠΏΡΠΎΡΠΈΠ»
ΠΠ·ΠΌΠ΅Π½Π΅Π½ΠΎ 4 ΠΌΠ΅ΡΡΡΠ° Π½Π°Π·Π°Π΄
ΠΡΠΎΡΠΌΠΎΡΡΠ΅Π½ΠΎ 695 ΡΠ°Π·
$\begingroup$ΠΠΎΠΆΠ½ΠΎ Π»ΠΈ ΠΈΠ·Π²Π»Π΅ΡΡ ΠΏΡΠΎΡΠΎΡΠ½ΡΡ ΠΊΡΠ²Π΅ΡΡ MinION ΠΈΠ· USB-ΠΏΠΎΡΡΠ° ΠΏΡΠΈ Π²ΡΠΏΠΎΠ»Π½Π΅Π½ΠΈΠΈ Π±Π°Π·ΠΎΠ²ΠΎΠ³ΠΎ Π²ΡΠ·ΠΎΠ²Π°? ΠΠΎΡΠΊΠΎΠ»ΡΠΊΡ ΡΡΠΎ Π·Π°Π½ΠΈΠΌΠ°Π΅Ρ ΠΌΠ½ΠΎΠ³ΠΎ Π²ΡΠ΅ΠΌΠ΅Π½ΠΈ ΠΈ Π½Π΅Π²ΠΎΠ·ΠΌΠΎΠΆΠ½ΠΎ Π΄ΠΎΠΆΠ΄Π°ΡΡΡΡ Π·Π°Π²Π΅ΡΡΠ΅Π½ΠΈΡ, ΠΏΠΎΠ²Π»ΠΈΡΠ΅Ρ Π»ΠΈ ΡΡΠΎ Π½Π° Π±Π΅ΠΉΡΠΊΠΎΠ»Π»?
$\endgroup$ $\begingroup$ΠΠΎΠΆΠ½ΠΎ, ΠΏΠΎΡΠ΅ΡΡΠ΅ΡΠ΅ ΠΏΠ΅ΡΠ΅Π΄Π°ΡΡ ΠΎΡ ΠΠΈΠ½ΡΠΎΠ½Π°. ΠΠ΅ΡΠΎΡΡΠ½ΠΎ, Π±ΡΠ»ΠΎ Π±Ρ Π»ΡΡΡΠ΅ ΠΏΡΠΎΡΡΠΎ ΠΎΡΡΠ°Π½ΠΎΠ²ΠΈΡΡ Π±Π΅Π³. ΠΠΎΠΌΠΏΡΡΡΠ΅Ρ Π±ΡΠ΄Π΅Ρ ΠΏΡΠΎΠ΄ΠΎΠ»ΠΆΠ°ΡΡ Π±Π°Π·ΠΎΠ²ΡΠΉ Π²ΡΠ·ΠΎΠ², ΠΏΠΎΠΊΠ° ΡΡΠΎ Π½Π΅ Π±ΡΠ΄Π΅Ρ ΡΠ΄Π΅Π»Π°Π½ΠΎ. ΠΡΠ΅ Π½Π΅ΠΎΠ±ΡΠ°Π±ΠΎΡΠ°Π½Π½ΡΠ΅ ΡΡΠ΅Π½ΠΈΡ Ρ ΡΠ°Π½ΡΡΡΡ Π»ΠΎΠΊΠ°Π»ΡΠ½ΠΎ Π½Π° ΠΌΠ°ΡΠΈΠ½Π΅, ΠΏΠΎΡΡΠΎΠΌΡ Π²ΡΠ΅ Π΄ΠΎΠ»ΠΆΠ½ΠΎ Π±ΡΡΡ Π² ΠΏΠΎΡΡΠ΄ΠΊΠ΅.
