Квадратные рисунки на бумаге в клетку. Идеи украшения тетрадей в клеточку
Здоровье детей
Детей бывает сложно удивить, но это не означает, что сделать это невозможно. И после целого дня беготни, прыганья, танцев, игр, каждый должен немного успокоиться и заняться чем-то творческим и развивающим. На помощь и приходят маленькие рисунки по клеточкам. Когда нужно занять малышей – вытяните большой лист бумаги в клеточку, чтобы дети могли рисовать вместе.
Маленькие рисунки по клеточкам, хорошая или плохая идея?
Конечно, маленькие рисунки по клеточкам в блокноте – также хорошая идея, особенно, когда вы находитесь в пути с ребенком и занять его нечем. Маленькие и милые они помогут вашему чаду хорошо провести время, они получат от таких занятий максимум пользы. Маленькие рисунки по клеточкам в тетради — простая художественная деятельность, в которой сочетаются искусство и математика.
Леденцы по клеточкам фото
Картошка фри по клеточкам
Котенок по клеткам фото
Инструменты для рисования маленьких картинок по клеткам
Не говорите детям много, сделайте сюрприз, возьмите бумагу разного типа, маркеры или цветные карандаши и ручки и позвольте детям приступить к рисованию.
Рисунки могут быть произвольными, иногда полезно дать возможность ребенку развить фантазию посредствам рисования. Но можно выбирать и конкретные для 5 лет.
Если у вас есть домашний принтер – тогда вообще здорово. Вы можете настроить и создать собственную графическую бумагу в специальном приложении. У них есть много вариантов для графической бумаги — обычный квадрат, треугольник, и многое другое. Но на этот шаг решайтесь после того, как дети освоят рисование по клеткам. В приложении все же легко выбрать размер формы, которая вам нужна, толщину, цвет линий и многое другое. Тогда макет просто сохраняется их в формате pdf и вы можете распечатать его сразу же.
Используя обычную бумагу в клеточку, можно сделать простые повторяющиеся рисунки, рисунки шахматной доски. Можно объединить квадраты, чтобы делать большие фигуры и разделять квадраты на треугольники и меньшие квадраты и даже на восьмиугольники, чтобы делать всевозможные интересные изображения.
Треугольники и шестиугольники также хорошо подходят для узоров и картин.
Для тех, кто уже хорошо справляется с разными фигурами и отлично ориентируется в основах геометрических форм, можно взять за шаблон смайлики из вк. Позвольте ребенку выбрать любимые смайлики и перерисовать их в тетради. Хорошей идеей являются и животные.
Рисовать их первый раз может быть не так просто, если использовать клеточки, но на самом деле, дети быстро подхватят эту идею и уже спустя какое-то время смогут воплощать на листе в клеточку самые смелые идеи.
Несмотря на то, что это простая идея, она дает много пространства для творчества, что с большим количеством случайных математических понятий дает большой бонусный плюс для развития ребенка.
Арбуз по клеткам фото
Миньоны по клеткам фото
Супергерои по клеткам
Котик аниме по клеткам
Графический диктант
Стоит отметить, что задания с графической бумагой популярны в детских садиках. Один из распространенных приемов – создание рисунка без образца. Это своеобразный графический диктант.
Такое задание легко воспроизвести дома со своим ребенком. Для этого упражнения мы будем использовать листы бумаги формата 4×4. Начиная с левого верхнего угла, мы будем начинать закрашивать квадратики с помощью простых инструкций. Эти инструкции включают:
- переместить один квадрат вправо;
- переместить один квадрат влево;
- переместить один квадрат вверх;
- переместить один квадрат вниз. Вот как мы будем писать алгоритм, чтобы проинструктировать ребенка (который будет закрашивать клеточки).
Выберите простой рисунок, такой как шахматная доска, который будет использоваться в качестве примера. Это хороший способ ввести все символы в ключ. Чтобы начать, заполните график для ребенка — квадрат к квадрату — затем попросите его помочь описать, что вы только что сделали. Во-первых, вы можете говорить алгоритм вслух, тогда вы можете превратить свои словесные инструкции в программу. Пример алгоритма: «Переместить вправо, заполнить квадрат, двигаться вправо, сдвигаемся вниз.
Если ребенок хорошо справляется с этим упражнением, то это повод придумать альтернативное задает с похожей сутью, но сложнее. Если есть еще непонимание, сохраните это задание и попробуйте повторить это на следующий день, а пока поработайте с другим примером.
Если ребенок понимает алгоритм и может определить правильные символы для каждого шага, он готов двигаться дальше. В зависимости от вашего ребенка, его возраста и развития вы можете либо попытаться сделать сложную сетку вместе, либо перейти к тому, чтобы ребенок работал в паре с другом. Им понравится играть вместе, давая друг другу такие задания. Это отличный способ заставить ребенка работать творчески, придумывая собственные веселые картинки и разбивая их на алгоритмы передвижения по клеткам и их заполнения.
Маленькие рисунки по клеточкам на фото:
Увлекательное и одновременно развивающее занятие – рисование по клеточкам – помогает детям, совсем не умеющим рисовать, двигаясь от простого к сложному, развить воображение, художественные навыки.
Ребята постарше используют подобные рисунки для украшения в тетради, альбоме. Даже сложные рисунки выполняются относительно быстро.
Польза рисования по клеточкам
Благодаря увлекательному занятию можно интересно провести время. Специальных умений не требуется.
Рисование по клеткам развивает:
- художественный вкус;
- координацию;
- творческое мышление.
На ребят, занимающихся данным видом искусства,рисование воздействует успокаивающе: непоседливые дети постепенно становятся усидчивыми. Особенно расслабляется нервная система, если включить спокойную музыку во время творчества. Малыши, готовящиеся пойти в первый класс, развивают орфографическую зоркость.
С ними полезно заниматься рисованием по клеточкам, чтобы привить усидчивость, помочь преодолеть рассеянность. С помощью рисунков по клеточкам можно украсить страницы личного дневника или еженедельника. Этот вид рисования дает возможность каждому почувствовать себя настоящим художником.
Чем рисовать
Для рисования по клеточкам следует запастись тетрадью в клетку, блокнотом. Для изображений большого формата понадобится миллиметровая бумага. Также необходимы будут карандаши, фломастеры, цветные ручки. Эти принадлежности понадобятся для создания необычных ярких изображений.
Что можно рисовать
Рисуют абсолютно все: природу, зверей, смайлики, растения, персонажей мультфильмов. Существуют рисунки для мальчиков, девочек. Начинать следует с простых рисунков. Они рисуются преимущественно одним цветом. Например, для начала можно украсить тетрадь забавными смайликами. Затем можно приступить к рисованию прикольных вкусностей.
Можно изобразить на бумаге розовый пончик, гамбургер или завтрак: яичницу плюс апельсиновый сок.
Как рисовать
Первое время необходимо просчитывать клеточки перед началом работы, строить схемы.
Такая подготовка поможет творить, не отрываясь от процесса. Позже, по мере приобретения навыка, можно рисовать как угодно: заполнять середину, начинать с контура, зарисовывать столбиками.
Легкие рисунки для начинающих
«Пиксельные» рисунки обрели популярность среди людей всех возрастов. Для начала следует обратить внимание на простые изображения. Количеством задействованных клеток простые рисунки отличаются от сложных. В простом изображении проще соблюсти схему и не испортить рисунок добавлением ненужного квадратика.
Рисунки по клеточкам для маленьких
Если малыш хочет рисовать, но у него не получается, следует использовать совсем простые схемы и научить ребенка технике закрашивания клеточек. Важно, чтобы занятие не продлилось долго и не утомило малыша
. Например, ребенок может самостоятельно создать поздравительную открытку маме, папе, бабушке. Рисовать можно карандашами или фломастерами.Маленькие рисунки
Хорошим способом провести время являются небольшие изображения. Они пользуются популярностью у ребят, стремящихся скоротать время на уроках, у взрослых во время минут отдыха.
Подобное занятие дает возможность расслабиться, насладиться самим процессом.
За одну перемену школьник способен создать целый рисунок.
Большие и сложные рисунки на весь лист
В зависимости от площади изображения, которая закрашивается, определяют сложность рисунка. Если вблизи легко различимы отдельные квадратики большого рисунка, то издалека видно четкое изображение – появляется реалистичность. Кажется, что нарисовать сложное изображение непросто. Но принцип остается тем же.
Для сложных рисунков понадобится:
- тетрадь в клетку;
- цветные карандаши;
- черная гелевая ручка;
- фломастеры;
- фотография;
- компьютер.
Для девочек
Девочки украшают рисунками страницы с любимыми стихами, песнями, размещают изображения на листах своих дневников. Начинают с простых изображений, постепенно переходя к сложным. В первую очередь берут за основу готовый рисунок и перерисовывают его. Позже, приобретя умения, навыки, включают в работу фантазию.
Для мальчиков
Мальчики выбирают близкие им темы:
Рисунки по клеточкам в тетради(сложные особенно) развивают усидчивость и фантазию,помогают определиться с профессией.
Красивые рисунки для личного дневника
Некоторые люди ежедневно записывают события прошедшего дня в особом блокноте. Украсить его помогают изображения, сделанные по клеточкам. Можно подбирать рисунки, подходящие по тематике. Если описываются проказы домашних питомцев, размещают на страничках забавные мордочки собак, котиков. Если описывается сюжет понравившегося мультфильма или фильма,рисуют его главных персонажей.
Выбрать подходящий рисунок можно к любому виду косметики, рассуждению о моде.
Черно – белые
Отдельным направлением в искусстве считаются черно-белые изображения. Можно выбрать из множества вариантов для перерисовки от самых простых до сложных.
В коллекциях черно-белых картинок встречаются:
- кошки,
- собаки,
- панды,
- тигры,
- лошади,
- птицы,
- ящерицы.
Чаще всего такие изображения выполняются карандашом или черной гелевой ручкой.
Цветные
Рисунки по клеточкам, выполненные в тетради –хороший способ научиться рисованию, начиная с самых простых черно-белых рисунков и постепенно переходя на сложные цветные.
Стиль рисования карандашом набирает в последнее время популярность. Для цветных изображений используют фломастеры, мелки, наборы карандашей. Для начала перерисовывают шаблон.
3D рисунки
Главное свойство трехмерного изображения – реалистичность. Добиться подобного результата сложно. Чтобы «перешагнуть» из одной среды в другую, используют различные эффекты. Например, применяют способ игры света, тени – он считается самым простым.
Делая 3D рисунки, используют и другие приемы: не забывают о разнице нанесения линий на плоскости, в пространстве. Клеточки служат простыми элементами в рамках одного изображения,они выполняют роль пикселей, задающих определенное разрешение.
На день рождения
В пиксельной технике рисования по клеточкам можно оформить открытки, плакаты. Достаточно подобрать понравившийся шаблон и перенести его на бумагу. Можно выбрать яркую веселую картинку с забавными изображениями животных и надписями. Обязательным атрибутом праздника считаются цветы.
Следует изобразить те, которые нравятся имениннику и написать внутри пожелания.
На Новый Год
Новогодние картинки должны создавать соответствующее настроение. Отличный вариант – нарисовать снеговика, елочку. Для начала можно использовать простой карандаш, а затем обвести изображение фломастером, чтобы получилось ярче. Шарики, Дед Мороз и Снегурочка, лесные звери, подарки, символ года – все эти изображения относятся к новогодней тематике.
Нарисованные изображения можно вырезать и на нитке повесить на новогоднюю елку.
К 8 марта и 23 февраля
К этим датам дети могут сделать подарки своими руками. А основой открыток послужат именно рисунки по клеточкам.
Девочки, например, могут поздравить мальчиков открытками с изображениями техники (танки, самолеты, бронемашины), выполненными по клеточкам. Ребята легко нарисуют точечные картинки цветов, чтобы порадовать девочек.
Имена
Рисунки по клеточкам из самых простых подходящих для изображения в тетради – это имена, логотипы.
Они будут выглядеть более сложными, если украсить первую букву лозой вьющегося растения.
Выполняются такие рисунки карандашом, маркером, черной гелевой ручкой. Предварительный расчет клеточек можно не вести.
Про любовь
Нарисовать по клеточкам можно что-то из любовной тематики, например, изобразить сердечко, розу, стрелу амура. Эти сюжеты отлично подходят для поздравительных открыток ко Дню всех влюбленных. Можно использовать как готовые схемы, так и придумывать свои. Интересный вариант – целующиеся фигурки. Их можно сделать черно-белыми и украсить красным сердцем.
Губы
Изображаются чаще в цвете. Верхняя всегда темнее нижней из-за игры света – она остается в тени, поэтому используют разные оттенки одного тона.
Если нужно сделать изгиб, следует «утопить» губу под большим углом внутрь.Техника несложная, освоить ее может даже ребенок, но потребуется внимательность.
Аниме
Аниме включает различные направления, жанры, рассчитанные на любую возрастную категорию.
Рисунки по клеточкам в тетради сложные и простые выполняются чаще карандашом. К наиболее известным сюжетам относятся Naruto, монстр за соседней партой, мастер меча, Dragonball. Популярны разнообразные изображения кошачьих ушек – они подчеркивают невинность. Любимыми героями считаются также черный принц и волчица.