$\endgroup$ $\begingroup$ ΠΠ°, Π²ΡΠ΅ Π΄ΠΎΠ»ΠΆΠ½ΠΎ Π±ΡΡΡ Π² ΠΏΠΎΡΡΠ΄ΠΊΠ΅, ΠΎΡΠΎΠ±Π΅Π½Π½ΠΎ Π΅ΡΠ»ΠΈ ΠΏΡΠΎΠ³ΠΎΠ½ Π·Π°Π²Π΅ΡΡΠ΅Π½. MinKNOW Π΄ΠΎΠ»ΠΆΠ΅Π½ ΠΏΠΎ-ΠΏΡΠ΅ΠΆΠ½Π΅ΠΌΡ ΠΏΡΠΎΠ΄ΠΎΠ»ΠΆΠ°ΡΡ Π±Π°Π·ΠΎΠ²ΡΠΉ Π²ΡΠ·ΠΎΠ² Π΄Π°ΠΆΠ΅ ΠΏΠΎΡΠ»Π΅ ΠΎΡΠΊΠ»ΡΡΠ΅Π½ΠΈΡ MinION. Π ΡΠΎΠΆΠ°Π»Π΅Π½ΠΈΡ, Ρ Π½Π΅ ΠΌΠΎΠ³Ρ Π½Π°ΠΉΡΠΈ Ρ
ΠΎΡΠΎΡΠΈΡ
ΡΠΎΠΎΠ±ΡΠ΅Π½ΠΈΠΉ ΠΎΠ± ΡΡΠΎΠΌ Π² ΡΠΎΠΎΠ±ΡΠ΅ΡΡΠ²Π΅ ONT, ΠΏΠΎΡΠΎΠΌΡ ΡΡΠΎ ΠΏΠΎΠΈΡΠΊ Π² Π½Π°ΡΡΠΎΡΡΠ΅Π΅ Π²ΡΠ΅ΠΌΡ Π½Π΅ ΡΠ°Π±ΠΎΡΠ°Π΅Ρ. ΠΡΠΎΡ ΠΏΠΎΡΡ ΠΌΠΎΠΆΠ΅Ρ Π±ΡΡΡ ΠΏΠΎΠ»Π΅Π·Π΅Π½ (Π½Π°ΠΉΠ΄Π΅Π½ΠΎ ΠΏΡΠΈ ΠΏΠΎΠΈΡΠΊΠ΅ Π² ΠΌΠΎΠ΅ΠΉ ΡΠ»Π΅ΠΊΡΡΠΎΠ½Π½ΠΎΠΉ ΠΏΠΎΡΡΠ΅), Π½ΠΎ Π΅ΠΌΡ ΡΠΆΠ΅ Π΄Π²Π° Π³ΠΎΠ΄Π°:
ΠΡΠΈΠ²Π΅Ρ, ΡΠΏΠ°ΡΠΈΠ±ΠΎ Π·Π° Π²Π°Ρ ΠΏΠΎΡΡ. ΠΠΎΠ½Π΅ΡΠ½ΠΎ, Π²Ρ ΠΌΠΎΠΆΠ΅ΡΠ΅ ΡΠ½ΡΡΡ ΠΏΡΠΎΡΠΎΡΠ½ΡΡ ΠΊΡΠ²Π΅ΡΡ ΠΈ ΠΏΡΠΎΠΌΡΡΡ Π΅Π΅, Π½Π΅ Π²Π»ΠΈΡΡ Π½Π° ΡΠ΅ΠΆΠΈΠΌ Π½Π°Π²Π΅ΡΡΡΡΠ²Π°Π½ΠΈΡ. ΠΠΎΠΆΠ°Π»ΡΠΉΡΡΠ°, ΠΏΠΎΡΠ΅ΡΠΈΡΠ΅ ΡΡΡΠ°Π½ΠΈΡΡ Π·Π°Π³ΡΡΠ·ΠΎΠΊ Π·Π΄Π΅ΡΡ Π΄Π»Ρ ΠΏΠΎΠ»ΡΡΠ΅Π½ΠΈΡ ΡΠ°ΠΌΠΎΠΉ ΠΏΠΎΡΠ»Π΅Π΄Π½Π΅ΠΉ Π²Π΅ΡΡΠΈΠΈ ΡΡΡΠ°Π½ΠΎΠ²ΡΠΈΠΊΠ°.
— ΠΠΎΠ½ΠΎΠ»ΠΈΠ½Π° ΠΠΈΠ½Π½ΠΈ, ONT
ΠΡΠ»ΠΈ Π² Π±ΡΠ΄ΡΡΠ΅ΠΌ Π²Ρ, Π²Π΅ΡΠΎΡΡΠ½ΠΎ, Π±ΡΠ΄Π΅ΡΠ΅ Π²ΡΠΏΠΎΠ»Π½ΡΡΡ Π±ΠΎΠ»Π΅Π΅ Π΄Π»ΠΈΡΠ΅Π»ΡΠ½ΡΠ΅ ΠΏΡΠΎΠ³ΠΎΠ½Ρ (> 6 ΡΠ°ΡΠΎΠ²), Ρ Π±Ρ ΠΏΠΎΡΠ΅ΠΊΠΎΠΌΠ΅Π½Π΄ΠΎΠ²Π°Π» ΠΏΡΠΈΠΎΠ±ΡΠ΅ΡΡΠΈ Π΄Π΅ΡΠ΅Π²ΡΡ Π²ΠΈΠ΄Π΅ΠΎΠΊΠ°ΡΡΡ Ρ ΠΏΠΎΠ΄Π΄Π΅ΡΠΆΠΊΠΎΠΉ CUDA (ΠΏΠΎ ΠΊΡΠ°ΠΉΠ½Π΅ΠΉ ΠΌΠ΅ΡΠ΅, v10), ΡΡΠΎΠ±Ρ ΡΡΠΊΠΎΠ½ΠΎΠΌΠΈΡΡ Π²ΡΠ΅ΠΌΡ Π² Π±ΡΠ΄ΡΡΠ΅ΠΌ.