Майнкрафт
Начинать следует с перерисовки готовых шаблонов. Среди простых и сложных тем нужно выбрать первые. Практика копирования подготовит к изображению Майнкрафта на бумаге. После приобретения опыта можно брать в руки цветные карандаши и фантазировать на заданную тему. Вначале следует разобраться с композицией. Затем,соблюдая пропорции, считают клетки для закрашивания.
Рисунки в стиле Майнкрафт считаются уникальной возможностью совместить виртуальные образы с искусством.
Животные
Мир природы уместно изображать совместно с детьми. Мнение, что изобразить его на бумаге сложно, ошибочно. Достаточно найти простые рисунки любимых зверей.
Начиная творить, отсчитывают определенное число клеточек в нужную сторону. Количество закрашенных квадратиков должно четко соответствовать шаблону – не уменьшаться и не увеличиваться.
В противном случае изображение получится неестественным. Для старта отлично подойдут герои мультфильмов. Очень просто рисуются панда, пони, любопытный щенок, непоседливый котенок. Важно сохранять пропорции и перерисовывать рисунок внимательно.
Еда
Полет фантазии позволяет создать исключительные блюда на бумаге: сложные пирожные, многоярусные торты, гамбургеры, пиццу.
Необязательно иметь талант художника, чтобы создавать точечные картинки, достаточно найти картинки-образцы. Все сладкоежки могут рисовать мороженое, экспериментируя с формой, цветовой гаммой.
Цветы
Рисунки по клеточкам в тетради, сложные и простые в виде цветов,могут представлять собой оригинальный орнамент. Изображения растений также являются подходящим сюжетом для создания поздравительной открытки, приглашения на торжество.
Можно нарисовать тюльпаны, розы, ромашки как собранные в букеты, так и рассыпанные по всему полю листа.
Важно не отступать от схемы, чтобы правильно передать очертания каждого цветка. Для повторяющегося мотива отсчитывают необходимое число клеток. С цветовой палитрой можно экспериментировать.
Фрукты
Начиная с детского садика, детей следует научить изображать окружающий мир. Такое занятие формирует образное мышление, помогает быстрее запомнить названия предметов. Рисуя вместе с ребенком, следует помочь ему выбрать картинку для срисовывания.
Самым простым рисунком является изображение яблока. Если хочется его усложнить, нужно добавьте веточку и листок. Многие дети любят изображать фрукты, которые им нравятся на вкус. Так на бумаге появляются бананы, груши, апельсины, киви.
Мишки Тедди
Можно изобразить на бумаге мишек Тедди. Есть совсем простые эскизы, которые выглядят вполне эффектно. Начинать нужно с черно-белых рисунков – они самые простые.
Затем переходят к рисованию полноцветных мишек Тедди. Способов выполнения рисунков несколько.
Можно начинать с морды, затем переходить к рисованию тела и лап либо рисовать сначала одну половину мишки, затем добавлять вторую – в итоге получится симпатичный медвежонок. Создавая изображение, придется вести подсчет квадратиков в каждом ряду. Важно соблюдать последовательное изображение каждого ряда.
Для простого изображения подойдет обычный тетрадный лист, для более сложного понадобится миллиметровая бумага.
Смайлики
Рисование смайликов дается относительно просто, однако,вначале придется считать клетки, чтобы не наделать ошибок.
Рисунки по клеточкам в тетради можно рисовать в абсолютно любой тематике.
Впоследствии получится создавать изображения самостоятельно, опираясь лишь на фантазию.
Персонажи
Изображать любимых героев очень весело. Забавным получается добродушный любитель меда Винни Пух, крутыми и смешными – персонажи из мультфильма Гравити Фолз.
Определившись, какого размера будет рисунок, следует подобрать соответствующий лист бумаги в клетку. Если изображение будет большим, следует начать от края листа, чтобы оно полностью поместилось.
Когда техника рисования по клеточкам будет освоена, сложные схемы, предварительно сделанные в тетради, будут не нужны. Особенно удавшиеся изображения можно поместить в рамочку.
Видео: рисунки по клеточкам в тетради
Как рисовать по клеточкам, смотрите в видео-ролике:
Рисуем по клеточкам: крутые пиксельные очки в видео:
Не каждому удалось окончить художественную школу, чтобы научиться технике рисования. Если хотите сделать креативную открытку или заполнить дневник оригинальными рисунками, освойте рисование по клеточкам. Маленькие картинки по клеточкам смогут сделать даже новички. Главное, купить тетрадку для математики со светлой бумагой.
Как рисовать по клеточкам
Многие любят разгадывать японские кроссворды, в основу которых положено рисование по клеточкам.
Если у вас есть готовые разгаданные кроссворды или ответы к ним, то сможете просто перерисовать в свою тетрадку большие фигуры.
Самый хороший способ использовать готовые схемы, которые были специально разработаны для тех, кто не умеет рисовать. Вы можете закрашивать по схеме клеточки в собственной тетради, а потом удивлять красивыми изображениями близких и родных.
Среди шаблонов вы найдете
Оригинально смотрятся фрукты по клеточкам . Если хорошо закрасить рисунок яркими фломастерами, то потом можно его вырезать и использовать для декора интерьера или украшения аппликации.
Хотите сделать открытку или описать в своем дневнике романтическую историю, тогда нарисуйте сердечко по клеткам.
Конфетки, букетики, цветочки – все это можно нарисовать по клеточкам.
Если вы освоите принцип, то потом сможете изображать все, что угодно в своей собственной тетради.
Хотите придумать свой собственный рисунок? Тогда сделайте легкую зарисовку, а потом начинайте превращать ее в рисунок по клеточкам.
Начинать лучше всего с контура. Потом можете выделять мелкие детали. Не забудьте отметить, каким цветом, какая деталь должна быть выделена, чтобы рисунок получится ярким и красивым.
3D-рисунки по клеточкам – это хороший способ провести интересно досуг и реализовать свои творческие способности.
Вы еще ни разу не рисовали по клеточкам? Тогда обязательно попробуйте. Это занятие придется по душе как маленьким детям, так и взрослым. Специалисты отметили, что это хобби развивает творческое мышление, координацию движений при письме, концентрацию внимания и логику. Проводите досуг с пользой, выдумывая новые 3Д схемы простые и сложные для рисования по клеточкам.
Сложный рисунок по клеточкам
Предлагаем фото нескольких популярных схем для начинающих
Хотите научиться рисовать любимых персонажей мультфильмов? Тогда смелее открывайте рисунки по клеточкам панда. Озорной, весёлый, неуклюжий, задумчивый или воинс.
Всегда найдутся маленькие сластёны, которые обожают придумывать необычные виды десертов. Развивайте этот талант в ребёнке, помогая освоить рисунки по клеточкам…
Кошечки, собачки, медведи и другие пушистые представители животного мира так и просятся стать сюжетом детского рисунка. Чтобы научиться реалистично изображать л…
Для поднятия настроения друзьям и близким, создания красивой поздравительной открытки существуют рисунки по клеточкам смайлики. Научиться этому искусству сможет…
Нравится придумывать новые блюда, необычно украшенные торты, экзотические фрукты и другие вкусности? Всё, что готова создать ваша фантазия, легко уместиться на…
Не отставайте от своих сверстников, скорее учитесь рисовать картинки по клеточкам Майнкрафт. Придумайте свою художественную историю этой увлекательной игры.
Воз…
Чтобы не было скучно на переменках или в поездке, научитесь рисовать по клеточкам Майнкрафт. Изображение главных героев, локаций, домов и других объектов на бум…
Всем маленьким поклонникам компьютерных игр наверняка интересно как нарисовать по клеточкам Майнкрафт. Не всегда есть возможность воспользоваться планшетом для…
Видели, как увлечённо ваши одноклассники создают рисунки по клеточкам Майнкрафт? Немного усидчивости, фантазии и на бумаге появляется новый герой игры, заполнен…
Играть в развивающие компьютерные игры, такие как Майкрафт – это очень интересно. Дети могут часами просиживать в ней. Никто не откажется от возможности поискат…
Красивые узоры по клеточкам — 84 фото
Узоры по клеточкам
Рисунок крестиком на бумаге в клеточку
Узоры ручкой в тетради по клеточкам
Рисунки в клеточку маленькие легкие
Красивые узоры по клеточкам
Клеточные узоры в тетради
Необычные узоры по клеточкам
Симметричное рисование по клеткам
Рисование по клеточкам в тетради узоры
Геометрические узоры по клеточкам
Рисунки по клеточкам косички
Математический орнамент
Узоры по клеточкам в тетради
Геометрические фигуры по клеточкам
Узоры для рисования по клеткам
Узоры по клеточкам в тетради
Орнамент на полях тетради
Узоры по клеточкам в тетради
Узоры по клеточкам цветные
Рисунки по клеточкам в тетради приложения
Геометрические узоры по клеточкам красивые и сложные
Косички по клеточкам
Узоры по клеточкам для детей
Узоры по клеточкам в тетради
Геометрические узоры по клеточкам
Геометрические орнаменты по клеткам
Сложные орнаменты по клеточкам
Рисование по клеточкам узоры сложные
Узоры в клеточку в тетради
Рисунки по клеточкам в тетради ручкой
Узоры по клеточкам в тетра
Жаккард раппорт 10 петель
Узоры по клеточкам в тетради
Геометрические узоры схемы
Задания на симметрию для дошкольников
Рисунки по клеточкам ручкой
Монохромная вышивка крестом
Узоры по клеточкам в тетради
Узоры по клеточкам
Картинки по клеткам
Узоры по клеточкам для вязания
Красивые геометрические фигуры по клеткам
Косичка на тетради в клетку
Узоры в клеточку для дошкольников
Кельтские узоры в тетради
Узоры по клеточкам для дошкольников
Орнамент ручкой в тетради
Фигуры в клеточках для дошкольников
Геометрические узоры по клеточкам
Рисунки по клеточкам в тетради флаги
Узоры по клеточкам в тетради
Узоры по клеточкам в тетради
Узоры по клеткам для детей
Узоры по клеточкам в тетради
Блэкворк вышивка орнамент
Узоры на листе в клетку
Узоры по клеточкам в тетради
Узоры на листе бумаги
Узоры по клеточкам
Клетка узор
Рисунки половинки по клеточкам
Узоры по клеточкам цветные
Геометрические узоры в тетради в клетку
Узоры по клеточкам в тетра
Рисунки по клеточкам Стикеры маленькие
Узоры по клеточкам в тетради
Математический узор по клеткам
Узоры по клеточкам в тетради сложные геометрические
Орнамент по клеточкам в тетради
Узоры в тетради в клетку сложные
Узоры в клеточку в тетради
Сложные узоры по клеткам
Симметричный орнамент по клеточкам
Орнамент на полях тетради
Узоры по клеточкам
Монохромная вышивка
Узоры по клеточкам в тетради
Узоры для рисования по клеткам
Симметричное рисование по клеткам
Узоры в тетради в клетку
Графические узоры по клеткам
Сложные орнаменты по клеточкам
ФАНТОМ — ФАНТОМ5
Сравнительная транскриптомика первичных клеток позвоночных
Мы сравниваем данные транскриптома соответствующих типов первичных клеток человека, мыши, крысы, собаки и курицы.
Хотя мы обнаружили, что транскриптом, измеренный с помощью CAGE для одного и того же типа клеток, заметно различается между видами, мы определили основную регуляторную сеть, определяющую каждый тип клеток, который является общим для разных видов. В целом было обнаружено, что гены, кодирующие продукты, участвующие в биологии РНК в клеточном ядре, постоянно активируются в клетках одного и того же типа независимо от вида.
Алам Т. и др. Исследование генома
DOI: 10.1101/gr.255679.119
Интегрированный атлас экспрессии микроРНК и их промоторов у человека и мыши
С помощью секвенирования короткой РНК и анализа экспрессии генов (CAGE) мы создали профили экспрессии зрелых микроРНК и их первичных транскриптов в большой коллекции первичных типы клеток. CAGE также позволила нам составить карту их промоутеров. Мы показываем, что промоторы miRNA высококонсервативны, что профили экспрессии зрелого и первичного транскриптов коррелируют и что miRNA, происходящие из одного и того же полицистрона, сильно коррелируют.
Мы представляем данные в виде веб-ресурса для исследовательского сообщества.
Де Рие Д. и др. Природные биотехнологии
DOI: 10.1038/nbt.3947
Полный текст
Атлас длинных некодирующих РНК человека с точными 5′-концами
Ведутся острые споры о том, являются ли тысячи длинных некодирующих РНК, транскрибированных из наших геномов, функциональными или просто побочными продуктами шумной транскрипционной машины. Ученые из консорциума FANTOM5, возглавляемого RIKEN, использовали технологию, известную как Cap-анализ экспрессии генов (CAGE), для создания атласа длинных некодирующих РНК человека с точными 5’-концами и обобщили характер их экспрессии в основных типах клеток. В работе, опубликованной в Nature, они сопоставили этот атлас экспрессии с другими наборами генетических и геномных данных и предположили, что многие из этих длинных некодирующих РНК могут быть функциональными.
Достопочтенный С.и др. Природа
DOI: 10.1038/nature21374
Полный текст
и др. Природа Транскрибируемые энхансеры опережают волны скоординированной транскрипции в переходных клетках млекопитающих.