$\endgroup$ΠΠ°ΡΠ΅Π³ΠΈΡΡΡΠΈΡΡΠΉΡΠ΅ΡΡ ΠΈΠ»ΠΈ Π²ΠΎΠΉΠ΄ΠΈΡΠ΅ Π² ΡΠΈΡΡΠ΅ΠΌΡ
ΠΠ°ΡΠ΅Π³ΠΈΡΡΡΠΈΡΡΠΉΡΠ΅ΡΡ Ρ ΠΏΠΎΠΌΠΎΡΡΡ Google ΠΠ°ΡΠ΅Π³ΠΈΡΡΡΠΈΡΠΎΠ²Π°ΡΡΡΡ ΡΠ΅ΡΠ΅Π· Facebook ΠΠ°ΡΠ΅Π³ΠΈΡΡΡΠΈΡΡΠΉΡΠ΅ΡΡ, ΠΈΡΠΏΠΎΠ»ΡΠ·ΡΡ Π°Π΄ΡΠ΅Ρ ΡΠ»Π΅ΠΊΡΡΠΎΠ½Π½ΠΎΠΉ ΠΏΠΎΡΡΡ ΠΈ ΠΏΠ°ΡΠΎΠ»ΡΠΠΏΡΠ±Π»ΠΈΠΊΠΎΠ²Π°ΡΡ ΠΊΠ°ΠΊ Π³ΠΎΡΡΡ
ΠΠ»Π΅ΠΊΡΡΠΎΠ½Π½Π°Ρ ΠΏΠΎΡΡΠ°ΠΠ±ΡΠ·Π°ΡΠ΅Π»ΡΠ½ΠΎ, Π½ΠΎ Π½Π΅ ΠΎΡΠΎΠ±ΡΠ°ΠΆΠ°Π΅ΡΡΡ
ΠΠΏΡΠ±Π»ΠΈΠΊΠΎΠ²Π°ΡΡ ΠΊΠ°ΠΊ Π³ΠΎΡΡΡ
ΠΠ»Π΅ΠΊΡΡΠΎΠ½Π½Π°Ρ ΠΏΠΎΡΡΠ°Π’ΡΠ΅Π±ΡΠ΅ΡΡΡ, Π½ΠΎ Π½Π΅ ΠΎΡΠΎΠ±ΡΠ°ΠΆΠ°Π΅ΡΡΡ
ΠΠ°ΠΆΠΈΠΌΠ°Ρ Β«ΠΠΏΡΠ±Π»ΠΈΠΊΠΎΠ²Π°ΡΡ ΡΠ²ΠΎΠΉ ΠΎΡΠ²Π΅ΡΒ», Π²Ρ ΡΠΎΠ³Π»Π°ΡΠ°Π΅ΡΠ΅ΡΡ Ρ Π½Π°ΡΠΈΠΌΠΈ ΡΡΠ»ΠΎΠ²ΠΈΡΠΌΠΈ ΠΎΠ±ΡΠ»ΡΠΆΠΈΠ²Π°Π½ΠΈΡ ΠΈ ΠΏΠΎΠ΄ΡΠ²Π΅ΡΠΆΠ΄Π°Π΅ΡΠ΅, ΡΡΠΎ ΠΏΡΠΎΡΠΈΡΠ°Π»ΠΈ ΠΈ ΠΏΠΎΠ½ΡΠ»ΠΈ Π½Π°ΡΡ ΠΏΠΎΠ»ΠΈΡΠΈΠΊΡ ΠΊΠΎΠ½ΡΠΈΠ΄Π΅Π½ΡΠΈΠ°Π»ΡΠ½ΠΎΡΡΠΈ ΠΈ ΠΊΠΎΠ΄Π΅ΠΊΡ ΠΏΠΎΠ²Π΅Π΄Π΅Π½ΠΈΡ.