Используя тот факт, что активные промоторы и энхансеры транскрибируются, мы одновременно измерили их активность в 19 временных циклах человека и 14 мышей, охватывающих широкий спектр типов клеток и биологических стимулов. Наш анализ предлагает весьма обобщаемую модель, в которой транскрипция энхансера является самым ранним событием в последовательных волнах транскрипционных изменений во время клеточной дифференцировки или активации.
Арнер Э. и др. Наука
DOI: 10.1126/наука.1259418
Полный текст
Атласы промоторов и энхансеров на всем теле человека
Плотность промоторов (синий) и энхансеров (красный) на хромосомах человека. Хромосома 5 увеличена, демонстрируя специфичность/экспрессию промотора (розовый/желтый внешний слой), соответствующие данные энхансера (внутренние слои) и взаимодействия энхансер-промотор (синий).
Кластеры коэкспрессии между промоторами показаны цветными линиями между хромосомами.
Изображение Робина Андерссона и Альбина Санделина
Атлас экспрессии млекопитающих на промоторном уровне.
Кэп-анализ экспрессии генов (CAGE) в большой коллекции первичных типов клеток показал, что многие промоторы млекопитающих представляют собой составные объекты, состоящие из нескольких близко разделенных TSS с независимыми профилями экспрессии, характерными для определенного типа клеток. Атлас экспрессии, ориентированный на промотор FANTOM5, предоставляет профили экспрессии для большинства кодирующих и некодирующих транскриптов в геномах человека и мыши.
Форрест, А.Р.Р. и другие. Природа
DOI: 10.1038/nature13182
Атлас активных усилителей в организме человека.
Энхансеры контролируют правильную временную и специфичную для типа клеток активацию экспрессии генов.
Мы составили атлас активных энхансеров для большинства тканей и типов клеток человека. Атлас используется для сравнения регуляторных программ между различными клетками, для выявления связанных с заболеванием регуляторных одиночных нуклеотидных полиморфизмов, а также для классификации специфичных для клеточного типа и вездесущих энхансеров.
Андерссон Р. и соавт. Природа
DOI: 10.1038/nature12787
Новое определение транскриптома тучных клеток человека путем глубокого секвенирования.
Используя свежевыделенные тучные клетки (ТК), полученные из кожи, FANTOM5 дает полное представление о транскриптоме ТК человека. Тучные клетки уникальны в гемопоэтической линии и лишь отдаленно связаны с базофилами. Мы также показываем, что тучные клетки экспрессируют рецепторы BMP и что BMP могут способствовать выживанию и восстановлению при стимуляции тучных клеток человека.
Мотакис, Э. и др. Кровь
DOI: 10.
1182/кровь-2013-02-483792Профилирование транскрипции и энхансера в субпопуляциях моноцитов человека.
Комплементарный CAGE и эпигенетическое профилирование анализируют различия между тремя основными субпопуляциями моноцитов человека. Это исследование FANTOM5 подчеркивает дифференциальное использование генов, факторов транскрипции и энхансеров, а также выявляет ранее неизвестные метаболические различия между субпопуляциями.
Шмидл, К. и соавт. Кровь
DOI: 10.1182/кровь-2013-02-484188
Ландшафт энхансеров и промоторов регуляторных и обычных субпопуляций Т-клеток человека.
Их способность предотвращать иммунные реакции делает регуляторные Т-клетки (Treg) очень интересными для клинического применения. В этом исследовании FANTOM5 исследуются сети факторов транскрипции в наивных Treg и Treg памяти, а также в их традиционных аналогах Т-клеток (Tconv) как до, так и после экспансии in vitro, и показано, что Treg, экспансированные in vitro, не резко меняют свой репертуар Treg-специфических эффекторных молекул.
Шмидл, К. и соавт. Кровь
DOI: 10.1182/кровь-2013-02-486944
Анализ метилома и транскриптома ДНК при гранулопоэзе выявляет временные изменения и динамическое метилирование энхансера
В целом это исследование подробно описывает эпигенетические и транскрипционные изменения, происходящие во время гранулопоэза, и поддерживает роль метилирования ДНК как регуляторного механизма дифференцировки клеток крови . Мы показываем, что метилирование меняется на определенных стадиях дифференцировки и перекрывается с активностью ключевых гемопоэтических транскрипционных факторов. Кроме того, дифференциально метилированные сайты были чрезмерно представлены в энхансерных элементах и обогащены энхансерами, которые становятся активными во время дифференцировки.
Рённерблад и др. Кровь
DOI: 10.1182/кровь-2013-02-482893
Высокопроизводительное профилирование транскрипции идентифицирует предполагаемые эпигенетические регуляторы гемопоэза
Программа транскрипции, определяющая судьбу и дифференцировку гемопоэтических клеток, требует функции эпигенетической памяти, обеспечиваемой сетью эпигенетических факторов, регулирующих метилирование ДНК, посттрансляционные модификации гистонов и структуру хроматина.
Чтобы выяснить вклад различных эпигенетических факторов в кроветворение человека, был использован высокопроизводительный кэп-анализ экспрессии генов для построения профилей транскрипции 199 эпигенетических факторов в широком спектре клеток крови.
Прасад и др. Кровь
DOI: 10.1182/кровь-2013-02-483537
Сравнение профилирования транскриптома CAGE и RNA-seq с использованием клонально амплифицированного и одномолекулярного секвенирования нового поколения из двух линий клеток человека для проверки способности различать биологические состояния, обнаружения дифференциально экспрессируемых генов, линейности измерений, а также воспроизводимости количественного определения. Результат дает представление о производительности этих платформ, которые станут основой для разработки дальнейших экспериментов по изучению сложных транскриптомов, обнаруженных в широком диапазоне типов клеток.
Кавадзи и др.
DOI: 10.1101/gr.156232.113
Исследование генома Дифференциальная роль эпигенетических изменений и экспрессии Foxp3 в регуляторной Т-клеточной специфической регуляции транскрипции.
Регуляторные Т-клетки (Treg), которые специфически экспрессируют транскрипционный фактор Foxp3, участвуют в поддержании иммунологической самотолерантности и гомеостаза. Анализ данных FANTOM5 CAGE с данными эпигенома, включая метилирование ДНК и сайты связывания факторов транскрипции, показывает, что деметилирование, специфичное для Treg, и Foxp3, по-видимому, играют разные, но дополняющие друг друга роли в регуляции специфичных для Treg генов.
Морикава Х. и др. Proc Natl Acad Sci USA.
DOI: 10.1073/pnas.1312717110
Эволюция клеток человека с точки зрения белковых инноваций
Комбинируя данные FANTOM5 CAGE и аннотацию белковых доменов, мы можем получить представление о том, как эволюционировали различные типы клеток.
Мы можем идентифицировать известные эволюционные события, а также выделять другие новые события, которые до сих пор оставались незамеченными.
Сардар, А.Дж. и соавт. Молекулярная биология и эволюция
DOI: 10.1093/molbev/mst139
Интерактивная визуализация и анализ крупномасштабных наборов данных NGS с использованием ZENBU.
Протоколы секвенирования следующего поколения, такие как RNA-seq, ChIP-seq, DHS-seq и CAGE, в больших коллекциях образцов позволяют получить множество данных для выяснения функции генома. Чтобы облегчить интерактивное сравнение результатов тысяч экспериментов NGS, мы представляем ZENBU, веб-приложение, объединяющее интеграцию и анализ данных в браузере генома с расширенными возможностями экспрессии генов и эпигеномной визуализации.
Северин, Дж. и соавт. Природная биотехнология
DOI: 10.1038/nbt.2840
Транскрипционное профилирование семейства генов фибриллина/LTBP человека, ключевых регуляторов функций мезенхимальных клеток.
Фибриллины и белки, связывающие латентный трансформирующий фактор роста (LTBP), образуют суперсемейство белков, участвующих в структуре внеклеточного матрикса и контролирующих биодоступность членов семейства TGFβ. Мы представляем исследование сайтов начала транскрипции, которое предполагает, что этот важный класс белков внеклеточного матрикса подвержен тонким регуляторным вариациям, которые объясняют дифференциальную роль членов этого семейства генов.
Дэвис, М.Р. и соавт. Молекулярная генетика и метаболизм
DOI: 10.1016/j.ymgme.2013.12.006
Объяснение корреляций между свойствами промоторов млекопитающих
Промоторы имеют загадочные различия в CpG-богатстве, сигналах ТАТА, эволюционной консервации, специфичности экспрессии и хромосомном распространении сайтов начала транскрипции. Мы предупреждаем о предвзятости при измерении этих свойств, показываем, что большинство промоторов имеют довольно неспецифическую экспрессию, и даем простые объяснения корреляции между свойствами.
Frith, M.C. и соавт. Исследование нуклеиновых кислот
DOI: 10.1093/нар/гку115
CAGExploreR: пакет R для анализа и визуализации динамики промотора в нескольких экспериментах.
CAGExploreR — это пакет R, который облегчает обнаружение и визуализацию изменений относительной транскрипции из промоторных областей в мультипромоторных генах, все в контексте общей экспрессии генов. Одновременно можно сравнивать несколько образцов. В первую очередь основано на определениях набора промоторов FANTOM5, однако также могут использоваться другие регионы, такие как MPromDb или пользовательские регионы.
Даймонт, Э. и др. Биоинформатика
DOI: 10.1093/биоинформатика/btu125
Церулоплазмин представляет собой новый адипокин, который сверхэкспрессируется в жировой ткани людей с ожирением и в раковых клетках, связанных с ожирением.
Ожирение повышает риск развития определенных форм рака.
Повышенная секреция адипокинов жировыми клетками может способствовать развитию злокачественных опухолей при ожирении через тканевые перекрестные помехи. Мы обнаружили, что экспрессия церулоплазмина (CP) сильно повышена при раке, связанном с ожирением, и в жировой ткани людей с ожирением. Мы продемонстрировали, что CP является новым адипокином с повышенной продукцией и секрецией при ожирении.
Арнер, Э. и др. ПЛОС ОДИН
DOI: 10.1371/journal.pone.0080274
Влияние метилирования цитозина на сайты связывания факторов транскрипции
Метилирование 16% отдельных CpG отрицательно коррелирует с соседней экспрессией TSS. Мы наблюдали отбор против этих CpG в сайтах связывания факторов транскрипции (TFBS), который был сильнее для репрессоров, чем для активаторов, а также для основных положений TFBS, чем для фланкирующих. Мы предположили, что селективное метилирование TFBS, предотвращающее связывание факторов транскрипции, ограничено особыми случаями и не может быть глобальным механизмом регуляции транскрипции.
Медведева Ю.А. и другие. Геномика ВМС
DOI: 10.1186/1471-2164-15-119
Состояния хроматина выявляют функциональные ассоциации для глобально определенных стартовых сайтов транскрипции в четырех клеточных линиях человека
Расшифровка наиболее распространенных способов, с помощью которых хроматин регулирует транскрипцию, является важной задачей для улучшения нашего понимания клеточной биологии человека. Транскрипционные данные FANTOM5 представляют собой интегрированные данные проекта ENCODE для характеристики особенностей хроматина вокруг экспрессируемых и репрессированных стартовых сайтов транскрипции в четырех линиях клеток человека.
Рай М. и соавт. Геномика BMC
DOI: 10.1186/1471-2164-15-120
‹›
Знакомство с FANTOM5
Мы сложные многоклеточные организмы, состоящие примерно из 400 различных типов клеток.
Это разнообразие типов клеток позволяет нам видеть, думать, слышать, бороться с инфекциями и т. д., но все это закодировано в одном и том же геноме. Разница между всеми этими клетками заключается в том, какие части генома они используют — например, нейроны используют другие гены, чем мышечные клетки, и поэтому они работают совершенно по-разному. В FANTOM5 мы систематически исследовали, какие именно наборы генов используются практически во всех типах клеток человеческого тела, а также области генома, которые определяют, откуда считываются гены. Мы стремимся использовать эту информацию для построения моделей регуляции транскрипции для каждого первичного типа клеток, составляющих человека.
FANTOM5 Phase 2
Используя всесторонний анализ экспрессии РНК в различных типах клеток, ученые из консорциума FANTOM5 под руководством RIKEN добились больших успехов в решении выдающейся загадки биологии. В работе, опубликованной в журнале Science, они показали, что когда клетки претерпевают изменения фенотипа, такие как дифференцировка в специализированные типы клеток, первоначальная активация происходит в областях ДНК, называемых энхансерами, типа регуляторных «переключателей», которые обычно расположены далеко от генов, которые они активируются.
FANTOM5 Фаза 1
С помощью анализа экспрессии генов (CAGE) мы картировали наборы транскриптов, факторов транскрипции, промоторов и энхансеров, активных в большинстве типов первичных клеток млекопитающих, а также в ряде линий раковых клеток и тканей, который описан в двух знаковых статьях в Nature. Около 30 публикаций проекта охватывают такие разнообразные области, как первичные клетки, семейства генов, полногеномные наблюдения за особенностями промотора и новые инструменты биоинформатики.
Предоставляется сборник статей FANTOM5, опубликованных в Nature Publishing Group (NPG).
ссылки быстрого доступа | |||
|---|---|---|---|
| организм | атлас | инструменты | файлы данных |
| человек | Атлас промоутера Атлас Enhancer днРНК атлас атлас микроРНК Сотовый коннектом | Zenbu ТЕТ БиоМакет Биомарт Браузер генома UCSC | Исходные данные Промотор (пики CAGE) Усилитель |
| мышь | Атлас промоутера атлас микроРНК | Zenbu ТЕТ Биомарт Браузер генома UCSC | Необработанные данные Промотор (пики CAGE) Усилитель |
| крыса | Атлас промоутера атлас микроРНК | Зенбу ТЕТ Браузер генома UCSC | Исходные данные Промотор (пики CAGE) |
| собака | Атлас промоутера атлас микроРНК | ТЕТ Браузер генома UCSC | Исходные данные Промотор (пики CAGE) |
| курица | Атлас промоутера атлас микроРНК | Зенбу Браузер генома UCSC | Исходные данные Промотор (пики CAGE) |
| макака-резус | Атлас промоутера | Зенбу Браузер генома UCSC | Исходные данные Промотор (пики CAGE) |
Теперь доступны различные ресурсы для доступа к данным FANTOM5.
Zenbu. . Система визуализации первичных данных для FANTOM5. Прямые ссылки для просмотра промодрома FANTOM5: hg19 и mm9. Прямые ссылки для просмотра таймкурса FANTOM5: hg19и mm9
SSTAR
(Семантический каталог образцов, инициации транскрипции и правил) Интерфейс для изучения типа клеток, специфических аннотаций, мотивов и факторов транскрипции кластера коэкспрессии. Сводка примеров временного хода FANTOM5.
Браузер FANTOM CAT
Веб-приложение позволяет пользователям просматривать гены, просматривать их геномные локусы через ZENBU, фильтровать по их аннотациям, пересекать их с соответствующими образцами онтологий или признаков и загружать соответствующие данные.
Атлас микроРНК FANTOM5
Интегрированный атлас экспрессии микроРНК FANTOM5 показывает профили экспрессии микроРНК путем секвенирования библиотек коротких РНК, полученных из образцов человека, мыши, крысы, собаки и курицы. Можно визуализировать как профиль экспрессии sRNA зрелой miRNA, так и профиль экспрессии CAGE связанного с ней промотора.
Обогащенные и обедненные категории онтологии клеток показаны для каждой микроРНК, чтобы обобщить профиль экспрессии.
Визуализация клеточного коннектома
Мы построили карту передачи сигналов между 144 основными типами первичных клеток человека, связанными посредством взаимодействующих пар секретируемых лигандов и рецепторов клеточной поверхности. Наш инструмент визуализации показывает, какие лиганды/рецепторы присутствуют в данных клетках и какие клетки связаны друг с другом взаимодействующими парами. Данные также доступны для скачивания.
Файлы
Выбранные файлы данных для FANTOM5. В качестве альтернативы вы можете просмотреть файловый сервер данных непосредственно по адресу http://fantom.gsc.riken.jp/5/datafiles/
TET
Система для извлечения подмножеств данных из выбранных файлов данных FANTOM5, включая таблицы выражений фазы 1 и фазы 2.
Расшифрованный атлас энхансеров
База данных, описывающая области энхансеров с образцами по всему телу человека.
Дополнительные релевантные ссылки
BioMart, база метаданных RIKEN, нанопубликации и FANTOM5 BioLayout.Как цитировать
В дополнение к соответствующим документам, пожалуйста, укажите следующий документ для использования данных, полученных с этого сайта:Лицио М. и др. Пути к атласу экспрессии млекопитающих на уровне промотора FANTOM5. Геном Биол 16: 22 (2015). 10.1186/s13059-014-0560-6
Абугессаиса I и др. FANTOM исполняется 20 лет: расширение транскриптомных атласов и функциональная аннотация некодирующих РНК. Nucleic Acids Res 49: D892–D898 (2021). 10.1093/нар/гкаа1054
Publications — Baker Lab
Препринты доступны на сайте bioRxiv.
F ROM THE LAB COLLABORATOR LED F ROM THE LAB Andrew C. Hunt, James Brett Case, Young-Jun Park, Longxing Cao, Kejia Wu, Alexandra C Уоллс, Чжуомин Лю, Джон Э.
Боуэн, Сянь-Вэй Йе, Шалли Сайни, Луиза Хелмс, Ян Тин Чжао, Тянь-Ин Сян, Тайлер Н. Старр, Инна Горешник, Лиза Козодой, Лорен Картер, Рашми Равичандран, Лидия Б. , Грин, Вадим Л. Маточко, Кристи А. Томсон, Бастиан Фогели, Антье Крюгер, Лаура А. ВанБларган, Рита Э. Чен, Баолин Ин, Адам Л. Бейли, Наташа М. Кафаи, Скотт Э. Бойкен, Аяся Любетич, Наташа Эдман, Джордж Уэда, Кэмерон М. Чоу, Макс Джонсон, Амин Аддетия, Мэри Джейн Наварро, Нуттада Панпрадист, Майкл Гейл, Бенджамин С. Фридман, Джесси Д. Блум, Ханнеле Руохола-Бейкер, Шон П. Дж. Уилан, Лэнс Стюарт, Майкл С. Даймонд, Дэвид Вислер, Майкл С. Джуэтт, Дэвид Бейкер
Поливалентные разработанные белки нейтрализуют вызывающие озабоченность варианты SARS-CoV-2 и обеспечивают защиту от инфекции у мышей. Статья журнала
В: Science Translational Medicine, 2022. , Пак, Джун Сон, Джуд, Кевин М., Маркович, Ива, Кадам, Рамешвар У., Вершурен, Коэн Х.Г., Верстрате, Кеннет, Уолш, Скотт Томас Рассел, Беннетт, Натаниэль, Пхал, Ашиш, Ян, Аэрин, Козодой , Лиза, ДеВитт, Мишель, Пиктон, Лора, Миллер, Лорен, Штраух, Ева-Мария, ДеБувер, Николас Д.
, Пирес, Эллисон, Бера, Асим К., Халабия, Самер, Хаммерсон, Брэдли, Ян, Вей, Бернард , Штеффен, Стюарт, Лэнс, Уилсон, Ян А., Руохола-Бейкер, Ханнеле, Шлессингер, Джозеф, Ли, Сангвон, Саввидес, Саввас Н., Гарсия, К. Кристофер, Бейкер, Дэвид
Дизайн белок-связывающих белков только из структуры-мишени Журнальная статья
В: Nature, 2022.
COLLABORATOR LED, Николас, Роклин, Габриэль Дж., Чоу, Камерон М., Рой, Аниндя, Бера, Асим К., Мотта, Фрэнсис С., Цао, Лонгсин, Штраух, Ева-Мария, Чидяусику, Тамука М., Форд, Алекс , Хо, Итан, Зайцев, Александр, Маккензи, Крейг О., Эрамиан, Хамед, ДиМайо, Фрэнк, Григорян, Геворг, Вон, Мэтью, Стюарт, Лэнс Дж., Бейкер, Дэвид, Клавинс, Эрик
Крупномасштабный дизайн и уточнение стабильных белков с использованием моделей, основанных только на последовательностях. Статья журнала
В: PLoS ONE, 2022.
ИЗ ЛАБОРАТОРИИ Курбе, Алексис, Норрис, Эндрю, Буш, Флориан, Сахасрабуддхе, Анируддха, Мертен, Ханнес, Сахто, Дэнни Д.
, Уэда, Джордж, Фальяс, Хорхе А., Уивер, Сара Дж., Ся, Ян, Ланган, Роберт А. ., Плуктун, Андреас, Высоцки, Вики Х., Вислер, Дэвид, Дженсен, Грант Дж., Бейкер, Дэвид
Создание упорядоченных белковых сборок с использованием жесткого слияния трех тел Журнальная статья
В: Proceedings of the National Academy of Sciences, vol. 118, нет. 23, 2021.
Дивайн, Робби, Данг, Ха В., Уэда, Джордж, Фальяс, Хорхе А., Вулович, Иван, Шеффлер, Уильям, Сайни, Шалли, Чжао, Ян Тинг, Радж, Инфенсия Ксавьер, Моравски, Питер А., Дженневейн, Мадлен Ф., Хомад, Леа Дж., Ван, Ю-Хсин, Тули, Марти Р., Сигер, Франциска, Этемади, Али, Фанинг, Митчелл Л., Лазаровиц, Джеймс, Редерер, Алекс, Уоллс, Александра С., Стюарт, Лэнс, Мазлуми, Мохаммадали, Кинг, Нил П., Кэмпбелл, Дэниел Дж., Макгуайр, Эндрю Т., Стамататос, Леонидас, Руохола-Бейкер, Ханнеле, Матье, Джули, Визлер, Дэвид, Бейкер, Дэвид
Сконструированные белки собирают антитела в модульные наноклетки. Статья в журнале
В: Science, vol.
372, нет. 6537, 2021.
Воробьева Анастасия А., Уайт, Пол, Лян, Биньонг, Хорн, Джим Э., Бера, Асим К., Чоу, Камерон М., Гербен, Стейси, Маркс, Синдуджа, Канг, Алекс, Стивинг, Алисса К., Харви, Софи Р., Маркс, Даган К., Хан, Г. Насир, Флеминг, Карен Г., Высоцки, Вики Х., Брокуэлл, Дэвид Дж., Тамм, Лукас К., Рэдфорд, Шина Э., Бейкер, Дэвид
Дизайн трансмембранных бета-баррелей de novo Статья в журнале
В: Наука, вып. 371, нет. 6531, 2021.
ПОДДЕРЖКА СОТРУДНИКОВ ИЗ ЛАБОРАТОРИИУеда, Джордж, Антанасиевич, Александр, Фальяс, Хорхе А., Шеффлер, Уильям, Коппс, Джеффри, Хатчинсон, Дэниэл, Бчинлис, , Адам, Ясмин, Анила, Цыбовский, Ярослав, Пак, Янг-Джун, Бик, Мэтью Дж., Санкаран, Банумати, Гиллеспи, Ребекка А., Брауэр, Филип Дж. М., Зварт, Питер Х, Вислер, Дэвид, Канекиё, Масару, Грэм , Барни С., Сандерс, Роджер В., Мур, Джон П., Классе, Пер Йохан, Уорд, Эндрю Б., Кинг, Нил П., Бейкер, Дэвид
Индивидуальный дизайн каркасов белковых наночастиц для мультивалентной презентации вирусных гликопротеиновых антигенов Статья журнала
В: eLife, vol.
9, стр. e57659, 2020.
Чен, Цзыбо, Киблер, Райан Д., Хант, Эндрю, Буш, Флориан, Перл, Джоселинн, Цзя, Мэнсюан, Ван Эрнум, Закари Л., Вики, Бэзил И. М., Додс, Гален , Ляо, Ханна, Уилкен, Мэтью С., Сиарло, Кристи, Грин, Шон, Эль-Самад, Хана, Стаматояннопулос, Джон, Высоцки, Вики Х., Джуэтт, Майкл С., Бойкен, Скотт Э., Бейкер, Дэвид
Дизайн белковых логических вентилей de novo Журнальная статья
В: Science, vol. 368, нет. 6486, стр. 78-84, 2020.
СОВЕТНИК СОВЕТНИК ИЗ ЛАБОРАТОРИИБойкен, Скотт Э., Бенхейм, Марк А., Буш, Флориан, Цзя, Мэтью Дж., Бик , Чой, Хиджун, Клима, Джейсон С., Чен, Цзыбо, Уолки, Карл, Милеант, Александр, Сахасрабуддхе, Анируддха, Вей, Кэти Ю., Ходж, Эдгар А., Байрон, Сара, Киджано-Рубио, Альфредо, Шанкаран , Банумати, Кинг, Нил П., Липпинкотт-Шварц, Дженнифер, Высоцки, Вики Х., Ли, Келли К., Бейкер, Дэвид
De novo дизайн настраиваемых конформационных изменений, зависящих от pH Журнальная статья
В: Science, vol.
364, нет. 6441, стр. 658-664, 2019.
Шен, Хао, Фальяс, Хорхе А., Линч, Эрик, Шеффлер, Николас, Дженнетти Брэдли, , Декарро, Джастин, Вагенбах, Майкл, Висенте, Хуан Жезус, Чен, Цзяцзюнь, Ван, Лэй, Даулинг, Куинтон, Обердорфер, Густав, Стюарт, Лэнс, Вордеман, Линда, Де Йорео, Джеймс, Джейкобс-Вагнер, Кристин, Коллман , Джастин, Бейкер, Дэвид
Разработка de novo самособирающихся спиральных белковых филаментов Журнальная статья
В: Science, vol. 362, нет. 6415, стр. 705–709, 2018 г., ISSN: 0036-8075.
Соавтором LED Все бумаги437 Записи «1 из 15› »
2017
, strauch Питер С., Андерсон, Кейтлин Э., Ньесма, Трэвис, Холштейн, Карли А., Гарсия, Натали К., Хупер, Кэтрин А., Равичандран, Рашми, Нельсон, Йорген В., Шеффлер, Уильям, Блум, Джесси Д., Ли, Келли К., Уорд, Эндрю Б., Ягер, Пол, Фуллер, Дебора Х.